53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1148 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_1148  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 363 aa  714    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2646  transcriptional regulator, TrmB  80 
 
 		 352 aa  540  9.999999999999999e-153  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0543  transcriptional regulator, TrmB  52.46 
 
 		 373 aa  339  4e-92  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0100454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0208  transcriptional regulator, TrmB  46.09 
 
 		 352 aa  311  1e-83  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.986438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0131  transcriptional regulator, TrmB  48.32 
 
 		 356 aa  308  9e-83  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0043  transcriptional regulator, TrmB  37.12 
 
 		 355 aa  242  6e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.314996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4098  transcriptional regulator, TrmB  36.13 
 
 		 351 aa  230  2e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0860  transcriptional regulator, TrmB  33.43 
 
 		 357 aa  187  3e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.433281 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0183  hypothetical protein  36.69 
 
 		 247 aa  135  9.999999999999999e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.154953  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1532  transcriptional regulator, TrmB  33.52 
 
 		 350 aa  127  3e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.512754 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0014  transcriptional regulator, TrmB  31.79 
 
 		 354 aa  115  7.999999999999999e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.336758  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2263  transcriptional regulator, TrmB  28.69 
 
 		 358 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.070294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1856  transcriptional regulator, TrmB  30.26 
 
 		 354 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2271  transcriptional regulator, TrmB  26.1 
 
 		 350 aa  100  3e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.665277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1347  transcriptional regulator, TrmB  26.4 
 
 		 373 aa  93.2  7e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2386  transcriptional regulator, TrmB  24.53 
 
 		 357 aa  89  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2487  transcriptional regulator, TrmB  25.71 
 
 		 357 aa  81.6  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.555087 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4089  transcriptional regulator, TrmB  26.3 
 
 		 742 aa  82  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2864  transcriptional regulator, TrmB  32.32 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3875  transcriptional regulator, TrmB  35.78 
 
 		 275 aa  59.7  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.936215  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1535  transcriptional regulator, TrmB  24.7 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0861  transcriptional regulator, TrmB  30.72 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.416678  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1982  transcriptional regulator, TrmB  24.69 
 
 		 258 aa  56.2  0.0000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000597249  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3670  hypothetical protein  31.25 
 
 		 273 aa  55.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.697327  normal  0.0551294 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0601  transcriptional regulator, TrmB  24.09 
 
 		 333 aa  55.1  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0136  transcriptional regulator, TrmB  25.33 
 
 		 261 aa  52  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.516292  normal  0.898641 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1810  transcriptional regulator, TrmB  26.03 
 
 		 239 aa  51.6  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.206182 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1445  transcriptional regulator, TrmB  24.31 
 
 		 239 aa  51.2  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1188  transcriptional regulator, TrmB  21.07 
 
 		 353 aa  51.2  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0102771  hitchhiker  0.00221829 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0464  transcriptional regulator, TrmB  23.96 
 
 		 261 aa  50.4  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.872456  unclonable  0.00001282 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2854  transcriptional regulator, TrmB  27.84 
 
 		 267 aa  49.3  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.627477  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0152  transcriptional regulator, TrmB  28.67 
 
 		 249 aa  48.5  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.57312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1582  transcriptional regulator, TrmB  28.09 
 
 		 267 aa  48.1  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.353107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0490  transcriptional regulator, TrmB  28.49 
 
 		 267 aa  48.5  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1638  transcriptional regulator, TrmB  22.84 
 
 		 248 aa  48.1  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2552  transcriptional regulator, TrmB  30.18 
 
 		 250 aa  48.1  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1897  transcriptional regulator, TrmB  28.12 
 
 		 279 aa  47.8  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2683  transcriptional regulator, TrmB  26.07 
 
 		 268 aa  45.8  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.808403 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0114  transcriptional regulator TrmB  24.58 
 
 		 255 aa  45.1  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000433337 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1112  hypothetical protein  20.85 
 
 		 261 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.194867  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1951  transcriptional regulator, TrmB  25.95 
 
 		 263 aa  44.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1270  transcriptional regulator  31.94 
 
 		 260 aa  44.3  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.194156  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0853  transcriptional regulator  20.56 
 
 		 261 aa  44.7  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.829949  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0885  hypothetical protein  20.56 
 
 		 261 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.674449  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0895  transcriptional regulator, TrmB  25.12 
 
 		 260 aa  44.3  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483175  hitchhiker  0.000000338741 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1025  hypothetical protein  20.56 
 
 		 261 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3376700000000002e-24 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1562  transcriptional regulator, TrmB  25.69 
 
 		 233 aa  44.3  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0984  hypothetical protein  20.57 
 
 		 261 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4328  hypothetical protein  20.56 
 
 		 261 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.442126 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4896  transcriptional regulator, TrmB  24.38 
 
 		 263 aa  43.5  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0841  transcriptional regulator  20.51 
 
 		 261 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000156218  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0938  hypothetical protein  20.67 
 
 		 257 aa  42.7  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1029  hypothetical protein  20.51 
 
 		 261 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>