14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2669 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2669  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 197 aa  392  1e-108  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2775  transcriptional regulator TrmB  77.04 
 
 		 197 aa  302  2.0000000000000002e-81  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2456  transcriptional regulator TrmB  38.64 
 
 		 188 aa  126  3e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.189668  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3263  transcriptional regulator, TrmB  40.66 
 
 		 194 aa  122  3e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4529  transcriptional regulator TrmB  40.7 
 
 		 221 aa  112  4.0000000000000004e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1666  transcriptional regulator, TrmB  36.47 
 
 		 225 aa  96.7  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.481798  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1078  transcriptional regulator, TrmB  36.84 
 
 		 171 aa  91.3  8e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3623  hypothetical protein  31.4 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0157  hypothetical protein  28.24 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3508  hypothetical protein  34.83 
 
 		 98 aa  45.8  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3563  hypothetical protein  34.83 
 
 		 98 aa  45.8  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1008  transcriptional regulator, TrmB  30.67 
 
 		 243 aa  43.9  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0665446  hitchhiker  0.0000160236 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4313  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 317 aa  41.6  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0223249  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1057  transcriptional regulator, TrmB  24.4 
 
 		 207 aa  41.6  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.607328  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>