68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1347 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_1347  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 373 aa  754    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2386  transcriptional regulator, TrmB  38.98 
 
 		 357 aa  249  7e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2263  transcriptional regulator, TrmB  38.83 
 
 		 358 aa  245  9e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.070294  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2487  transcriptional regulator, TrmB  34.71 
 
 		 357 aa  222  9.999999999999999e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.555087 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1856  transcriptional regulator, TrmB  25.96 
 
 		 354 aa  90.9  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0014  transcriptional regulator, TrmB  26.75 
 
 		 354 aa  90.5  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.336758  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1148  transcriptional regulator, TrmB  26.13 
 
 		 363 aa  90.1  5e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1532  transcriptional regulator, TrmB  26.18 
 
 		 350 aa  80.5  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.512754 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2646  transcriptional regulator, TrmB  25.35 
 
 		 352 aa  79  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0543  transcriptional regulator, TrmB  26.68 
 
 		 373 aa  78.2  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0100454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2271  transcriptional regulator, TrmB  23.55 
 
 		 350 aa  77.8  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.665277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0131  transcriptional regulator, TrmB  27.83 
 
 		 356 aa  70.1  0.00000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4089  transcriptional regulator, TrmB  23.31 
 
 		 742 aa  68.9  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1535  transcriptional regulator, TrmB  38.89 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3670  hypothetical protein  37.5 
 
 		 273 aa  58.9  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.697327  normal  0.0551294 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0861  transcriptional regulator, TrmB  40.74 
 
 		 249 aa  58.5  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.416678  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0860  transcriptional regulator, TrmB  24.25 
 
 		 357 aa  57.8  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.433281 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3875  transcriptional regulator, TrmB  25.41 
 
 		 275 aa  57  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.936215  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0208  transcriptional regulator, TrmB  28.66 
 
 		 352 aa  56.2  0.0000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.986438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0895  transcriptional regulator, TrmB  28.48 
 
 		 260 aa  55.8  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483175  hitchhiker  0.000000338741 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0136  transcriptional regulator, TrmB  25.67 
 
 		 261 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.516292  normal  0.898641 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1154  transcriptional regulator, TrmB  25.2 
 
 		 344 aa  53.9  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00116341  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2864  transcriptional regulator, TrmB  40.28 
 
 		 255 aa  53.9  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4098  transcriptional regulator, TrmB  23.14 
 
 		 351 aa  52.8  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2552  transcriptional regulator, TrmB  41.54 
 
 		 250 aa  52.4  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0853  transcriptional regulator  22.94 
 
 		 261 aa  52.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.829949  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0885  hypothetical protein  22.35 
 
 		 261 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.674449  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0938  hypothetical protein  22.35 
 
 		 257 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1112  hypothetical protein  22.35 
 
 		 261 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.194867  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1025  hypothetical protein  22.35 
 
 		 261 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3376700000000002e-24 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0841  transcriptional regulator  22.35 
 
 		 261 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000156218  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0114  transcriptional regulator TrmB  26.2 
 
 		 255 aa  50.8  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000433337 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2791  transcriptional regulator, TrmB  26.52 
 
 		 223 aa  50.8  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1029  hypothetical protein  22.35 
 
 		 261 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4328  hypothetical protein  22.35 
 
 		 261 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.442126 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0984  hypothetical protein  22.35 
 
 		 261 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0833  transcriptional regulator, TrmB  22.35 
 
 		 261 aa  50.1  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0464  transcriptional regulator, TrmB  25.52 
 
 		 261 aa  49.7  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.872456  unclonable  0.00001282 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2275  transcriptional regulator, TrmB  33 
 
 		 268 aa  49.7  0.00009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.509638  normal  0.232482 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0191  transcriptional regulator, TrmB  25.29 
 
 		 258 aa  48.5  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1270  transcriptional regulator  29.63 
 
 		 260 aa  47.8  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.194156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3603  hypothetical protein  23.67 
 
 		 278 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1971  transcriptional regulator, TrmB  24.87 
 
 		 288 aa  47.4  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.430841  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1849  hypothetical protein  23.67 
 
 		 278 aa  47  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1985  transcriptional regulator, TrmB  35.94 
 
 		 224 aa  47  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.583082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0043  transcriptional regulator, TrmB  23.18 
 
 		 355 aa  47  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.314996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4615  transcriptional regulator, TrmB  27.23 
 
 		 272 aa  46.6  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1771  hypothetical protein  23.67 
 
 		 278 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1561  transcriptional regulator  23.67 
 
 		 278 aa  46.6  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1721  hypothetical protein  23.67 
 
 		 278 aa  46.6  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.945623  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1598  hypothetical protein  23.67 
 
 		 278 aa  46.6  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1794  hypothetical protein  23.67 
 
 		 278 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2683  transcriptional regulator, TrmB  28.7 
 
 		 268 aa  46.2  0.0009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.808403 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1740  hypothetical protein  23.67 
 
 		 278 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1550  transcriptional regulator  23.67 
 
 		 278 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472094  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0988  RNA polymerase Rbp10  38.71 
 
 		 262 aa  46.2  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.883487  normal  0.725953 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1209  transcriptional regulator, TrmB  31.33 
 
 		 277 aa  45.4  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1711  transcriptional regulator TrmB  27.72 
 
 		 277 aa  44.7  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1280  transcriptional regulator, TrmB  23.44 
 
 		 262 aa  44.7  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.755111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2535  transcriptional regulator, TrmB  22.16 
 
 		 230 aa  44.3  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1597  transcriptional regulator, TrmB  23.67 
 
 		 278 aa  44.3  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1455  transcriptional regulator, TrmB  26.04 
 
 		 272 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.851928  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6373  transcriptional regulator, TrmB  26.04 
 
 		 272 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06640  transcriptional regulator, TrmB  20.93 
 
 		 269 aa  43.9  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.22042e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0490  transcriptional regulator, TrmB  30.21 
 
 		 267 aa  43.5  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2854  transcriptional regulator, TrmB  32.5 
 
 		 267 aa  43.5  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.627477  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4924  transcriptional regulator, TrmB  23.27 
 
 		 262 aa  43.1  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1562  transcriptional regulator, TrmB  30.34 
 
 		 233 aa  42.7  0.01  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>