54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3456 on replicon NC_012030
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012030  Hlac_3456  hypothetical protein  100 
 
 
140 aa  281  2.0000000000000002e-75  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2847  hypothetical protein  38.04 
 
 
135 aa  60.8  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.445862  normal  0.620211 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5248  hypothetical protein  39.53 
 
 
198 aa  60.5  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3036  hypothetical protein  40.91 
 
 
199 aa  59.7  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3002  hypothetical protein  34.26 
 
 
193 aa  58.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3487  hypothetical protein  34.04 
 
 
183 aa  57.4  0.00000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0120  hypothetical protein  34.88 
 
 
184 aa  52.8  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.152404  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0216  hypothetical protein  31.96 
 
 
199 aa  52.8  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1965  hypothetical protein  33.91 
 
 
190 aa  51.2  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0619  hypothetical protein  37.33 
 
 
117 aa  50.8  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1872  hypothetical protein  33.33 
 
 
160 aa  50.8  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3010  hypothetical protein  30.49 
 
 
178 aa  49.7  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1969  hypothetical protein  36.47 
 
 
118 aa  50.1  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1176  hypothetical protein  34.09 
 
 
202 aa  50.1  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0845  hypothetical protein  30.83 
 
 
215 aa  48.9  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.342347  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0446  hypothetical protein  33.65 
 
 
148 aa  48.1  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4111  hypothetical protein  32.67 
 
 
209 aa  48.5  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1332  hypothetical protein  32.35 
 
 
205 aa  47.8  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.914381  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2180  hypothetical protein  35.29 
 
 
121 aa  47.8  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4234  hypothetical protein  33.67 
 
 
132 aa  47.8  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3481  hypothetical protein  34.15 
 
 
112 aa  47.4  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4817  hypothetical protein  34.52 
 
 
211 aa  47.4  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5178  hypothetical protein  29.89 
 
 
177 aa  47.4  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0883194  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1749  hypothetical protein  31.76 
 
 
118 aa  47  0.00009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0492361 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4273  hypothetical protein  35.48 
 
 
123 aa  46.6  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.566972  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0469  hypothetical protein  33.33 
 
 
184 aa  46.6  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2240  hypothetical protein  35.8 
 
 
148 aa  46.2  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.382258  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3653  hypothetical protein  28.26 
 
 
120 aa  45.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1639  hypothetical protein  28.92 
 
 
211 aa  45.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4803  hypothetical protein  41.1 
 
 
130 aa  45.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.320519  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1078  hypothetical protein  33.02 
 
 
129 aa  44.7  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0885  hypothetical protein  28.12 
 
 
215 aa  44.7  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2031  hypothetical protein  32.14 
 
 
169 aa  45.1  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.713073  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5173  hypothetical protein  35.29 
 
 
167 aa  45.1  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0025  hypothetical protein  38.1 
 
 
145 aa  44.7  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.115112  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2483  hypothetical protein  30 
 
 
260 aa  44.7  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0680615  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0470  hypothetical protein  29.13 
 
 
178 aa  44.3  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2867  hypothetical protein  31.52 
 
 
197 aa  44.3  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.360279 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4918  hypothetical protein  34.07 
 
 
117 aa  43.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4807  hypothetical protein  41.1 
 
 
386 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0455  hypothetical protein  33.68 
 
 
136 aa  43.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.605992  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1296  hypothetical protein  32.53 
 
 
119 aa  43.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3004  hypothetical protein  39.73 
 
 
167 aa  42.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.382258  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2318  hypothetical protein  32.53 
 
 
273 aa  42  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2028  hypothetical protein  29.41 
 
 
206 aa  41.6  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.826996  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4063  hypothetical protein  32.53 
 
 
125 aa  41.6  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0507372  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1957  hypothetical protein  37.1 
 
 
273 aa  41.2  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_5004  hypothetical protein  34.62 
 
 
113 aa  41.2  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4832  hypothetical protein  30.23 
 
 
126 aa  40.8  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2408  hypothetical protein  30.12 
 
 
141 aa  41.2  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4346  hypothetical protein  45.45 
 
 
71 aa  40.8  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.154641  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2170  hypothetical protein  30.23 
 
 
282 aa  40.8  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0475  hypothetical protein  29.03 
 
 
192 aa  40.8  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.184707 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3823  hypothetical protein  33.8 
 
 
281 aa  40.4  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.829852  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>