14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0183 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0183  hypothetical protein  100 
 
 		 247 aa  497  1e-140  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.154953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0131  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 356 aa  125  8.000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1148  transcriptional regulator, TrmB  36.69 
 
 		 363 aa  120  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2646  transcriptional regulator, TrmB  35.54 
 
 		 352 aa  118  9e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0208  transcriptional regulator, TrmB  31.62 
 
 		 352 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.986438  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0543  transcriptional regulator, TrmB  33.88 
 
 		 373 aa  109  5e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0100454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0043  transcriptional regulator, TrmB  26.05 
 
 		 355 aa  90.1  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.314996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4098  transcriptional regulator, TrmB  27.64 
 
 		 351 aa  88.6  8e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0860  transcriptional regulator, TrmB  29.46 
 
 		 357 aa  69.3  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.433281 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2487  transcriptional regulator, TrmB  26.75 
 
 		 357 aa  58.5  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.555087 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2263  transcriptional regulator, TrmB  26.32 
 
 		 358 aa  57  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.070294  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1532  transcriptional regulator, TrmB  29.72 
 
 		 350 aa  50.8  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.512754 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2386  transcriptional regulator, TrmB  26.19 
 
 		 357 aa  50.8  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0014  transcriptional regulator, TrmB  27.27 
 
 		 354 aa  48.9  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.336758  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>