23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3027 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3027  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  271  3e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00669531  normal  0.374075 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3549  hypothetical protein  87.88 
 
 		 132 aa  237  2.9999999999999997e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000882166  normal  0.578454 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0388  hypothetical protein  51.22 
 
 		 126 aa  135  1e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0378  hypothetical protein  54.24 
 
 		 124 aa  134  4e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000129839  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0982  hypothetical protein  46.62 
 
 		 138 aa  127  6e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0889  transcriptional regulator, TrmB  48.57 
 
 		 130 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.119653  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0404  hypothetical protein  40.8 
 
 		 129 aa  108  3e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  unclonable  0.000000000144174  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1951  hypothetical protein  43.9 
 
 		 133 aa  98.6  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1949  hypothetical protein  44.25 
 
 		 137 aa  96.7  9e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2849  hypothetical protein  42.15 
 
 		 129 aa  94  6e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0489802  hitchhiker  0.00628176 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1131  transcriptional regulator, TrmB  40.83 
 
 		 129 aa  92.8  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0618637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1387  transcriptional regulator, TrmB  37.5 
 
 		 126 aa  92.8  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0917  transcriptional regulator, TrmB  39.17 
 
 		 124 aa  92  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000000063679  hitchhiker  0.000000000488515 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1686  hypothetical protein  43.36 
 
 		 121 aa  91.7  3e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2262  hypothetical protein  38.79 
 
 		 116 aa  90.5  6e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0547  transcriptional regulator, TrmB  41.46 
 
 		 120 aa  89  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0584  transcriptional regulator, TrmB  34.35 
 
 		 131 aa  87.4  6e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000212991  normal  0.151075 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1859  hypothetical protein  35 
 
 		 124 aa  76.3  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0870058  normal  0.527414 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0497  hypothetical protein  33.33 
 
 		 130 aa  74.3  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.057831  normal  0.47226 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0588  hypothetical protein  33.02 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.490183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0575  hypothetical protein  33.01 
 
 		 129 aa  67.8  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.14645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0777  hypothetical protein  33.66 
 
 		 128 aa  67  0.00000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.572189  normal  0.185879 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1188  transcriptional regulator, TrmB  28.07 
 
 		 353 aa  43.9  0.0007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0102771  hitchhiker  0.00221829 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>