76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3578 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3578  hypothetical protein  100 
 
 		 275 aa  556  1e-157  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0712382 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3670  hypothetical protein  31.39 
 
 		 273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.697327  normal  0.0551294 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2275  transcriptional regulator, TrmB  25.18 
 
 		 268 aa  89.7  5e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.509638  normal  0.232482 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2854  transcriptional regulator, TrmB  25 
 
 		 267 aa  84.3  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.627477  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1582  transcriptional regulator, TrmB  26.2 
 
 		 267 aa  82.4  0.000000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.353107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0490  transcriptional regulator, TrmB  25.72 
 
 		 267 aa  80.9  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2683  transcriptional regulator, TrmB  24.34 
 
 		 268 aa  80.5  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.808403 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2203  transcriptional regulator, TrmB  24.81 
 
 		 262 aa  76.6  0.0000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3875  transcriptional regulator, TrmB  36.17 
 
 		 275 aa  74.7  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.936215  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1562  transcriptional regulator, TrmB  34.19 
 
 		 233 aa  72  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0689  transcriptional regulator, TrmB  23.36 
 
 		 271 aa  69.7  0.00000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.264848  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1154  transcriptional regulator, TrmB  29.53 
 
 		 344 aa  68.2  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00116341  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1683  transcriptional regulator, TrmB  40.54 
 
 		 273 aa  61.2  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2745  transcriptional regulator, TrmB  21.43 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1856  transcriptional regulator, TrmB  30 
 
 		 354 aa  57.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2271  transcriptional regulator, TrmB  32.43 
 
 		 350 aa  57  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.665277  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2791  transcriptional regulator, TrmB  37.5 
 
 		 223 aa  57  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0750  transcriptional regulator, TrmB  34.62 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0014  transcriptional regulator, TrmB  31.08 
 
 		 354 aa  55.8  0.0000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.336758  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1591  transcriptional regulator, TrmB  30.69 
 
 		 345 aa  55.5  0.0000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.230504  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0114  transcriptional regulator TrmB  36.84 
 
 		 255 aa  55.1  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000433337 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1445  transcriptional regulator, TrmB  30.69 
 
 		 239 aa  55.1  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0487  transcriptional regulator, TrmB  32.93 
 
 		 263 aa  54.3  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.194536  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2763  transcriptional regulator, TrmB  20.07 
 
 		 269 aa  54.3  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1202  transcriptional regulator, TrmB  29.47 
 
 		 262 aa  53.9  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.967129 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1091  transcriptional regulator TrmB  35.21 
 
 		 386 aa  53.5  0.000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1532  transcriptional regulator, TrmB  31.43 
 
 		 350 aa  53.1  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.512754 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0152  transcriptional regulator, TrmB  30.1 
 
 		 249 aa  52.8  0.000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.57312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4615  transcriptional regulator, TrmB  30.38 
 
 		 272 aa  52.4  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0497  hypothetical protein  31.48 
 
 		 252 aa  52  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0459  transcriptional regulator, TrmB  34.78 
 
 		 250 aa  52  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.160981  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06640  transcriptional regulator, TrmB  37.08 
 
 		 269 aa  52  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.22042e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1550  transcriptional regulator  30.89 
 
 		 278 aa  52  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472094  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1810  transcriptional regulator, TrmB  32.35 
 
 		 239 aa  51.2  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.206182 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2864  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 255 aa  51.2  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1849  hypothetical protein  31.36 
 
 		 278 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1597  transcriptional regulator, TrmB  28.57 
 
 		 278 aa  50.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1794  hypothetical protein  31.36 
 
 		 278 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1598  hypothetical protein  31.36 
 
 		 278 aa  50.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1771  hypothetical protein  31.36 
 
 		 278 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1721  hypothetical protein  31.36 
 
 		 278 aa  50.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.945623  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1561  transcriptional regulator  31.36 
 
 		 278 aa  50.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1638  transcriptional regulator, TrmB  30 
 
 		 248 aa  50.1  0.00004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1897  transcriptional regulator, TrmB  27.85 
 
 		 279 aa  49.7  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3603  hypothetical protein  31.36 
 
 		 278 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1270  transcriptional regulator  35.29 
 
 		 260 aa  48.9  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.194156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1740  hypothetical protein  28.57 
 
 		 278 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4089  transcriptional regulator, TrmB  31.94 
 
 		 742 aa  47.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2026  transcriptional regulator, TrmB  24.04 
 
 		 248 aa  47.4  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.485296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4924  transcriptional regulator, TrmB  29.17 
 
 		 262 aa  47  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0861  transcriptional regulator, TrmB  30.38 
 
 		 249 aa  47.4  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.416678  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2552  transcriptional regulator, TrmB  25.28 
 
 		 250 aa  46.6  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2614  transcriptional regulator, TrmB  28.28 
 
 		 254 aa  46.6  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.768111 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2263  transcriptional regulator, TrmB  29.63 
 
 		 358 aa  45.8  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.070294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1951  transcriptional regulator, TrmB  21.17 
 
 		 263 aa  45.4  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0853  transcriptional regulator  45.65 
 
 		 261 aa  44.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.829949  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0885  hypothetical protein  45.65 
 
 		 261 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.674449  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0841  transcriptional regulator  45.65 
 
 		 261 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000156218  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1029  hypothetical protein  45.65 
 
 		 261 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0938  hypothetical protein  45.65 
 
 		 257 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0984  hypothetical protein  45.65 
 
 		 261 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4328  hypothetical protein  45.65 
 
 		 261 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.442126 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1025  hypothetical protein  45.65 
 
 		 261 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3376700000000002e-24 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0833  transcriptional regulator, TrmB  43.48 
 
 		 261 aa  43.9  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0705  transcriptional regulator TrmB  30.99 
 
 		 283 aa  43.5  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1112  hypothetical protein  43.48 
 
 		 261 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.194867  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6913  transcriptional regulator TrmB  30.77 
 
 		 272 aa  43.5  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0191  transcriptional regulator, TrmB  24.75 
 
 		 258 aa  43.1  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1711  transcriptional regulator TrmB  28.17 
 
 		 277 aa  43.1  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3331  hypothetical protein  27 
 
 		 119 aa  43.1  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0582813  normal  0.0569842 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2312  transcriptional regulator, TrmB  26.6 
 
 		 276 aa  42.7  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1971  transcriptional regulator, TrmB  34.38 
 
 		 288 aa  42.7  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.430841  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1455  transcriptional regulator, TrmB  29.23 
 
 		 272 aa  42.4  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.851928  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6373  transcriptional regulator, TrmB  29.23 
 
 		 272 aa  42.4  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2386  transcriptional regulator, TrmB  32.84 
 
 		 357 aa  42.4  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3886  transcriptional regulator, LuxR family  27.45 
 
 		 326 aa  42.4  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.661499  normal  0.356923 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>