56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0070 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0070  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 354 aa  704    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.432762  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1551  transcriptional regulator, TrmB  36.66 
 
 		 342 aa  191  2e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1188  transcriptional regulator, TrmB  25.35 
 
 		 353 aa  95.1  1e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0102771  hitchhiker  0.00221829 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2263  transcriptional regulator, TrmB  28.41 
 
 		 358 aa  94.7  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.070294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0601  transcriptional regulator, TrmB  24.93 
 
 		 333 aa  72.8  0.000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2487  transcriptional regulator, TrmB  24.72 
 
 		 357 aa  70.5  0.00000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.555087 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1591  transcriptional regulator, TrmB  26.36 
 
 		 345 aa  68.6  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.230504  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1532  transcriptional regulator, TrmB  23.22 
 
 		 350 aa  68.6  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.512754 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1683  transcriptional regulator, TrmB  28.74 
 
 		 273 aa  62  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4924  transcriptional regulator, TrmB  26.09 
 
 		 262 aa  59.3  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2271  transcriptional regulator, TrmB  22.54 
 
 		 350 aa  58.9  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.665277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2864  transcriptional regulator, TrmB  26.74 
 
 		 255 aa  58.5  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1154  transcriptional regulator, TrmB  25.94 
 
 		 344 aa  57.8  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00116341  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0191  transcriptional regulator, TrmB  25.44 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0131  transcriptional regulator, TrmB  24.28 
 
 		 356 aa  57  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1951  transcriptional regulator, TrmB  25.58 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3670  hypothetical protein  28.9 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.697327  normal  0.0551294 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1856  transcriptional regulator, TrmB  23.13 
 
 		 354 aa  56.2  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0208  transcriptional regulator, TrmB  23.21 
 
 		 352 aa  55.5  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.986438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1897  transcriptional regulator, TrmB  25.27 
 
 		 279 aa  55.8  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0543  transcriptional regulator, TrmB  23.56 
 
 		 373 aa  55.5  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0100454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1638  transcriptional regulator, TrmB  28.4 
 
 		 248 aa  54.7  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1270  transcriptional regulator  32.33 
 
 		 260 aa  52.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.194156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4896  transcriptional regulator, TrmB  25 
 
 		 263 aa  52  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1810  transcriptional regulator, TrmB  25.1 
 
 		 239 aa  51.2  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.206182 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3605  transcriptional regulator, TrmB  23.35 
 
 		 288 aa  51.2  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.997022 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0014  transcriptional regulator, TrmB  21.72 
 
 		 354 aa  50.1  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.336758  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1445  transcriptional regulator, TrmB  38.57 
 
 		 239 aa  50.1  0.00006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2386  transcriptional regulator, TrmB  22.99 
 
 		 357 aa  49.7  0.00008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0860  transcriptional regulator, TrmB  23.53 
 
 		 357 aa  48.9  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.433281 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0861  transcriptional regulator, TrmB  24.03 
 
 		 249 aa  48.1  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.416678  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1027  transcriptional regulator, TrmB  27.4 
 
 		 290 aa  48.1  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1550  transcriptional regulator  24.7 
 
 		 278 aa  47  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472094  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1598  hypothetical protein  24.7 
 
 		 278 aa  46.2  0.0009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1771  hypothetical protein  24.7 
 
 		 278 aa  46.2  0.0009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1561  transcriptional regulator  24.7 
 
 		 278 aa  46.2  0.0009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1721  hypothetical protein  24.7 
 
 		 278 aa  46.2  0.0009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.945623  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1794  hypothetical protein  25.1 
 
 		 278 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2552  transcriptional regulator, TrmB  36.92 
 
 		 250 aa  45.4  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2233  transcriptional regulator, TrmB  35.71 
 
 		 248 aa  45.8  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000408105 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1849  hypothetical protein  24.5 
 
 		 278 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4615  transcriptional regulator, TrmB  25.45 
 
 		 272 aa  45.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0152  transcriptional regulator, TrmB  28.26 
 
 		 249 aa  45.4  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.57312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1347  transcriptional regulator, TrmB  24.33 
 
 		 373 aa  45.1  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4089  transcriptional regulator, TrmB  23.42 
 
 		 742 aa  45.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3603  hypothetical protein  24.6 
 
 		 278 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0750  transcriptional regulator, TrmB  26.32 
 
 		 270 aa  44.3  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0136  transcriptional regulator, TrmB  25.31 
 
 		 261 aa  44.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.516292  normal  0.898641 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2097  transcriptional regulator TrmB  28.16 
 
 		 124 aa  44.3  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1582  transcriptional regulator, TrmB  27.59 
 
 		 267 aa  43.9  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.353107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1971  transcriptional regulator, TrmB  30.77 
 
 		 288 aa  43.9  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.430841  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1740  hypothetical protein  24.6 
 
 		 278 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4460  transcriptional regulator, TrmB  30.1 
 
 		 246 aa  43.9  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000101535 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1562  transcriptional regulator, TrmB  26.49 
 
 		 233 aa  43.5  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0464  transcriptional regulator, TrmB  22.77 
 
 		 261 aa  43.5  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.872456  unclonable  0.00001282 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2854  transcriptional regulator, TrmB  35.56 
 
 		 267 aa  42.7  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.627477  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>