More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7175 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7175  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 262 aa  526  1e-148  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.267519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3947  transcriptional regulator, LuxR family  57.47 
 
 		 250 aa  89.7  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.657672  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2485  transcriptional regulator, LuxR family  57.58 
 
 		 316 aa  73.2  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3936  two component LuxR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00507176  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21820  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.82 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00210  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  30.94 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.133182 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.71 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3337  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.18 
 
 		 254 aa  58.2  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0952095  normal  0.130531 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0553  response regulator receiver protein  47.62 
 
 		 213 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2193  transcriptional regulator, LuxR family  38.1 
 
 		 258 aa  58.5  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3277  transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3606  LuxR transcriptional regulator  38.78 
 
 		 947 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.156001  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0973  two component LuxR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.255067  normal  0.404517 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4471  transcriptional regulator, LuxR family  48.08 
 
 		 680 aa  57.4  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.129361 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0892  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  42.35 
 
 		 896 aa  57  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.311866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3387  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000386408  hitchhiker  0.000570848 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0915  two component LuxR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.000299753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2629  two component LuxR family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.312922  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3331  response regulator receiver protein  48.33 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4871  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.42 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.134443  normal  0.31614 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3120  response regulator receiver  46.97 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.230577  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0897  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  41.56 
 
 		 933 aa  55.8  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.571021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1532  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.67 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0114765  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3357  two component LuxR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.1255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4301  transcriptional regulator, LuxR family  53.97 
 
 		 261 aa  55.8  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0164  response regulator receiver protein  47.54 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2449  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.29 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.729355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7812  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.08 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0393  transcriptional regulator, LuxR family  38.46 
 
 		 486 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4986  two component LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 237 aa  55.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.170484  normal  0.313407 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0502  regulatory protein, LuxR  43.28 
 
 		 861 aa  55.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0169233  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0363  PAS sensor protein  38.82 
 
 		 278 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1446  response regulator receiver protein  45 
 
 		 209 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0167897  normal  0.0778626 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1981  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  47.46 
 
 		 799 aa  54.3  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0978  two component signal transduction response regulator  37.5 
 
 		 223 aa  54.3  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0402933  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1984  two component LuxR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 220 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178457  normal  0.123783 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3262  two component LuxR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 222 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.764026 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4051  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.16 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00308286  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1740  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.14 
 
 		 228 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4116  LuxR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 239 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0201758  hitchhiker  0.00877352 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3511  two component LuxR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 221 aa  54.3  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0444635 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4740  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 160 aa  54.7  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.318753  normal  0.272493 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3279  response regulator receiver  42.19 
 
 		 221 aa  54.3  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.97215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.11 
 
 		 226 aa  53.9  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1345  N-acyl homoserine lactone transcriptional regulator  43.75 
 
 		 239 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0142  N-acyl-homoserine lactone dependent regulatory protein  31.87 
 
 		 234 aa  53.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0163426  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2485  BpsR  43.75 
 
 		 239 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6753  ATP-dependent transcription regulator LuxR  47.54 
 
 		 932 aa  53.9  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.449288 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1393  ATP-dependent transcription regulator LuxR  34.07 
 
 		 913 aa  53.5  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1981  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.08 
 
 		 222 aa  53.5  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.67 
 
 		 213 aa  53.5  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3745  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.16 
 
 		 235 aa  53.5  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0857  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.77 
 
 		 219 aa  53.9  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0762303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1148  regulatory protein LuxR  42.62 
 
 		 921 aa  53.5  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1936  regulatory protein LuxR  41.49 
 
 		 218 aa  53.5  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.548655  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 225 aa  53.5  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3592  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.9 
 
 		 235 aa  53.9  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.356082  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0329  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  43.75 
 
 		 239 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0607  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  43.75 
 
 		 239 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.83559  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1295  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  43.75 
 
 		 239 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.312538  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1652  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.87 
 
 		 234 aa  53.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.643432  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1223  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  43.75 
 
 		 239 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1570  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.87 
 
 		 236 aa  53.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.778317  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0962  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  43.75 
 
 		 239 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1228  LuxR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 204 aa  53.5  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.54 
 
 		 224 aa  53.1  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8412  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.76 
 
 		 239 aa  53.1  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4581  LuxR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 239 aa  53.1  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000141763  hitchhiker  0.0000089809 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2033  LuxR family DNA-binding response regulator  44.44 
 
 		 208 aa  53.1  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1132  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.9 
 
 		 214 aa  53.1  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5304  response regulator receiver protein  38.78 
 
 		 220 aa  53.1  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3603  transcriptional regulator, LuxR family  46.15 
 
 		 364 aa  53.1  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2108  two component LuxR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 218 aa  52.8  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0145  LuxR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 454 aa  52.8  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9329  response regulator receiver protein  43.55 
 
 		 217 aa  52.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3634  transcriptional regulator, LuxR family  47.54 
 
 		 525 aa  52.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.567744  normal  0.0299379 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4942  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.26 
 
 		 222 aa  52.4  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0906  transcriptional regulator, LuxR family  45.9 
 
 		 208 aa  52.4  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000244022  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0105  two component LuxR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 219 aa  52.4  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0920509 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3414  LuxR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 514 aa  52.4  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1510  ATP-dependent transcription regulator LuxR  42.19 
 
 		 239 aa  52.4  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.08907  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5247  LuxR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 514 aa  52.4  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.603722  normal  0.35683 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5343  LuxR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 361 aa  52.4  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0342945 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1052  LuxR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 239 aa  52  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000445716  normal  0.182523 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5576  LuxR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 239 aa  52  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000012464  normal  0.015154 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3643  LuxR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 239 aa  52  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00106494  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 781 aa  52  0.000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4724  LuxR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 239 aa  52  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000522863  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1057  transcriptional regulator, LuxR family  38.67 
 
 		 486 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.113368 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2680  LuxR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 514 aa  51.6  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5165  two component LuxR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 231 aa  52  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.162111 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1854  transcriptional regulator, LuxR family  42.62 
 
 		 75 aa  51.6  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1616  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 229 aa  51.6  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3471  LuxR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 510 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0902  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.9 
 
 		 208 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.154451  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4050  LuxR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 510 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  52.94 
 
 		 776 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.537271 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>