26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3549 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3549  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  268  2e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000882166  normal  0.578454 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3027  hypothetical protein  87.88 
 
 		 132 aa  237  2.9999999999999997e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00669531  normal  0.374075 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0378  hypothetical protein  55.93 
 
 		 124 aa  140  8e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000129839  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0388  hypothetical protein  52.85 
 
 		 126 aa  139  9e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0982  hypothetical protein  49.23 
 
 		 138 aa  133  7.000000000000001e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0889  transcriptional regulator, TrmB  51.43 
 
 		 130 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.119653  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0404  hypothetical protein  43.44 
 
 		 129 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  unclonable  0.000000000144174  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1949  hypothetical protein  46.02 
 
 		 137 aa  106  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1951  hypothetical protein  44.72 
 
 		 133 aa  100  5e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0547  transcriptional regulator, TrmB  44.35 
 
 		 120 aa  98.2  3e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1387  transcriptional regulator, TrmB  39.17 
 
 		 126 aa  98.2  4e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1131  transcriptional regulator, TrmB  41.67 
 
 		 129 aa  97.4  6e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0618637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0917  transcriptional regulator, TrmB  40.83 
 
 		 124 aa  96.7  9e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000000063679  hitchhiker  0.000000000488515 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2262  hypothetical protein  41.38 
 
 		 116 aa  96.7  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2849  hypothetical protein  43.36 
 
 		 129 aa  95.5  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0489802  hitchhiker  0.00628176 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0584  transcriptional regulator, TrmB  33.59 
 
 		 131 aa  89.4  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000212991  normal  0.151075 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1686  hypothetical protein  40.71 
 
 		 121 aa  82.8  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1859  hypothetical protein  35.83 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0870058  normal  0.527414 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0497  hypothetical protein  33.33 
 
 		 130 aa  72  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.057831  normal  0.47226 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0777  hypothetical protein  34.95 
 
 		 128 aa  70.9  0.000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.572189  normal  0.185879 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0575  hypothetical protein  33.01 
 
 		 129 aa  68.2  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.14645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0588  hypothetical protein  31.48 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.490183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1188  transcriptional regulator, TrmB  28.07 
 
 		 353 aa  42.7  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0102771  hitchhiker  0.00221829 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0352  transcriptional regulator, TrmB  30 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00150887 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0484  transcriptional regulator, TrmB  30 
 
 		 135 aa  40.8  0.007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.615252  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1567  transcriptional regulator, TrmB  30 
 
 		 135 aa  40.4  0.009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>