60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0043 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0043  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 355 aa  715    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.314996  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0543  transcriptional regulator, TrmB  42.27 
 
 		 373 aa  264  1e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0100454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0131  transcriptional regulator, TrmB  38.94 
 
 		 356 aa  249  5e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0208  transcriptional regulator, TrmB  38.19 
 
 		 352 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.986438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2646  transcriptional regulator, TrmB  38.75 
 
 		 352 aa  242  9e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1148  transcriptional regulator, TrmB  37.12 
 
 		 363 aa  228  1e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4098  transcriptional regulator, TrmB  30.75 
 
 		 351 aa  202  7e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0860  transcriptional regulator, TrmB  32.49 
 
 		 357 aa  202  9e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.433281 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1532  transcriptional regulator, TrmB  27.06 
 
 		 350 aa  100  3e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.512754 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0014  transcriptional regulator, TrmB  28.83 
 
 		 354 aa  100  4e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.336758  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2271  transcriptional regulator, TrmB  26.88 
 
 		 350 aa  100  5e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.665277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1856  transcriptional regulator, TrmB  28.37 
 
 		 354 aa  93.2  6e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0183  hypothetical protein  26.05 
 
 		 247 aa  90.1  5e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.154953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2386  transcriptional regulator, TrmB  27.5 
 
 		 357 aa  76.6  0.0000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2263  transcriptional regulator, TrmB  24.09 
 
 		 358 aa  68.9  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.070294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4089  transcriptional regulator, TrmB  28.18 
 
 		 742 aa  68.6  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2487  transcriptional regulator, TrmB  22.35 
 
 		 357 aa  59.7  0.00000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.555087 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1591  transcriptional regulator, TrmB  25.21 
 
 		 345 aa  59.3  0.00000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.230504  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1154  transcriptional regulator, TrmB  25.66 
 
 		 344 aa  58.9  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00116341  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1810  transcriptional regulator, TrmB  28.77 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.206182 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1270  transcriptional regulator  27.43 
 
 		 260 aa  57  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.194156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1445  transcriptional regulator, TrmB  26.14 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1721  hypothetical protein  24.55 
 
 		 278 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.945623  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1550  transcriptional regulator  24.55 
 
 		 278 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472094  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1561  transcriptional regulator  24.55 
 
 		 278 aa  54.7  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1598  hypothetical protein  24.55 
 
 		 278 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1794  hypothetical protein  24.55 
 
 		 278 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1771  hypothetical protein  24.55 
 
 		 278 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1202  transcriptional regulator, TrmB  27.94 
 
 		 262 aa  54.7  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.967129 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1849  hypothetical protein  24.55 
 
 		 278 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2864  transcriptional regulator, TrmB  30.41 
 
 		 255 aa  53.9  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3603  hypothetical protein  24.55 
 
 		 278 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1740  hypothetical protein  24.55 
 
 		 278 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0114  transcriptional regulator TrmB  25.52 
 
 		 255 aa  52.8  0.000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000433337 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1597  transcriptional regulator, TrmB  24.55 
 
 		 278 aa  52.8  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2683  transcriptional regulator, TrmB  31.14 
 
 		 268 aa  51.6  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.808403 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0861  transcriptional regulator, TrmB  29.79 
 
 		 249 aa  50.8  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.416678  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0487  transcriptional regulator, TrmB  33 
 
 		 263 aa  49.7  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.194536  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1638  transcriptional regulator, TrmB  22.53 
 
 		 248 aa  49.7  0.00008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1562  transcriptional regulator, TrmB  27.38 
 
 		 233 aa  48.5  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1897  transcriptional regulator, TrmB  27.33 
 
 		 279 aa  47.4  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2552  transcriptional regulator, TrmB  37.65 
 
 		 250 aa  47.4  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1347  transcriptional regulator, TrmB  23.18 
 
 		 373 aa  47  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3875  transcriptional regulator, TrmB  31.4 
 
 		 275 aa  47  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.936215  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0152  transcriptional regulator, TrmB  25.55 
 
 		 249 aa  47  0.0006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.57312  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1399  transcriptional regulator, TrmB  30 
 
 		 243 aa  47  0.0006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.913675  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1535  transcriptional regulator, TrmB  22.5 
 
 		 236 aa  46.6  0.0007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0750  transcriptional regulator, TrmB  29.7 
 
 		 270 aa  45.8  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1209  transcriptional regulator, TrmB  35.37 
 
 		 277 aa  45.4  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1008  transcriptional regulator, TrmB  24.74 
 
 		 243 aa  46.2  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0665446  hitchhiker  0.0000160236 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2791  transcriptional regulator, TrmB  28.41 
 
 		 223 aa  46.2  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4615  transcriptional regulator, TrmB  33.7 
 
 		 272 aa  45.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1551  transcriptional regulator, TrmB  21.47 
 
 		 342 aa  45.1  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0191  transcriptional regulator, TrmB  26.67 
 
 		 258 aa  44.7  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2854  transcriptional regulator, TrmB  32.47 
 
 		 267 aa  44.3  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.627477  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4924  transcriptional regulator, TrmB  30.67 
 
 		 262 aa  43.5  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1985  transcriptional regulator, TrmB  40.38 
 
 		 224 aa  43.1  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.583082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0895  transcriptional regulator, TrmB  28.47 
 
 		 260 aa  43.1  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483175  hitchhiker  0.000000338741 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0594  OstA family protein  36.04 
 
 		 496 aa  42.7  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.42938  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0601  transcriptional regulator, TrmB  26.67 
 
 		 333 aa  42.7  0.01  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>