72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1971 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_1971  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 288 aa  579  1e-164  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.430841  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1076  transcriptional regulator, TrmB  54.18 
 
 		 281 aa  297  1e-79  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3875  transcriptional regulator, TrmB  37.7 
 
 		 275 aa  77.4  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.936215  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0490  transcriptional regulator, TrmB  32.22 
 
 		 267 aa  72.4  0.000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3670  hypothetical protein  25.45 
 
 		 273 aa  70.1  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.697327  normal  0.0551294 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1582  transcriptional regulator, TrmB  35.62 
 
 		 267 aa  66.6  0.0000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.353107  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2275  transcriptional regulator, TrmB  30.73 
 
 		 268 aa  66.2  0.0000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.509638  normal  0.232482 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2683  transcriptional regulator, TrmB  30.37 
 
 		 268 aa  63.9  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.808403 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2854  transcriptional regulator, TrmB  29.44 
 
 		 267 aa  63.5  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.627477  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2763  transcriptional regulator, TrmB  29.3 
 
 		 269 aa  62.8  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1154  transcriptional regulator, TrmB  37.97 
 
 		 344 aa  59.3  0.00000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00116341  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0459  transcriptional regulator, TrmB  31.11 
 
 		 250 aa  58.9  0.00000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.160981  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2263  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 358 aa  58.9  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.070294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2203  transcriptional regulator, TrmB  36.84 
 
 		 262 aa  58.2  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1562  transcriptional regulator, TrmB  34.52 
 
 		 233 aa  58.2  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0114  transcriptional regulator TrmB  31.25 
 
 		 255 aa  57  0.0000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000433337 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1535  transcriptional regulator, TrmB  36.59 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1985  transcriptional regulator, TrmB  39.02 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.583082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2312  transcriptional regulator, TrmB  31.82 
 
 		 276 aa  55.8  0.0000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0762  transcriptional regulator-like protein  35.42 
 
 		 256 aa  55.5  0.0000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.239824 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1849  hypothetical protein  27.46 
 
 		 278 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3603  hypothetical protein  26.76 
 
 		 278 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1794  hypothetical protein  26.76 
 
 		 278 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1721  hypothetical protein  26.76 
 
 		 278 aa  53.9  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.945623  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1561  transcriptional regulator  26.76 
 
 		 278 aa  53.9  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1771  hypothetical protein  26.76 
 
 		 278 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1598  hypothetical protein  26.76 
 
 		 278 aa  53.9  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1597  transcriptional regulator, TrmB  26.76 
 
 		 278 aa  53.9  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1550  transcriptional regulator  26.76 
 
 		 278 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472094  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1209  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 277 aa  52.8  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1740  hypothetical protein  26.76 
 
 		 278 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1897  transcriptional regulator, TrmB  35.06 
 
 		 279 aa  52.4  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0689  transcriptional regulator, TrmB  35.56 
 
 		 271 aa  52  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.264848  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4089  transcriptional regulator, TrmB  29.09 
 
 		 742 aa  52  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1856  transcriptional regulator, TrmB  35.35 
 
 		 354 aa  50.4  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0487  transcriptional regulator, TrmB  27.84 
 
 		 263 aa  50.1  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.194536  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4924  transcriptional regulator, TrmB  24.03 
 
 		 262 aa  49.7  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0191  transcriptional regulator, TrmB  29.35 
 
 		 258 aa  49.3  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0750  transcriptional regulator, TrmB  28.14 
 
 		 270 aa  48.9  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1270  transcriptional regulator  34.29 
 
 		 260 aa  48.9  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.194156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0826  hypothetical protein  26.42 
 
 		 264 aa  48.5  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1280  transcriptional regulator, TrmB  30.28 
 
 		 262 aa  48.9  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.755111  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1532  transcriptional regulator, TrmB  32.73 
 
 		 350 aa  48.5  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.512754 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2552  transcriptional regulator, TrmB  30.43 
 
 		 250 aa  47.4  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1347  transcriptional regulator, TrmB  24.87 
 
 		 373 aa  47.4  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2271  transcriptional regulator, TrmB  32.98 
 
 		 350 aa  46.2  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.665277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1683  transcriptional regulator, TrmB  26.23 
 
 		 273 aa  45.8  0.0008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2791  transcriptional regulator, TrmB  33.78 
 
 		 223 aa  45.8  0.0009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1951  transcriptional regulator, TrmB  23.83 
 
 		 263 aa  45.8  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3331  hypothetical protein  29.17 
 
 		 119 aa  45.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0582813  normal  0.0569842 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32970  predicted transcriptional regulator  26.79 
 
 		 321 aa  45.4  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2864  transcriptional regulator, TrmB  34.33 
 
 		 255 aa  44.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1638  transcriptional regulator, TrmB  31 
 
 		 248 aa  44.7  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1112  hypothetical protein  28.89 
 
 		 261 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.194867  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0833  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 261 aa  44.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1029  hypothetical protein  31.33 
 
 		 261 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0853  transcriptional regulator  32.1 
 
 		 261 aa  44.3  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.829949  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1025  hypothetical protein  32.1 
 
 		 261 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3376700000000002e-24 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4328  hypothetical protein  31.33 
 
 		 261 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.442126 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0885  hypothetical protein  32.1 
 
 		 261 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.674449  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0841  transcriptional regulator  31.33 
 
 		 261 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000156218  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1399  transcriptional regulator, TrmB  29.17 
 
 		 243 aa  43.9  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.913675  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0861  transcriptional regulator, TrmB  34.67 
 
 		 249 aa  43.9  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.416678  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0984  hypothetical protein  32.1 
 
 		 261 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0938  hypothetical protein  32.1 
 
 		 257 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4615  transcriptional regulator, TrmB  28.89 
 
 		 272 aa  43.5  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3578  hypothetical protein  34.38 
 
 		 275 aa  42.7  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0712382 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3605  transcriptional regulator, TrmB  29.67 
 
 		 288 aa  42.7  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.997022 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1591  transcriptional regulator, TrmB  32.41 
 
 		 345 aa  42.4  0.009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.230504  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0014  transcriptional regulator, TrmB  32.88 
 
 		 354 aa  42.4  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.336758  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4896  transcriptional regulator, TrmB  22.77 
 
 		 263 aa  42.4  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2487  transcriptional regulator, TrmB  32.29 
 
 		 357 aa  42.4  0.01  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.555087 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>