18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3481 on replicon NC_012030
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012030  Hlac_3481  hypothetical protein  100 
 
 
112 aa  226  7e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4616  hypothetical protein  42.5 
 
 
118 aa  58.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2170  hypothetical protein  37.08 
 
 
282 aa  54.7  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4273  hypothetical protein  36.05 
 
 
123 aa  53.9  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.566972  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1957  hypothetical protein  37.35 
 
 
273 aa  53.5  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2318  hypothetical protein  36.14 
 
 
273 aa  50.8  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3456  hypothetical protein  34.15 
 
 
140 aa  47.4  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2847  hypothetical protein  40.74 
 
 
135 aa  45.1  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.445862  normal  0.620211 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1979  hypothetical protein  35.35 
 
 
131 aa  45.1  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4807  hypothetical protein  40.62 
 
 
386 aa  43.9  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3010  hypothetical protein  30 
 
 
178 aa  43.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4192  hypothetical protein  31.58 
 
 
129 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.217057  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1965  hypothetical protein  29 
 
 
190 aa  42.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_5004  hypothetical protein  31.65 
 
 
113 aa  42.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5248  hypothetical protein  32.94 
 
 
198 aa  41.2  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0619  hypothetical protein  36.59 
 
 
117 aa  41.6  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4803  hypothetical protein  31.31 
 
 
130 aa  41.2  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.320519  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2024  hypothetical protein  35.06 
 
 
108 aa  40.4  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>