63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0860 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0860  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 357 aa  720    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.433281 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0208  transcriptional regulator, TrmB  36.08 
 
 		 352 aa  204  1e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.986438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0043  transcriptional regulator, TrmB  32.49 
 
 		 355 aa  202  9e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.314996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2646  transcriptional regulator, TrmB  35.77 
 
 		 352 aa  202  9.999999999999999e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0131  transcriptional regulator, TrmB  33.24 
 
 		 356 aa  194  2e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0543  transcriptional regulator, TrmB  33.61 
 
 		 373 aa  182  7e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0100454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1148  transcriptional regulator, TrmB  33.43 
 
 		 363 aa  176  5e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4098  transcriptional regulator, TrmB  26.69 
 
 		 351 aa  145  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2263  transcriptional regulator, TrmB  24.39 
 
 		 358 aa  90.5  4e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.070294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1856  transcriptional regulator, TrmB  27.63 
 
 		 354 aa  84.3  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0014  transcriptional regulator, TrmB  28.35 
 
 		 354 aa  80.5  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.336758  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4089  transcriptional regulator, TrmB  26.35 
 
 		 742 aa  79.3  0.00000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1532  transcriptional regulator, TrmB  28.69 
 
 		 350 aa  76.3  0.0000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.512754 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0183  hypothetical protein  29.46 
 
 		 247 aa  69.3  0.00000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.154953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2271  transcriptional regulator, TrmB  24.9 
 
 		 350 aa  67.4  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.665277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1810  transcriptional regulator, TrmB  28.67 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.206182 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2487  transcriptional regulator, TrmB  25.4 
 
 		 357 aa  62  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.555087 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0601  transcriptional regulator, TrmB  21.8 
 
 		 333 aa  62  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1347  transcriptional regulator, TrmB  24.25 
 
 		 373 aa  57.8  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2552  transcriptional regulator, TrmB  28.63 
 
 		 250 aa  55.8  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1202  transcriptional regulator, TrmB  28.47 
 
 		 262 aa  54.7  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.967129 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06640  transcriptional regulator, TrmB  22.12 
 
 		 269 aa  55.1  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.22042e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2854  transcriptional regulator, TrmB  27.27 
 
 		 267 aa  52.8  0.000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.627477  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1638  transcriptional regulator, TrmB  24.49 
 
 		 248 aa  52.4  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1008  transcriptional regulator, TrmB  23.71 
 
 		 243 aa  51.6  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0665446  hitchhiker  0.0000160236 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0490  transcriptional regulator, TrmB  27.66 
 
 		 267 aa  50.8  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1562  transcriptional regulator, TrmB  26.02 
 
 		 233 aa  50.8  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0152  transcriptional regulator, TrmB  26.37 
 
 		 249 aa  49.3  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.57312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1897  transcriptional regulator, TrmB  30.77 
 
 		 279 aa  48.1  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1445  transcriptional regulator, TrmB  27.47 
 
 		 239 aa  48.1  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0114  transcriptional regulator TrmB  32.05 
 
 		 255 aa  48.5  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000433337 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0459  transcriptional regulator, TrmB  23.78 
 
 		 250 aa  47.8  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.160981  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2275  transcriptional regulator, TrmB  31.64 
 
 		 268 aa  47.8  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.509638  normal  0.232482 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3875  transcriptional regulator, TrmB  24.38 
 
 		 275 aa  47.4  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.936215  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2791  transcriptional regulator, TrmB  25.95 
 
 		 223 aa  47  0.0006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1270  transcriptional regulator  32.47 
 
 		 260 aa  46.6  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.194156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1849  hypothetical protein  23.35 
 
 		 278 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1112  hypothetical protein  21.47 
 
 		 261 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.194867  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1771  hypothetical protein  23.35 
 
 		 278 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1209  transcriptional regulator, TrmB  34.78 
 
 		 277 aa  45.8  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1721  hypothetical protein  23.35 
 
 		 278 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.945623  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1550  transcriptional regulator  23.35 
 
 		 278 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472094  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1561  transcriptional regulator  23.35 
 
 		 278 aa  45.4  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1598  hypothetical protein  23.35 
 
 		 278 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4328  hypothetical protein  19.89 
 
 		 261 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.442126 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0895  transcriptional regulator, TrmB  29.32 
 
 		 260 aa  45.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483175  hitchhiker  0.000000338741 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1794  hypothetical protein  23.35 
 
 		 278 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3603  hypothetical protein  23.35 
 
 		 278 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1740  hypothetical protein  23.35 
 
 		 278 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0984  hypothetical protein  19.89 
 
 		 261 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0853  transcriptional regulator  21.47 
 
 		 261 aa  45.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.829949  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0841  transcriptional regulator  21.47 
 
 		 261 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000156218  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0464  transcriptional regulator, TrmB  25.45 
 
 		 261 aa  45.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.872456  unclonable  0.00001282 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1029  hypothetical protein  20.9 
 
 		 261 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2386  transcriptional regulator, TrmB  22.83 
 
 		 357 aa  43.9  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3250  transcriptional regulator, TrmB  23.38 
 
 		 234 aa  43.9  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0861  transcriptional regulator, TrmB  30.34 
 
 		 249 aa  43.5  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.416678  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0885  hypothetical protein  20.9 
 
 		 261 aa  43.5  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.674449  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1025  hypothetical protein  20.9 
 
 		 261 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3376700000000002e-24 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0136  transcriptional regulator, TrmB  24.56 
 
 		 261 aa  43.1  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.516292  normal  0.898641 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1597  transcriptional regulator, TrmB  23.35 
 
 		 278 aa  43.1  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0938  hypothetical protein  20.57 
 
 		 257 aa  43.1  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0272  transcriptional regulator, TrmB  23.53 
 
 		 287 aa  43.1  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.369583 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>