22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0889 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0889  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 130 aa  258  2e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.119653  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0982  hypothetical protein  52.78 
 
 		 138 aa  120  8e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0388  hypothetical protein  49.18 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1131  transcriptional regulator, TrmB  50.89 
 
 		 129 aa  119  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0618637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1387  transcriptional regulator, TrmB  50 
 
 		 126 aa  118  3e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0404  hypothetical protein  54.81 
 
 		 129 aa  117  7e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  unclonable  0.000000000144174  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3549  hypothetical protein  51.43 
 
 		 132 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000882166  normal  0.578454 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0917  transcriptional regulator, TrmB  48.21 
 
 		 124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000000063679  hitchhiker  0.000000000488515 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0584  transcriptional regulator, TrmB  48.67 
 
 		 131 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000212991  normal  0.151075 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3027  hypothetical protein  48.57 
 
 		 132 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00669531  normal  0.374075 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0378  hypothetical protein  46.43 
 
 		 124 aa  102  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000129839  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1859  hypothetical protein  44.35 
 
 		 124 aa  96.3  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0870058  normal  0.527414 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0547  transcriptional regulator, TrmB  42.48 
 
 		 120 aa  91.3  5e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0575  hypothetical protein  38.94 
 
 		 129 aa  87  8e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.14645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0588  hypothetical protein  39.09 
 
 		 132 aa  86.3  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.490183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2849  hypothetical protein  43.97 
 
 		 129 aa  85.1  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0489802  hitchhiker  0.00628176 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1951  hypothetical protein  44.95 
 
 		 133 aa  84  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1949  hypothetical protein  42.02 
 
 		 137 aa  82.8  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2262  hypothetical protein  40.71 
 
 		 116 aa  79.3  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0497  hypothetical protein  38.74 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.057831  normal  0.47226 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0777  hypothetical protein  38.05 
 
 		 128 aa  73.6  0.0000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.572189  normal  0.185879 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1686  hypothetical protein  40.18 
 
 		 121 aa  71.6  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>