52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0762 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0762  transcriptional regulator-like protein  100 
 
 		 256 aa  529  1e-149  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.239824 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0826  hypothetical protein  37.8 
 
 		 264 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2614  transcriptional regulator, TrmB  34.71 
 
 		 254 aa  142  5e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.768111 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0497  hypothetical protein  30.4 
 
 		 252 aa  122  4e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0988  RNA polymerase Rbp10  27.31 
 
 		 262 aa  99  7e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.883487  normal  0.725953 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0459  transcriptional regulator, TrmB  28.88 
 
 		 250 aa  81.6  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.160981  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1209  transcriptional regulator, TrmB  27.42 
 
 		 277 aa  66.6  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1270  transcriptional regulator  26.54 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.194156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1683  transcriptional regulator, TrmB  37.97 
 
 		 273 aa  57.8  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1985  transcriptional regulator, TrmB  41.67 
 
 		 224 aa  57  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.583082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1971  transcriptional regulator, TrmB  35.42 
 
 		 288 aa  55.5  0.0000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.430841  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2263  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 358 aa  54.7  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.070294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0487  transcriptional regulator, TrmB  38.36 
 
 		 263 aa  54.3  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.194536  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1202  transcriptional regulator, TrmB  38.24 
 
 		 262 aa  53.9  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.967129 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2203  transcriptional regulator, TrmB  39.47 
 
 		 262 aa  53.5  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0272  transcriptional regulator, TrmB  25.14 
 
 		 287 aa  52.8  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.369583 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0464  transcriptional regulator, TrmB  28.57 
 
 		 261 aa  52  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.872456  unclonable  0.00001282 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1591  transcriptional regulator, TrmB  33.73 
 
 		 345 aa  50.8  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.230504  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1562  transcriptional regulator, TrmB  24.66 
 
 		 233 aa  49.7  0.00005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0136  transcriptional regulator, TrmB  28.74 
 
 		 261 aa  48.9  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.516292  normal  0.898641 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06640  transcriptional regulator, TrmB  34.25 
 
 		 269 aa  48.9  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.22042e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2552  transcriptional regulator, TrmB  26.62 
 
 		 250 aa  48.5  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3670  hypothetical protein  33.85 
 
 		 273 aa  47.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.697327  normal  0.0551294 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4896  transcriptional regulator, TrmB  29.35 
 
 		 263 aa  47.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4924  transcriptional regulator, TrmB  20.3 
 
 		 262 aa  47.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2487  transcriptional regulator, TrmB  29.73 
 
 		 357 aa  47  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.555087 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0833  transcriptional regulator, TrmB  41.07 
 
 		 261 aa  47  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0705  transcriptional regulator TrmB  28.28 
 
 		 283 aa  46.6  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0750  transcriptional regulator, TrmB  31.51 
 
 		 270 aa  46.2  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3331  hypothetical protein  27.5 
 
 		 119 aa  46.2  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0582813  normal  0.0569842 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1029  hypothetical protein  37.1 
 
 		 261 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0191  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 258 aa  45.8  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2386  transcriptional regulator, TrmB  35.62 
 
 		 357 aa  46.2  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0885  hypothetical protein  39.29 
 
 		 261 aa  45.8  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.674449  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1025  hypothetical protein  39.29 
 
 		 261 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3376700000000002e-24 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4328  hypothetical protein  39.29 
 
 		 261 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.442126 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0984  hypothetical protein  39.29 
 
 		 261 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0853  transcriptional regulator  39.29 
 
 		 261 aa  45.8  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.829949  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0841  transcriptional regulator  39.29 
 
 		 261 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000156218  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1112  hypothetical protein  39.29 
 
 		 261 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.194867  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0938  hypothetical protein  39.62 
 
 		 257 aa  45.8  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4615  transcriptional regulator, TrmB  32.79 
 
 		 272 aa  45.8  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1951  transcriptional regulator, TrmB  28.26 
 
 		 263 aa  45.4  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1535  transcriptional regulator, TrmB  29.17 
 
 		 236 aa  45.1  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2854  transcriptional regulator, TrmB  36.07 
 
 		 267 aa  44.7  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.627477  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2026  transcriptional regulator, TrmB  22.22 
 
 		 248 aa  45.4  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.485296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0490  transcriptional regulator, TrmB  34.43 
 
 		 267 aa  44.3  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2864  transcriptional regulator, TrmB  30.51 
 
 		 255 aa  44.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0895  transcriptional regulator, TrmB  35.38 
 
 		 260 aa  43.5  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483175  hitchhiker  0.000000338741 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1445  transcriptional regulator, TrmB  28.87 
 
 		 239 aa  42.4  0.008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2275  transcriptional regulator, TrmB  30.56 
 
 		 268 aa  42  0.01  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.509638  normal  0.232482 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1897  transcriptional regulator, TrmB  32.1 
 
 		 279 aa  42  0.01  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>