22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0588 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_0588  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  259  1e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.490183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0575  hypothetical protein  68 
 
 		 129 aa  169  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.14645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0497  hypothetical protein  48.8 
 
 		 130 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.057831  normal  0.47226 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0777  hypothetical protein  46.77 
 
 		 128 aa  122  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.572189  normal  0.185879 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1131  transcriptional regulator, TrmB  41.07 
 
 		 129 aa  89.7  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0618637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1387  transcriptional regulator, TrmB  43.24 
 
 		 126 aa  88.6  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0917  transcriptional regulator, TrmB  40.18 
 
 		 124 aa  85.9  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000000063679  hitchhiker  0.000000000488515 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0889  transcriptional regulator, TrmB  39.09 
 
 		 130 aa  86.3  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.119653  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0584  transcriptional regulator, TrmB  36.84 
 
 		 131 aa  84.7  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000212991  normal  0.151075 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0404  hypothetical protein  36.94 
 
 		 129 aa  81.3  0.000000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  unclonable  0.000000000144174  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0388  hypothetical protein  34.26 
 
 		 126 aa  70.1  0.000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1949  hypothetical protein  35.14 
 
 		 137 aa  69.3  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0547  transcriptional regulator, TrmB  36.27 
 
 		 120 aa  68.6  0.00000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3027  hypothetical protein  33.02 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00669531  normal  0.374075 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0982  hypothetical protein  33.64 
 
 		 138 aa  68.2  0.00000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1951  hypothetical protein  33.04 
 
 		 133 aa  67  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2262  hypothetical protein  31.53 
 
 		 116 aa  66.2  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3549  hypothetical protein  31.48 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000882166  normal  0.578454 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1859  hypothetical protein  35 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0870058  normal  0.527414 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1686  hypothetical protein  30.91 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0378  hypothetical protein  30.63 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000129839  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2849  hypothetical protein  30.63 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0489802  hitchhiker  0.00628176 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>