84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2271 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2271  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 350 aa  694    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.665277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0014  transcriptional regulator, TrmB  62.96 
 
 		 354 aa  426  1e-118  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.336758  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1532  transcriptional regulator, TrmB  60.4 
 
 		 350 aa  422  1e-117  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.512754 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1856  transcriptional regulator, TrmB  61.25 
 
 		 354 aa  417  9.999999999999999e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2263  transcriptional regulator, TrmB  25.76 
 
 		 358 aa  118  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.070294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4089  transcriptional regulator, TrmB  27.87 
 
 		 742 aa  113  4.0000000000000004e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2386  transcriptional regulator, TrmB  27.15 
 
 		 357 aa  113  5e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0543  transcriptional regulator, TrmB  27.14 
 
 		 373 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0100454  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2487  transcriptional regulator, TrmB  27.08 
 
 		 357 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.555087 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0208  transcriptional regulator, TrmB  30.21 
 
 		 352 aa  102  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.986438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0043  transcriptional regulator, TrmB  26.88 
 
 		 355 aa  100  5e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.314996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4098  transcriptional regulator, TrmB  27.32 
 
 		 351 aa  98.6  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0131  transcriptional regulator, TrmB  25.86 
 
 		 356 aa  98.6  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2646  transcriptional regulator, TrmB  27.78 
 
 		 352 aa  98.2  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1148  transcriptional regulator, TrmB  26.16 
 
 		 363 aa  94.7  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1154  transcriptional regulator, TrmB  26.59 
 
 		 344 aa  78.6  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00116341  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1347  transcriptional regulator, TrmB  23.55 
 
 		 373 aa  77.8  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0114  transcriptional regulator TrmB  27.68 
 
 		 255 aa  68.2  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000433337 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0860  transcriptional regulator, TrmB  24.9 
 
 		 357 aa  67.4  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.433281 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1597  transcriptional regulator, TrmB  23.2 
 
 		 278 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1445  transcriptional regulator, TrmB  28.67 
 
 		 239 aa  63.9  0.000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1849  hypothetical protein  22.16 
 
 		 278 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1550  transcriptional regulator  22.16 
 
 		 278 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472094  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1091  transcriptional regulator TrmB  31.68 
 
 		 386 aa  63.5  0.000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1771  hypothetical protein  22.16 
 
 		 278 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1598  hypothetical protein  22.16 
 
 		 278 aa  63.5  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1794  hypothetical protein  22.16 
 
 		 278 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1561  transcriptional regulator  22.16 
 
 		 278 aa  63.5  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1721  hypothetical protein  22.16 
 
 		 278 aa  63.5  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.945623  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3603  hypothetical protein  22.16 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1740  hypothetical protein  22.51 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1591  transcriptional regulator, TrmB  30.43 
 
 		 345 aa  63.2  0.000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.230504  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3875  transcriptional regulator, TrmB  41.18 
 
 		 275 aa  61.6  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.936215  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2854  transcriptional regulator, TrmB  31.03 
 
 		 267 aa  60.8  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.627477  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0689  transcriptional regulator, TrmB  44.78 
 
 		 271 aa  60.5  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.264848  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1897  transcriptional regulator, TrmB  28.9 
 
 		 279 aa  59.7  0.00000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1985  transcriptional regulator, TrmB  31.47 
 
 		 224 aa  58.9  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.583082  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0885  hypothetical protein  23.08 
 
 		 261 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.674449  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0833  transcriptional regulator, TrmB  23.95 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06640  transcriptional regulator, TrmB  22.8 
 
 		 269 aa  58.5  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.22042e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1551  transcriptional regulator, TrmB  23.34 
 
 		 342 aa  57.8  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1112  hypothetical protein  22.29 
 
 		 261 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.194867  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1025  hypothetical protein  23.08 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3376700000000002e-24 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0841  transcriptional regulator  23.08 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000156218  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0984  hypothetical protein  22.29 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4328  hypothetical protein  23.08 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.442126 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0938  hypothetical protein  23.03 
 
 		 257 aa  57.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4615  transcriptional regulator, TrmB  34.95 
 
 		 272 aa  57.4  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1029  hypothetical protein  23.08 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0601  transcriptional regulator, TrmB  22.15 
 
 		 333 aa  57  0.0000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3578  hypothetical protein  32.43 
 
 		 275 aa  57  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0712382 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2791  transcriptional regulator, TrmB  30.09 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0853  transcriptional regulator  21.69 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.829949  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1270  transcriptional regulator  25.16 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.194156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0490  transcriptional regulator, TrmB  29.89 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2275  transcriptional regulator, TrmB  30.23 
 
 		 268 aa  55.8  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.509638  normal  0.232482 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0152  transcriptional regulator, TrmB  27.78 
 
 		 249 aa  55.8  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.57312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1188  transcriptional regulator, TrmB  23.83 
 
 		 353 aa  54.3  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0102771  hitchhiker  0.00221829 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1810  transcriptional regulator, TrmB  28.28 
 
 		 239 aa  53.9  0.000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.206182 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2763  transcriptional regulator, TrmB  39.39 
 
 		 269 aa  53.5  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1683  transcriptional regulator, TrmB  26.78 
 
 		 273 aa  52.4  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1582  transcriptional regulator, TrmB  29.05 
 
 		 267 aa  52.4  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.353107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4924  transcriptional regulator, TrmB  28.81 
 
 		 262 aa  51.2  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3670  hypothetical protein  35.82 
 
 		 273 aa  50.8  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.697327  normal  0.0551294 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1562  transcriptional regulator, TrmB  24.84 
 
 		 233 aa  50.1  0.00005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2039  helix-turn-helix family DUF118  25 
 
 		 288 aa  49.7  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1638  transcriptional regulator, TrmB  25.93 
 
 		 248 aa  50.1  0.00007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4091  hypothetical protein  24.6 
 
 		 269 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0750  transcriptional regulator, TrmB  32.69 
 
 		 270 aa  49.3  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1535  transcriptional regulator, TrmB  24.62 
 
 		 236 aa  48.1  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0191  transcriptional regulator, TrmB  29.03 
 
 		 258 aa  48.1  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1209  transcriptional regulator, TrmB  29.27 
 
 		 277 aa  47.4  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1971  transcriptional regulator, TrmB  32.98 
 
 		 288 aa  46.2  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.430841  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0464  transcriptional regulator, TrmB  27.38 
 
 		 261 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.872456  unclonable  0.00001282 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1399  transcriptional regulator, TrmB  24.18 
 
 		 243 aa  45.8  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.913675  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1280  transcriptional regulator, TrmB  25.61 
 
 		 262 aa  45.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.755111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2312  transcriptional regulator, TrmB  22.41 
 
 		 276 aa  45.1  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0136  transcriptional regulator, TrmB  26.35 
 
 		 261 aa  44.3  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.516292  normal  0.898641 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2203  transcriptional regulator, TrmB  34.33 
 
 		 262 aa  43.9  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2745  transcriptional regulator, TrmB  26.36 
 
 		 270 aa  43.9  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2683  transcriptional regulator, TrmB  26.82 
 
 		 268 aa  43.9  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.808403 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2614  transcriptional regulator, TrmB  32.98 
 
 		 254 aa  43.5  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.768111 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0895  transcriptional regulator, TrmB  29.27 
 
 		 260 aa  43.5  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483175  hitchhiker  0.000000338741 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1076  transcriptional regulator, TrmB  35.06 
 
 		 281 aa  42.7  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>