99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0826 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0826  hypothetical protein  100 
 
 
264 aa  547  1e-155  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0762  transcriptional regulator-like protein  37.8 
 
 
256 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.239824 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2614  transcriptional regulator, TrmB  34.11 
 
 
254 aa  142  5e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.768111 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0497  hypothetical protein  28.74 
 
 
252 aa  119  7e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0988  RNA polymerase Rbp10  31.02 
 
 
262 aa  112  5e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.883487  normal  0.725953 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0459  transcriptional regulator, TrmB  31.28 
 
 
250 aa  89.7  4e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.160981  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1029  hypothetical protein  27.13 
 
 
261 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0853  transcriptional regulator  28.57 
 
 
261 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.829949  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0841  transcriptional regulator  26.6 
 
 
261 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000156218  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4328  hypothetical protein  26.06 
 
 
261 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.442126 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1270  transcriptional regulator  28.05 
 
 
260 aa  67.4  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.194156  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1112  hypothetical protein  27.33 
 
 
261 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.194867  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1025  hypothetical protein  27.33 
 
 
261 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3376700000000002e-24 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0984  hypothetical protein  26.71 
 
 
261 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0833  transcriptional regulator, TrmB  25.53 
 
 
261 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0885  hypothetical protein  26.71 
 
 
261 aa  65.1  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.674449  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0938  hypothetical protein  26.42 
 
 
257 aa  65.1  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1202  transcriptional regulator, TrmB  35.92 
 
 
262 aa  60.1  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.967129 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1209  transcriptional regulator, TrmB  26.44 
 
 
277 aa  60.5  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06640  transcriptional regulator, TrmB  31.25 
 
 
269 aa  59.7  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.22042e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0490  transcriptional regulator, TrmB  38.2 
 
 
267 aa  58.2  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1154  transcriptional regulator, TrmB  45.16 
 
 
344 aa  57.8  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00116341  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3605  transcriptional regulator, TrmB  26.67 
 
 
288 aa  57.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.997022 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1849  hypothetical protein  31.96 
 
 
278 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1771  hypothetical protein  31.96 
 
 
278 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1794  hypothetical protein  31.96 
 
 
278 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1598  hypothetical protein  31.96 
 
 
278 aa  56.2  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1561  transcriptional regulator  31.96 
 
 
278 aa  56.2  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1721  hypothetical protein  31.96 
 
 
278 aa  56.2  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.945623  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1550  transcriptional regulator  31.96 
 
 
278 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472094  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3603  hypothetical protein  31.96 
 
 
278 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1562  transcriptional regulator, TrmB  25.68 
 
 
233 aa  53.9  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2275  transcriptional regulator, TrmB  32.8 
 
 
268 aa  53.9  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.509638  normal  0.232482 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0114  transcriptional regulator TrmB  32.99 
 
 
255 aa  54.7  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000433337 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2854  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 
267 aa  54.3  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.627477  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2203  transcriptional regulator, TrmB  37.66 
 
 
262 aa  53.9  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1740  hypothetical protein  31.96 
 
 
278 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2386  transcriptional regulator, TrmB  28.57 
 
 
357 aa  53.5  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1597  transcriptional regulator, TrmB  31.96 
 
 
278 aa  53.5  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0136  transcriptional regulator, TrmB  36.23 
 
 
261 aa  53.1  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.516292  normal  0.898641 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1008  transcriptional regulator, TrmB  24.86 
 
 
243 aa  52.8  0.000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0665446  hitchhiker  0.0000160236 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0464  transcriptional regulator, TrmB  34.78 
 
 
261 aa  53.1  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.872456  unclonable  0.00001282 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0689  transcriptional regulator, TrmB  36.9 
 
 
271 aa  53.1  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.264848  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0191  transcriptional regulator, TrmB  33.68 
 
 
258 aa  52.4  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1591  transcriptional regulator, TrmB  38.36 
 
 
345 aa  51.6  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.230504  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0895  transcriptional regulator, TrmB  34.92 
 
 
260 aa  51.6  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483175  hitchhiker  0.000000338741 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0487  transcriptional regulator, TrmB  39.13 
 
 
263 aa  51.6  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.194536  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6373  transcriptional regulator, TrmB  31.52 
 
 
272 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1455  transcriptional regulator, TrmB  31.52 
 
 
272 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.851928  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0705  transcriptional regulator TrmB  23.73 
 
 
283 aa  51.2  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1445  transcriptional regulator, TrmB  35.64 
 
 
239 aa  51.2  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4091  hypothetical protein  29.47 
 
 
269 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4615  transcriptional regulator, TrmB  33.8 
 
 
272 aa  50.4  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3331  hypothetical protein  31.96 
 
 
119 aa  50.1  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0582813  normal  0.0569842 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0208  transcriptional regulator, TrmB  36.84 
 
 
352 aa  50.1  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.986438  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6913  transcriptional regulator TrmB  30.43 
 
 
272 aa  49.7  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0750  transcriptional regulator, TrmB  27.11 
 
 
270 aa  49.7  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4924  transcriptional regulator, TrmB  29.03 
 
 
262 aa  49.3  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1582  transcriptional regulator, TrmB  32.99 
 
 
267 aa  48.9  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.353107  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1091  transcriptional regulator TrmB  28.09 
 
 
386 aa  48.9  0.00008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4896  transcriptional regulator, TrmB  25.31 
 
 
263 aa  48.9  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0014  transcriptional regulator, TrmB  32.04 
 
 
354 aa  48.1  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.336758  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1971  transcriptional regulator, TrmB  26.42 
 
 
288 aa  48.5  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.430841  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3875  transcriptional regulator, TrmB  32.35 
 
 
275 aa  47.4  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.936215  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2263  transcriptional regulator, TrmB  39.06 
 
 
358 aa  47.8  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.070294  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1951  transcriptional regulator, TrmB  23.93 
 
 
263 aa  47  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1810  transcriptional regulator, TrmB  25.95 
 
 
239 aa  47  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.206182 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0861  transcriptional regulator, TrmB  32.05 
 
 
249 aa  47  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.416678  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1683  transcriptional regulator, TrmB  38.71 
 
 
273 aa  46.6  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2487  transcriptional regulator, TrmB  27.84 
 
 
357 aa  46.6  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.555087 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1535  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 
236 aa  46.6  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0152  transcriptional regulator, TrmB  34.38 
 
 
249 aa  46.6  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.57312  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1985  transcriptional regulator, TrmB  30.16 
 
 
224 aa  45.8  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.583082  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2039  helix-turn-helix family DUF118  45.45 
 
 
288 aa  46.2  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628473  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2683  transcriptional regulator, TrmB  35.21 
 
 
268 aa  45.8  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.808403 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3670  hypothetical protein  33.82 
 
 
273 aa  45.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.697327  normal  0.0551294 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4089  transcriptional regulator, TrmB  24.44 
 
 
742 aa  43.9  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4842  transcriptional regulator, TrmB  31.46 
 
 
252 aa  43.9  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1638  transcriptional regulator, TrmB  31.63 
 
 
248 aa  43.5  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3250  transcriptional regulator, TrmB  30.67 
 
 
234 aa  43.9  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2763  transcriptional regulator, TrmB  33.93 
 
 
269 aa  43.9  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2864  transcriptional regulator, TrmB  28.79 
 
 
255 aa  43.5  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2535  transcriptional regulator, TrmB  31.43 
 
 
230 aa  43.1  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0272  transcriptional regulator, TrmB  25.77 
 
 
287 aa  43.5  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.369583 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2665  hypothetical protein  27.66 
 
 
247 aa  43.5  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0680  transcriptional regulator, TrmB  29.21 
 
 
234 aa  43.1  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.027338  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1856  transcriptional regulator, TrmB  34.55 
 
 
354 aa  43.1  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1711  transcriptional regulator TrmB  32.26 
 
 
277 aa  43.1  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5164  hypothetical protein  31.46 
 
 
252 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4740  transcriptional regulator  31.46 
 
 
252 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5152  hypothetical protein  31.46 
 
 
252 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2205  transcriptional regulator, MarR family  28.05 
 
 
153 aa  42.4  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0087  hypothetical protein  33.73 
 
 
252 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4725  transcriptional regulator  31.46 
 
 
252 aa  42.7  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5125  hypothetical protein  31.46 
 
 
252 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5257  hypothetical protein  31.46 
 
 
252 aa  42.7  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4883  hypothetical protein  31.46 
 
 
252 aa  42.7  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5157  hypothetical protein  33.73 
 
 
252 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2552  transcriptional regulator, TrmB  25 
 
 
250 aa  42.4  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>