More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4053 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4053  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 406 aa  817    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0915  Extracellular ligand-binding receptor  72.63 
 
 		 405 aa  566  1e-160  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3706  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  72.63 
 
 		 405 aa  566  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.209947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1164  Extracellular ligand-binding receptor  70.68 
 
 		 404 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179963  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3521  extracellular ligand-binding receptor  70.99 
 
 		 400 aa  556  1e-157  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1798  extracellular ligand-binding receptor  71.8 
 
 		 402 aa  552  1e-156  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.637603  normal  0.0827017 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0612  extracellular ligand-binding receptor  71.65 
 
 		 412 aa  549  1e-155  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1838  extracellular ligand-binding receptor  68.45 
 
 		 399 aa  544  1e-154  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000495341  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0299  extracellular ligand-binding receptor  67.83 
 
 		 403 aa  542  1e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0355  extracellular ligand-binding receptor  68.93 
 
 		 394 aa  515  1.0000000000000001e-145  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1549  extracellular ligand-binding receptor  65.76 
 
 		 392 aa  483  1e-135  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.000137786  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3194  Extracellular ligand-binding receptor  56.35 
 
 		 415 aa  416  9.999999999999999e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.100454  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2712  extracellular ligand-binding receptor  53.71 
 
 		 405 aa  408  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.620726  hitchhiker  0.00485368 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1699  Extracellular ligand-binding receptor  52.23 
 
 		 410 aa  362  8e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.574188  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1770  Extracellular ligand-binding receptor  52.76 
 
 		 410 aa  362  9e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.718343  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2179  ABC branched-chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  51.71 
 
 		 410 aa  358  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.138394  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1682  extracellular ligand-binding receptor  48.97 
 
 		 410 aa  343  4e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000183641  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0480  Extracellular ligand-binding receptor  47.44 
 
 		 407 aa  334  1e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0150  extracellular ligand-binding receptor  45.75 
 
 		 417 aa  315  7e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0096  extracellular ligand-binding receptor  44.29 
 
 		 416 aa  313  2.9999999999999996e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.809601 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3230  extracellular ligand-binding receptor  44.76 
 
 		 400 aa  312  5.999999999999999e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.293864  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3577  extracellular ligand-binding receptor  44.29 
 
 		 412 aa  305  1.0000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0089  Extracellular ligand-binding receptor  45.11 
 
 		 396 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0070  extracellular ligand-binding receptor  44.84 
 
 		 396 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2081  twin-arginine translocation pathway signal  35.41 
 
 		 394 aa  217  4e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5340  Extracellular ligand-binding receptor  36.68 
 
 		 396 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.200092  normal  0.984381 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4853  extracellular ligand-binding receptor  36.68 
 
 		 396 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0291  extracellular ligand-binding receptor  39.78 
 
 		 401 aa  214  2.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.512826 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1966  Extracellular ligand-binding receptor  35.87 
 
 		 396 aa  204  3e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0542442 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3303  extracellular ligand-binding receptor  36.88 
 
 		 393 aa  200  3e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3837  extracellular ligand-binding receptor  33.6 
 
 		 395 aa  186  7e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2165  extracellular ligand-binding receptor  32.3 
 
 		 390 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3366  extracellular ligand-binding receptor  32.41 
 
 		 397 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.453868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4060  extracellular ligand-binding receptor  32.61 
 
 		 400 aa  164  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3767  Extracellular ligand-binding receptor  32.68 
 
 		 397 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1050  extracellular ligand-binding receptor  31.4 
 
 		 381 aa  150  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.464924 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0219  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.64 
 
 		 376 aa  150  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00187981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2189  Extracellular ligand-binding receptor  32.53 
 
 		 379 aa  149  6e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0680  extracellular ligand-binding receptor  31.99 
 
 		 399 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0668  extracellular ligand-binding receptor  29.19 
 
 		 392 aa  144  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.431771  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2130  extracellular ligand-binding receptor  31.98 
 
 		 380 aa  144  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.482674  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2038  Extracellular ligand-binding receptor  31.18 
 
 		 379 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000518039 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1735  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  29.5 
 
 		 378 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1823  extracellular ligand-binding receptor  31.62 
 
 		 380 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4549  Extracellular ligand-binding receptor  30.91 
 
 		 393 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0378  extracellular ligand-binding receptor  28.5 
 
 		 396 aa  139  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.432032 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1934  Extracellular ligand-binding receptor  32.49 
 
 		 397 aa  138  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000937878  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2502  extracellular ligand-binding receptor  32.11 
 
 		 399 aa  138  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.101059  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2131  extracellular ligand-binding receptor  30.25 
 
 		 379 aa  137  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0617424  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0833  extracellular ligand-binding receptor  28.61 
 
 		 383 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000252201  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2019  extracellular ligand-binding receptor  30.75 
 
 		 374 aa  135  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0893  extracellular ligand-binding receptor  31.9 
 
 		 396 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1734  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  29.55 
 
 		 380 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.534498  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5431  extracellular ligand-binding receptor  31.45 
 
 		 372 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836307  normal  0.601412 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0995  Extracellular ligand-binding receptor  30.14 
 
 		 379 aa  134  3e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.725983  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2020  extracellular ligand-binding receptor  30.45 
 
 		 384 aa  134  3e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168799 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2283  Extracellular ligand-binding receptor  31.78 
 
 		 395 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000119381 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1681  extracellular ligand-binding receptor  28.57 
 
 		 385 aa  131  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.681493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1671  extracellular ligand-binding receptor  28.57 
 
 		 379 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0805  Extracellular ligand-binding receptor  34.24 
 
 		 384 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.822655  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4808  extracellular ligand-binding receptor  30.46 
 
 		 382 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3208  Extracellular ligand-binding receptor  33.44 
 
 		 376 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0258  amino acid ABC transporter, periplasmic-binding protein  31.59 
 
 		 393 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5317  extracellular ligand-binding receptor  26.82 
 
 		 397 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.862776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2254  extracellular ligand-binding receptor  31.23 
 
 		 376 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0376  extracellular ligand-binding receptor  29.41 
 
 		 381 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000374663  hitchhiker  0.000123514 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1741  Extracellular ligand-binding receptor  31.95 
 
 		 375 aa  127  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.734186  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2086  Extracellular ligand-binding receptor  29.65 
 
 		 372 aa  127  3e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4261  extracellular ligand-binding receptor  33.03 
 
 		 373 aa  127  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3401  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  30.15 
 
 		 396 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232513  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2553  extracellular ligand-binding receptor  30.48 
 
 		 386 aa  127  4.0000000000000003e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1860  Extracellular ligand-binding receptor  29.09 
 
 		 382 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.153544  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3937  extracellular ligand-binding receptor  27.62 
 
 		 397 aa  127  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.108497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3583  extracellular ligand-binding receptor  27.62 
 
 		 397 aa  127  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.160701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1861  Extracellular ligand-binding receptor  30.09 
 
 		 379 aa  126  6e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.571716  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3822  Extracellular ligand-binding receptor  27.4 
 
 		 394 aa  126  6e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000102798  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0523  Extracellular ligand-binding receptor  29.73 
 
 		 390 aa  126  7e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0215267  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2535  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.62 
 
 		 397 aa  126  7e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0932  Extracellular ligand-binding receptor  31.19 
 
 		 376 aa  125  1e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000568006  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1520  extracellular ligand-binding receptor  30.08 
 
 		 381 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.657552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5102  extracellular ligand-binding receptor  27.69 
 
 		 397 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.294794 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1257  extracellular ligand-binding receptor  28.42 
 
 		 386 aa  125  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000744493  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4069  extracellular ligand-binding receptor  27.7 
 
 		 393 aa  124  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.236469 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3823  Extracellular ligand-binding receptor  27.75 
 
 		 394 aa  124  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00025514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2271  extracellular ligand-binding receptor  31.54 
 
 		 378 aa  124  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.731283  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1392  Extracellular ligand-binding receptor  30.97 
 
 		 382 aa  124  4e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.54413  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3654  extracellular ligand-binding receptor  30.29 
 
 		 399 aa  124  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.131877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1404  Extracellular ligand-binding receptor  27.78 
 
 		 383 aa  124  4e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1429  Extracellular ligand-binding receptor  30.71 
 
 		 386 aa  123  6e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0505624  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5995  extracellular ligand-binding receptor  33.14 
 
 		 373 aa  123  6e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.814001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1478  Extracellular ligand-binding receptor  27.94 
 
 		 405 aa  122  8e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3105  Extracellular ligand-binding receptor  28.11 
 
 		 389 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0486  extracellular ligand-binding receptor  27.06 
 
 		 374 aa  121  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.853674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2750  Extracellular ligand-binding receptor  30.77 
 
 		 375 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1650  extracellular ligand-binding receptor  29.97 
 
 		 393 aa  120  3e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.154413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0165  outative extracellular ligand binding protein  29.01 
 
 		 379 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3300  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  30.14 
 
 		 379 aa  121  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4031  putative periplasmic substrate-binding protein  29.01 
 
 		 379 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3957  putative periplasmic substrate-binding protein  29.01 
 
 		 379 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.877185  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0050  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.75 
 
 		 382 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.143388  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>