82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2487 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2487  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 357 aa  714    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.555087 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2263  transcriptional regulator, TrmB  56.42 
 
 		 358 aa  394  1e-108  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.070294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2386  transcriptional regulator, TrmB  39.94 
 
 		 357 aa  257  3e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1347  transcriptional regulator, TrmB  34.71 
 
 		 373 aa  222  9e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1532  transcriptional regulator, TrmB  29.69 
 
 		 350 aa  127  3e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.512754 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1856  transcriptional regulator, TrmB  29.07 
 
 		 354 aa  114  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0014  transcriptional regulator, TrmB  28.34 
 
 		 354 aa  112  7.000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.336758  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2271  transcriptional regulator, TrmB  27.08 
 
 		 350 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.665277  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0543  transcriptional regulator, TrmB  29.32 
 
 		 373 aa  110  5e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0100454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0131  transcriptional regulator, TrmB  27.93 
 
 		 356 aa  101  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0208  transcriptional regulator, TrmB  26.8 
 
 		 352 aa  88.6  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.986438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2646  transcriptional regulator, TrmB  26.58 
 
 		 352 aa  84.7  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1148  transcriptional regulator, TrmB  25.71 
 
 		 363 aa  73.2  0.000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4098  transcriptional regulator, TrmB  24.24 
 
 		 351 aa  66.2  0.0000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1188  transcriptional regulator, TrmB  23.56 
 
 		 353 aa  64.7  0.000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0102771  hitchhiker  0.00221829 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0860  transcriptional regulator, TrmB  25.4 
 
 		 357 aa  62  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.433281 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4089  transcriptional regulator, TrmB  24.65 
 
 		 742 aa  60.1  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0043  transcriptional regulator, TrmB  22.35 
 
 		 355 aa  59.7  0.00000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.314996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0183  hypothetical protein  26.75 
 
 		 247 aa  58.5  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.154953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1154  transcriptional regulator, TrmB  25.7 
 
 		 344 aa  58.2  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00116341  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1951  transcriptional regulator, TrmB  29.95 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6913  transcriptional regulator TrmB  29.8 
 
 		 272 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4896  transcriptional regulator, TrmB  30.95 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3875  transcriptional regulator, TrmB  41.38 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.936215  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6373  transcriptional regulator, TrmB  27.69 
 
 		 272 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1455  transcriptional regulator, TrmB  27.69 
 
 		 272 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.851928  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0601  transcriptional regulator, TrmB  20.17 
 
 		 333 aa  53.9  0.000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0853  transcriptional regulator  20.08 
 
 		 261 aa  53.1  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.829949  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0885  hypothetical protein  19.67 
 
 		 261 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.674449  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1025  hypothetical protein  19.67 
 
 		 261 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3376700000000002e-24 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0984  hypothetical protein  19.67 
 
 		 261 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1029  hypothetical protein  20.16 
 
 		 261 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0938  hypothetical protein  19.83 
 
 		 257 aa  51.2  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4328  hypothetical protein  19.67 
 
 		 261 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.442126 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1711  transcriptional regulator TrmB  24.88 
 
 		 277 aa  50.8  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0841  transcriptional regulator  19.67 
 
 		 261 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000156218  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1683  transcriptional regulator, TrmB  24.39 
 
 		 273 aa  49.7  0.00007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1985  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 224 aa  48.9  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.583082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1112  hypothetical protein  19.18 
 
 		 261 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.194867  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4615  transcriptional regulator, TrmB  28.3 
 
 		 272 aa  49.3  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0833  transcriptional regulator, TrmB  19.52 
 
 		 261 aa  48.9  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0191  transcriptional regulator, TrmB  25.15 
 
 		 258 aa  49.3  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1551  transcriptional regulator, TrmB  22.5 
 
 		 342 aa  48.1  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1597  transcriptional regulator, TrmB  24.22 
 
 		 278 aa  48.1  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1209  transcriptional regulator, TrmB  36.84 
 
 		 277 aa  47.8  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0136  transcriptional regulator, TrmB  25.9 
 
 		 261 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.516292  normal  0.898641 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3331  hypothetical protein  31.75 
 
 		 119 aa  47.4  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0582813  normal  0.0569842 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1270  transcriptional regulator  28.16 
 
 		 260 aa  47.4  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.194156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0459  transcriptional regulator, TrmB  30.85 
 
 		 250 aa  47  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.160981  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1562  transcriptional regulator, TrmB  28.19 
 
 		 233 aa  47  0.0005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1849  hypothetical protein  24.54 
 
 		 278 aa  47  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0762  transcriptional regulator-like protein  29.73 
 
 		 256 aa  47  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.239824 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1091  transcriptional regulator TrmB  22.97 
 
 		 386 aa  46.6  0.0006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0826  hypothetical protein  27.84 
 
 		 264 aa  46.6  0.0006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2275  transcriptional regulator, TrmB  28.9 
 
 		 268 aa  46.6  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.509638  normal  0.232482 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0750  transcriptional regulator, TrmB  30 
 
 		 270 aa  46.6  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2312  transcriptional regulator, TrmB  24.51 
 
 		 276 aa  46.2  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1721  hypothetical protein  23.6 
 
 		 278 aa  46.2  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.945623  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1794  hypothetical protein  23.6 
 
 		 278 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1561  transcriptional regulator  23.6 
 
 		 278 aa  46.2  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1598  hypothetical protein  23.6 
 
 		 278 aa  46.2  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2552  transcriptional regulator, TrmB  30.84 
 
 		 250 aa  46.2  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1771  hypothetical protein  23.6 
 
 		 278 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0070  transcriptional regulator, TrmB  24.92 
 
 		 354 aa  46.2  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.432762  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2039  helix-turn-helix family DUF118  27.16 
 
 		 288 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3603  hypothetical protein  23.6 
 
 		 278 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1740  hypothetical protein  23.6 
 
 		 278 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1550  transcriptional regulator  23.6 
 
 		 278 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472094  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4842  transcriptional regulator, TrmB  24.39 
 
 		 252 aa  44.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2203  transcriptional regulator, TrmB  52.27 
 
 		 262 aa  45.4  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2535  transcriptional regulator, TrmB  19.73 
 
 		 230 aa  45.1  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1202  transcriptional regulator, TrmB  25 
 
 		 262 aa  44.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.967129 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1591  transcriptional regulator, TrmB  21.85 
 
 		 345 aa  44.7  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.230504  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3670  hypothetical protein  23.39 
 
 		 273 aa  44.7  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.697327  normal  0.0551294 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1399  transcriptional regulator, TrmB  23.08 
 
 		 243 aa  44.3  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.913675  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0464  transcriptional regulator, TrmB  27.38 
 
 		 261 aa  43.9  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.872456  unclonable  0.00001282 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1582  transcriptional regulator, TrmB  29.38 
 
 		 267 aa  43.9  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.353107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5157  hypothetical protein  24.51 
 
 		 252 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2683  transcriptional regulator, TrmB  45.45 
 
 		 268 aa  43.1  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.808403 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0087  hypothetical protein  24.51 
 
 		 252 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2763  transcriptional regulator, TrmB  38.98 
 
 		 269 aa  42.7  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0895  transcriptional regulator, TrmB  26.47 
 
 		 260 aa  42.7  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483175  hitchhiker  0.000000338741 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>