199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1957 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1957  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 
433 aa  903    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.814321  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2047  twin-arginine translocation pathway signal  65.67 
 
 
431 aa  556  1e-157  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0152  twin-arginine translocation pathway signal  62.63 
 
 
432 aa  528  1e-149  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0333259 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3054  branched-chain amino acid ABC transporter  30.96 
 
 
426 aa  176  5e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.492113 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3900  transcriptional regulator, LuxR family  29.67 
 
 
592 aa  156  6e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.573736  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1539  Extracellular ligand-binding receptor  25.14 
 
 
383 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3303  extracellular ligand-binding receptor  24.94 
 
 
393 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0317  extracellular ligand-binding receptor  26.17 
 
 
382 aa  62.8  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00438106  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5995  putative leucine-, isoleucine-, valine-, threonine-, and alanine-binding protein precursor  24.6 
 
 
407 aa  60.8  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.524183  normal  0.0200525 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3679  extracellular ligand-binding receptor  23.28 
 
 
407 aa  60.5  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5340  Extracellular ligand-binding receptor  25.5 
 
 
396 aa  60.1  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.200092  normal  0.984381 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4853  extracellular ligand-binding receptor  25.5 
 
 
396 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2165  extracellular ligand-binding receptor  24.1 
 
 
390 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1970  extracellular ligand-binding receptor  22.19 
 
 
372 aa  59.3  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3837  extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 
395 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0089  Extracellular ligand-binding receptor  25.85 
 
 
396 aa  58.5  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1848  extracellular ligand-binding receptor  24.5 
 
 
389 aa  58.9  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0671771  normal  0.122571 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0070  extracellular ligand-binding receptor  25.85 
 
 
396 aa  58.5  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2471  Extracellular ligand-binding receptor  22.71 
 
 
371 aa  58.2  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1966  Extracellular ligand-binding receptor  24.87 
 
 
396 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0542442 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1650  extracellular ligand-binding receptor  24.84 
 
 
393 aa  58.5  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.154413  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3401  extracellular ligand-binding receptor  23.71 
 
 
379 aa  57.4  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.388266 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2938  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25 
 
 
383 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.679208  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3886  Extracellular ligand-binding receptor  25.5 
 
 
382 aa  55.8  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6118  branched chain amino-acid ABC transporter substrate-binding protein  25.44 
 
 
379 aa  55.8  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.147292 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0050  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.42 
 
 
382 aa  55.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.143388  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3017  extracellular ligand-binding receptor  25.66 
 
 
382 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3401  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  24.8 
 
 
396 aa  53.9  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232513  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6587  Extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 
388 aa  53.5  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1392  Extracellular ligand-binding receptor  22.63 
 
 
382 aa  53.5  0.000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.54413  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2025  Extracellular ligand-binding receptor  23.35 
 
 
411 aa  53.5  0.000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.718345  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0532  Extracellular ligand-binding receptor  25.52 
 
 
370 aa  53.1  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0390708  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6014  extracellular ligand-binding receptor  24.06 
 
 
387 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00769519 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3686  extracellular ligand-binding receptor  24.18 
 
 
383 aa  52  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0861  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.49 
 
 
401 aa  52  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00284433  normal  0.49325 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3253  extracellular ligand-binding receptor  22.81 
 
 
373 aa  52.4  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.363046 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0393  Extracellular ligand-binding receptor  24.76 
 
 
381 aa  52.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2606  Extracellular ligand-binding receptor  22.81 
 
 
373 aa  52.4  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0170435  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1927  extracellular ligand-binding receptor  24.21 
 
 
406 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195593  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3335  extracellular ligand-binding receptor  21.46 
 
 
370 aa  51.2  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4327  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.44 
 
 
402 aa  50.8  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1679  extracellular ligand-binding receptor  23.08 
 
 
411 aa  50.8  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2341  extracellular ligand-binding receptor  26.09 
 
 
405 aa  50.8  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.840598  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3460  extracellular ligand-binding receptor  32.26 
 
 
417 aa  50.8  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.403632  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1861  Extracellular ligand-binding receptor  24.65 
 
 
379 aa  50.8  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.571716  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0270  extracellular ligand-binding receptor  23.08 
 
 
460 aa  50.4  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.186259  normal  0.56965 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6487  extracellular ligand-binding receptor  23.81 
 
 
415 aa  50.4  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203833  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0561  Extracellular ligand-binding receptor  24.81 
 
 
368 aa  50.4  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.378991  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4646  extracellular ligand-binding receptor  23.44 
 
 
384 aa  50.4  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3230  extracellular ligand-binding receptor  25.15 
 
 
400 aa  50.4  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.293864  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0051  outative extracellular ligand binding protein  23.73 
 
 
380 aa  50.1  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3831  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  23.73 
 
 
380 aa  50.1  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3912  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  23.73 
 
 
380 aa  50.1  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4699  extracellular ligand-binding receptor  42.27 
 
 
432 aa  50.1  0.00009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.525381 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1734  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  26.12 
 
 
380 aa  49.7  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.534498  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1562  extracellular ligand-binding receptor  27.01 
 
 
406 aa  49.7  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.775767  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2023  Extracellular ligand-binding receptor  32.26 
 
 
415 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1574  ABC transporter, periplasmic branched chain amino acid binding protein  23.56 
 
 
409 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.760294  normal  0.703114 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2810  extracellular ligand-binding receptor  22.32 
 
 
377 aa  49.3  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.079562  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2934  extracellular ligand-binding receptor  26.1 
 
 
322 aa  49.7  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0257101  normal  0.419703 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0112  extracellular ligand-binding receptor  24.13 
 
 
381 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2901  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  23.73 
 
 
376 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.971399  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4331  extracellular ligand-binding receptor  22.73 
 
 
373 aa  48.9  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3158  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  23.73 
 
 
380 aa  48.9  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4127  extracellular ligand-binding receptor  25.96 
 
 
400 aa  48.9  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.515914  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3407  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  23.73 
 
 
380 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.251793  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1639  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  23.73 
 
 
380 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.516456  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2962  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  23.73 
 
 
380 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49524  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1720  extracellular ligand-binding receptor  21.92 
 
 
396 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.565956  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2829  extracellular ligand-binding receptor  24.61 
 
 
391 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.617546  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1137  Extracellular ligand-binding receptor  22.12 
 
 
393 aa  48.1  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0165472  normal  0.816566 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0278  extracellular ligand-binding receptor  24.61 
 
 
391 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.730585  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0260  extracellular ligand-binding receptor  24.61 
 
 
380 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.962079 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1620  extracellular ligand-binding receptor  25.39 
 
 
408 aa  47.8  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.294267  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4452  putative Leu/Ile/Val/Thr/Ala-binding protein  21.9 
 
 
412 aa  47.8  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.133528 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0172  Extracellular ligand-binding receptor  24.42 
 
 
395 aa  47.8  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0221424  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0154  extracellular ligand-binding receptor  24.42 
 
 
395 aa  47.8  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0857  extracellular ligand-binding receptor  23.96 
 
 
411 aa  47.8  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1322  extracellular ligand-binding receptor  22.14 
 
 
418 aa  47.8  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0679703  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1741  Extracellular ligand-binding receptor  24.79 
 
 
375 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.734186  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1450  Extracellular ligand-binding receptor  31.45 
 
 
415 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.702119  normal  0.714217 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1761  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  23.28 
 
 
467 aa  47.4  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3558  Extracellular ligand-binding receptor  31.45 
 
 
415 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.987899  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0186  extracellular ligand-binding receptor  24.61 
 
 
380 aa  47.4  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000207737 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1288  extracellular ligand-binding receptor  31.45 
 
 
415 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.166473  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0205  extracellular ligand-binding receptor  24.05 
 
 
380 aa  47  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1027  extracellular ligand-binding receptor  23.73 
 
 
384 aa  47.4  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000000299575  normal  0.161964 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3755  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic leucine-specific-binding protein LivK  20.88 
 
 
369 aa  47  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3935  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic leucine-specific-binding protein LivK  20.88 
 
 
369 aa  47  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3766  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic leucine-specific-binding protein LivK  20.88 
 
 
369 aa  47  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3833  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic leucine-specific-binding protein LivK  20.88 
 
 
369 aa  47  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0192  extracellular ligand-binding receptor  24.05 
 
 
380 aa  47  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3492  extracellular ligand-binding receptor  22.87 
 
 
386 aa  47  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.839805 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1941  Extracellular ligand-binding receptor  22.49 
 
 
416 aa  47  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0612  extracellular ligand-binding receptor  23.93 
 
 
412 aa  47  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0805  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  22.43 
 
 
380 aa  46.6  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.351699  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3905  extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 
388 aa  46.6  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.504593  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1178  outative extracellular ligand binding protein  22.43 
 
 
380 aa  46.6  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1102  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  22.43 
 
 
380 aa  46.6  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391264  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1769  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  22.43 
 
 
380 aa  46.6  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>