50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2665 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2665  hypothetical protein  100 
 
 		 247 aa  511  1e-144  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0680  transcriptional regulator, TrmB  67.39 
 
 		 234 aa  317  1e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.027338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1011  transcriptional regulator, TrmB  63.37 
 
 		 257 aa  316  2e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.609818 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2535  transcriptional regulator, TrmB  36.68 
 
 		 230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3250  transcriptional regulator, TrmB  38.26 
 
 		 234 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1849  hypothetical protein  29.21 
 
 		 278 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1794  hypothetical protein  29.21 
 
 		 278 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1771  hypothetical protein  29.21 
 
 		 278 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1597  transcriptional regulator, TrmB  29.21 
 
 		 278 aa  90.9  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1721  hypothetical protein  29.21 
 
 		 278 aa  90.5  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.945623  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1598  hypothetical protein  29.21 
 
 		 278 aa  90.5  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1561  transcriptional regulator  29.21 
 
 		 278 aa  90.5  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1550  transcriptional regulator  29.21 
 
 		 278 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472094  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3603  hypothetical protein  29.21 
 
 		 278 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1740  hypothetical protein  28.71 
 
 		 278 aa  87  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06640  transcriptional regulator, TrmB  25.86 
 
 		 269 aa  84.3  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.22042e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4091  hypothetical protein  27.08 
 
 		 269 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1112  hypothetical protein  24.57 
 
 		 261 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.194867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0853  transcriptional regulator  29.22 
 
 		 261 aa  75.5  0.0000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.829949  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1025  hypothetical protein  29.22 
 
 		 261 aa  75.5  0.0000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3376700000000002e-24 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1029  hypothetical protein  29.22 
 
 		 261 aa  75.5  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0841  transcriptional regulator  29.22 
 
 		 261 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000156218  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0984  hypothetical protein  28.57 
 
 		 261 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0885  hypothetical protein  28.57 
 
 		 261 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.674449  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2039  helix-turn-helix family DUF118  39.8 
 
 		 288 aa  73.2  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0833  transcriptional regulator, TrmB  28.57 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4328  hypothetical protein  28.57 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.442126 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0938  hypothetical protein  28.1 
 
 		 257 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0136  transcriptional regulator, TrmB  25.86 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.516292  normal  0.898641 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6913  transcriptional regulator TrmB  26.75 
 
 		 272 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6373  transcriptional regulator, TrmB  26.75 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1455  transcriptional regulator, TrmB  26.75 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.851928  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0464  transcriptional regulator, TrmB  28 
 
 		 261 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.872456  unclonable  0.00001282 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1982  transcriptional regulator, TrmB  22.45 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000597249  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1535  transcriptional regulator, TrmB  22.03 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0895  transcriptional regulator, TrmB  28.08 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483175  hitchhiker  0.000000338741 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0543  transcriptional regulator, TrmB  25.31 
 
 		 373 aa  56.2  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0100454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1711  transcriptional regulator TrmB  24.2 
 
 		 277 aa  53.1  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2552  transcriptional regulator, TrmB  24.12 
 
 		 250 aa  48.1  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0861  transcriptional regulator, TrmB  26.47 
 
 		 249 aa  48.1  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.416678  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1509  putative transcriptional regulator  38.33 
 
 		 223 aa  47.8  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.452011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0208  transcriptional regulator, TrmB  24.71 
 
 		 352 aa  46.6  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.986438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3605  transcriptional regulator, TrmB  23.46 
 
 		 288 aa  46.2  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.997022 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1202  transcriptional regulator, TrmB  22.22 
 
 		 262 aa  45.4  0.0009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.967129 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0689  transcriptional regulator, TrmB  37.88 
 
 		 271 aa  45.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.264848  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0826  hypothetical protein  27.66 
 
 		 264 aa  43.5  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5157  hypothetical protein  20 
 
 		 252 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0860  transcriptional regulator, TrmB  23.62 
 
 		 357 aa  42.4  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.433281 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0487  transcriptional regulator, TrmB  32.08 
 
 		 263 aa  42  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.194536  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1985  transcriptional regulator, TrmB  29.59 
 
 		 224 aa  42  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.583082  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>