22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1387 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1387  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 
126 aa  256  9e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0917  transcriptional regulator, TrmB  69.11 
 
 
124 aa  174  3e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000000063679  hitchhiker  0.000000000488515 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1131  transcriptional regulator, TrmB  63.41 
 
 
129 aa  162  2.0000000000000002e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0618637  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0584  transcriptional regulator, TrmB  58.87 
 
 
131 aa  152  1e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000212991  normal  0.151075 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1859  hypothetical protein  52.42 
 
 
124 aa  135  2e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0870058  normal  0.527414 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0982  hypothetical protein  50.82 
 
 
138 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0404  hypothetical protein  51.61 
 
 
129 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  unclonable  0.000000000144174  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0388  hypothetical protein  47.58 
 
 
126 aa  121  4e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0889  transcriptional regulator, TrmB  50 
 
 
130 aa  118  3e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.119653  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0547  transcriptional regulator, TrmB  53.12 
 
 
120 aa  102  2e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3549  hypothetical protein  39.17 
 
 
132 aa  98.2  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000882166  normal  0.578454 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0497  hypothetical protein  40.83 
 
 
130 aa  94  7e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.057831  normal  0.47226 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3027  hypothetical protein  37.5 
 
 
132 aa  92.8  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00669531  normal  0.374075 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2262  hypothetical protein  43.64 
 
 
116 aa  90.5  7e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0378  hypothetical protein  39.45 
 
 
124 aa  89.4  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000129839  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0588  hypothetical protein  43.24 
 
 
132 aa  88.6  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.490183  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1951  hypothetical protein  43.93 
 
 
133 aa  85.9  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0575  hypothetical protein  39.13 
 
 
129 aa  84  7e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.14645  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1949  hypothetical protein  41.28 
 
 
137 aa  81.3  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0777  hypothetical protein  40 
 
 
128 aa  74.7  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.572189  normal  0.185879 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1686  hypothetical protein  34.19 
 
 
121 aa  73.9  0.0000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2849  hypothetical protein  34.43 
 
 
129 aa  73.6  0.0000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0489802  hitchhiker  0.00628176 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>