More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4646 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4646  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
384 aa  769    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2019  extracellular ligand-binding receptor  30.62 
 
 
374 aa  136  6.0000000000000005e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3401  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  30.12 
 
 
396 aa  133  6.999999999999999e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232513  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1934  Extracellular ligand-binding receptor  31.04 
 
 
397 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000937878  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2283  Extracellular ligand-binding receptor  31.4 
 
 
395 aa  130  6e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000119381 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0219  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.53 
 
 
376 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00187981  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2020  extracellular ligand-binding receptor  29.39 
 
 
384 aa  127  3e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.168799 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4261  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  28.09 
 
 
404 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4416  Extracellular ligand-binding receptor  27.78 
 
 
404 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4416  extracellular ligand-binding receptor  28.62 
 
 
402 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.859568  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4395  Extracellular ligand-binding receptor  27.47 
 
 
404 aa  123  5e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0089  Extracellular ligand-binding receptor  29.33 
 
 
396 aa  123  7e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0070  extracellular ligand-binding receptor  29.33 
 
 
396 aa  122  8e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0932  Extracellular ligand-binding receptor  29.03 
 
 
376 aa  122  9.999999999999999e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000568006  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3728  extracellular ligand-binding receptor  31.54 
 
 
392 aa  119  9e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.172455  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0376  extracellular ligand-binding receptor  26.65 
 
 
381 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000374663  hitchhiker  0.000123514 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1392  Extracellular ligand-binding receptor  25.32 
 
 
382 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.54413  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01985  amino acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  27.7 
 
 
386 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222636  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2607  Extracellular ligand-binding receptor  28.75 
 
 
372 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3906  Extracellular ligand-binding receptor  27.54 
 
 
386 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0299  extracellular ligand-binding receptor  27.58 
 
 
403 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102439  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2254  extracellular ligand-binding receptor  25.77 
 
 
376 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3793  Extracellular ligand-binding receptor  27.54 
 
 
386 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.15379 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2323  extracellular ligand-binding receptor  27.27 
 
 
383 aa  114  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0350  extracellular ligand-binding receptor  28.45 
 
 
376 aa  114  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000281139  normal  0.291499 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3294  hypothetical protein  27.43 
 
 
383 aa  114  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.953272  normal  0.0380984 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0893  extracellular ligand-binding receptor  26.46 
 
 
396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0612  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched chain amino acid-binding protein  26.75 
 
 
371 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3105  Extracellular ligand-binding receptor  24.32 
 
 
389 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0331  Extracellular ligand-binding receptor  28.93 
 
 
377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179963  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2306  Extracellular ligand-binding receptor  26.21 
 
 
419 aa  111  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.110917  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0836  extracellular ligand-binding receptor  26.1 
 
 
390 aa  111  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0783302 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3521  extracellular ligand-binding receptor  27.83 
 
 
400 aa  111  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2271  extracellular ligand-binding receptor  28.87 
 
 
378 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.731283  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0523  Extracellular ligand-binding receptor  26.84 
 
 
390 aa  110  5e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0215267  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0258  amino acid ABC transporter, periplasmic-binding protein  25.81 
 
 
393 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3057  Extracellular ligand-binding receptor  27.99 
 
 
398 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0995  Extracellular ligand-binding receptor  26.12 
 
 
379 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.725983  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3208  Extracellular ligand-binding receptor  26.07 
 
 
376 aa  108  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4053  extracellular ligand-binding receptor  27.66 
 
 
406 aa  108  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4487  extracellular ligand-binding receptor  24.78 
 
 
384 aa  107  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00567759  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6057  extracellular ligand-binding receptor  28.49 
 
 
384 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5831  extracellular ligand-binding receptor  28.49 
 
 
384 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.468117  normal  0.310951 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2397  extracellular ligand-binding receptor  28.44 
 
 
372 aa  107  5e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.285564  normal  0.778884 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0317  extracellular ligand-binding receptor  27.67 
 
 
382 aa  106  6e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00438106  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3823  Extracellular ligand-binding receptor  23.48 
 
 
394 aa  106  6e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00025514  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1734  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  26.13 
 
 
380 aa  106  7e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.534498  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0668  extracellular ligand-binding receptor  24.17 
 
 
392 aa  105  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.431771  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3230  extracellular ligand-binding receptor  25.48 
 
 
400 aa  105  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.293864  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1478  Extracellular ligand-binding receptor  26.85 
 
 
376 aa  105  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1050  extracellular ligand-binding receptor  24.22 
 
 
381 aa  105  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.464924 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0833  extracellular ligand-binding receptor  24.87 
 
 
383 aa  105  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000252201  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0014  branched-chain amino acid ABC transporter, perisplasmic amino acid-binding protein, putative  26.73 
 
 
368 aa  105  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0538  extracellular ligand-binding receptor  27.79 
 
 
368 aa  105  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0513259  normal  0.872247 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1164  Extracellular ligand-binding receptor  26.72 
 
 
404 aa  104  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179963  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3822  Extracellular ligand-binding receptor  22.85 
 
 
394 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000102798  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6079  extracellular ligand-binding receptor  27.48 
 
 
384 aa  104  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.829496  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0096  extracellular ligand-binding receptor  25.9 
 
 
416 aa  105  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.809601 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0612  extracellular ligand-binding receptor  28.31 
 
 
412 aa  104  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1798  extracellular ligand-binding receptor  27.24 
 
 
402 aa  104  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.637603  normal  0.0827017 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1823  extracellular ligand-binding receptor  25.71 
 
 
380 aa  104  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5327  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter (substrate-binding protein)  24.46 
 
 
372 aa  104  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.25236 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0611  Extracellular ligand-binding receptor  27.59 
 
 
371 aa  103  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3905  extracellular ligand-binding receptor  26.42 
 
 
388 aa  103  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.504593  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0042  extracellular ligand-binding receptor  26.65 
 
 
368 aa  103  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.538449  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1720  extracellular ligand-binding receptor  27.3 
 
 
396 aa  103  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.565956  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1671  extracellular ligand-binding receptor  25.78 
 
 
379 aa  103  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1592  leucine-specific binding precursor transmembrane protein  29.36 
 
 
380 aa  103  6e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7692  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.92 
 
 
384 aa  103  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.854568 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6628  extracellular ligand-binding receptor  27.35 
 
 
384 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.733405 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2873  extracellular ligand-binding receptor  28.31 
 
 
394 aa  102  9e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.716938  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3099  Extracellular ligand-binding receptor  28.26 
 
 
367 aa  102  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.419035 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1735  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  26.72 
 
 
378 aa  102  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1141  extracellular ligand-binding receptor  28.79 
 
 
371 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.209837 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0533  Extracellular ligand-binding receptor  27.73 
 
 
393 aa  102  1e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000200352 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0915  Extracellular ligand-binding receptor  26.65 
 
 
405 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4069  extracellular ligand-binding receptor  25.42 
 
 
393 aa  102  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.236469 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1175  extracellular ligand-binding receptor  28.79 
 
 
371 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.343144  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2086  Extracellular ligand-binding receptor  24.34 
 
 
372 aa  102  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2750  Extracellular ligand-binding receptor  25.17 
 
 
375 aa  101  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3706  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.41 
 
 
405 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.209947  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0192  extracellular ligand-binding receptor  27.78 
 
 
380 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2131  extracellular ligand-binding receptor  25.72 
 
 
379 aa  100  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0617424  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0404  extracellular ligand-binding receptor  29.32 
 
 
409 aa  101  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0168747  normal  0.259327 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2830  Extracellular ligand-binding receptor  28.62 
 
 
367 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.345866 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0260  extracellular ligand-binding receptor  27.64 
 
 
380 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.962079 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2829  extracellular ligand-binding receptor  27.64 
 
 
391 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.617546  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0278  extracellular ligand-binding receptor  27.64 
 
 
391 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.730585  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1681  extracellular ligand-binding receptor  25.45 
 
 
385 aa  100  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.681493  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6002  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component  30.22 
 
 
389 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.0284097 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0205  extracellular ligand-binding receptor  26.78 
 
 
380 aa  100  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2962  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.5 
 
 
380 aa  100  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49524  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2901  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  27.27 
 
 
376 aa  100  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.971399  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1639  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.5 
 
 
380 aa  100  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.516456  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2189  Extracellular ligand-binding receptor  25.54 
 
 
379 aa  100  5e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5783  extracellular ligand-binding receptor  27.35 
 
 
384 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6148  extracellular ligand-binding receptor  27.35 
 
 
384 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.392362 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2306  extracellular ligand-binding receptor  26.42 
 
 
376 aa  100  5e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3407  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.5 
 
 
380 aa  100  5e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.251793  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0398  ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  28 
 
 
391 aa  99.8  7e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000849541  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>