17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1957 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_1957  hypothetical protein  100 
 
 
273 aa  550  1e-155  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2318  hypothetical protein  71.06 
 
 
273 aa  395  1e-109  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3823  hypothetical protein  61.89 
 
 
281 aa  324  9e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.829852  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2170  hypothetical protein  54.26 
 
 
282 aa  296  3e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4807  hypothetical protein  39.77 
 
 
386 aa  189  4e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1804  hypothetical protein  41.43 
 
 
403 aa  134  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1079  hypothetical protein  33.46 
 
 
394 aa  125  7e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.223586  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1370  hypothetical protein  31.64 
 
 
420 aa  118  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0750  transcriptional regulator, TrmB  29.17 
 
 
270 aa  69.3  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1897  transcriptional regulator, TrmB  31.25 
 
 
279 aa  57.4  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1951  transcriptional regulator, TrmB  31.03 
 
 
263 aa  57  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4896  transcriptional regulator, TrmB  31.72 
 
 
263 aa  55.8  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3481  hypothetical protein  37.35 
 
 
112 aa  53.5  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4924  transcriptional regulator, TrmB  25.45 
 
 
262 aa  52.8  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0612  hypothetical protein  32.14 
 
 
221 aa  50.4  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4615  transcriptional regulator, TrmB  28.28 
 
 
272 aa  49.3  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0191  transcriptional regulator, TrmB  26.19 
 
 
258 aa  48.9  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>