22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0378 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_0378  hypothetical protein  100 
 
 		 124 aa  253  6e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000129839  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3549  hypothetical protein  55.93 
 
 		 132 aa  140  8e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000882166  normal  0.578454 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3027  hypothetical protein  54.24 
 
 		 132 aa  134  4e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00669531  normal  0.374075 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0388  hypothetical protein  52.59 
 
 		 126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0982  hypothetical protein  44.92 
 
 		 138 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0889  transcriptional regulator, TrmB  46.43 
 
 		 130 aa  102  1e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.119653  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0404  hypothetical protein  44.35 
 
 		 129 aa  103  1e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  unclonable  0.000000000144174  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1686  hypothetical protein  46.15 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1949  hypothetical protein  47.27 
 
 		 137 aa  99.8  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2849  hypothetical protein  47.22 
 
 		 129 aa  97.4  5e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0489802  hitchhiker  0.00628176 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1951  hypothetical protein  44.55 
 
 		 133 aa  96.7  9e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0584  transcriptional regulator, TrmB  44.04 
 
 		 131 aa  94.7  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000212991  normal  0.151075 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2262  hypothetical protein  37.93 
 
 		 116 aa  90.9  6e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1387  transcriptional regulator, TrmB  39.45 
 
 		 126 aa  89.4  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0547  transcriptional regulator, TrmB  40 
 
 		 120 aa  89.4  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0917  transcriptional regulator, TrmB  38.05 
 
 		 124 aa  87.4  5e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000000063679  hitchhiker  0.000000000488515 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1131  transcriptional regulator, TrmB  38.05 
 
 		 129 aa  87  7e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0618637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1859  hypothetical protein  31.3 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0870058  normal  0.527414 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0575  hypothetical protein  33.33 
 
 		 129 aa  71.6  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.14645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0777  hypothetical protein  33.94 
 
 		 128 aa  70.1  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.572189  normal  0.185879 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0497  hypothetical protein  28.45 
 
 		 130 aa  66.2  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.057831  normal  0.47226 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0588  hypothetical protein  30.63 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.490183  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>