More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_4069 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_4069  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
393 aa  807    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.236469 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0833  extracellular ligand-binding receptor  46.43 
 
 
383 aa  373  1e-102  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000252201  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0668  extracellular ligand-binding receptor  46.52 
 
 
392 aa  355  1e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.431771  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1671  extracellular ligand-binding receptor  45.74 
 
 
379 aa  341  1e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1734  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  45.63 
 
 
380 aa  340  2e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.534498  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2189  Extracellular ligand-binding receptor  45.55 
 
 
379 aa  340  2e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2130  extracellular ligand-binding receptor  44.13 
 
 
380 aa  339  4e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.482674  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1823  extracellular ligand-binding receptor  45.63 
 
 
380 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2038  Extracellular ligand-binding receptor  44.2 
 
 
379 aa  332  7.000000000000001e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000518039 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1681  extracellular ligand-binding receptor  45.48 
 
 
385 aa  330  3e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.681493  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3823  Extracellular ligand-binding receptor  41.77 
 
 
394 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00025514  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2131  extracellular ligand-binding receptor  45.05 
 
 
379 aa  327  3e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0617424  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1861  Extracellular ligand-binding receptor  47.18 
 
 
379 aa  325  1e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.571716  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3822  Extracellular ligand-binding receptor  42.7 
 
 
394 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000102798  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1735  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  44.47 
 
 
378 aa  318  9e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0995  Extracellular ligand-binding receptor  43.21 
 
 
379 aa  315  8e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.725983  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1860  Extracellular ligand-binding receptor  42.93 
 
 
382 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.153544  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4549  Extracellular ligand-binding receptor  43.02 
 
 
393 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0680  extracellular ligand-binding receptor  42.82 
 
 
399 aa  309  5e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2190  Extracellular ligand-binding receptor  42.42 
 
 
379 aa  301  1e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2037  Extracellular ligand-binding receptor  42.7 
 
 
379 aa  298  1e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000596452 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3105  Extracellular ligand-binding receptor  42.13 
 
 
389 aa  297  2e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0376  extracellular ligand-binding receptor  41.28 
 
 
381 aa  292  8e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000374663  hitchhiker  0.000123514 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0378  extracellular ligand-binding receptor  40.76 
 
 
396 aa  290  2e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.432032 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1520  extracellular ligand-binding receptor  41.62 
 
 
381 aa  290  4e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.657552  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4797  extracellular ligand-binding receptor  42.13 
 
 
381 aa  288  1e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.863571  normal  0.40666 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1050  extracellular ligand-binding receptor  39.78 
 
 
381 aa  280  3e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.464924 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1478  Extracellular ligand-binding receptor  37.67 
 
 
405 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1404  Extracellular ligand-binding receptor  38.54 
 
 
383 aa  272  8.000000000000001e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0893  extracellular ligand-binding receptor  37.99 
 
 
396 aa  271  1e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2411  extracellular ligand-binding receptor  37.47 
 
 
381 aa  226  5.0000000000000005e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3329  amino-acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  36.74 
 
 
382 aa  219  5e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.279448  normal  0.702706 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3364  extracellular ligand-binding receptor  35.99 
 
 
383 aa  218  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3199  Extracellular ligand-binding receptor  36.74 
 
 
382 aa  216  5e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2943  Extracellular ligand-binding receptor  35.81 
 
 
382 aa  216  7e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.35469  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3513  extracellular ligand-binding receptor  35.36 
 
 
382 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0776121 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2316  Extracellular ligand-binding receptor  35.81 
 
 
397 aa  212  7e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1517  Extracellular ligand-binding receptor  38.02 
 
 
382 aa  211  1e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.702531  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4096  extracellular ligand-binding receptor  35.44 
 
 
379 aa  211  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0572  extracellular ligand-binding receptor  35.14 
 
 
383 aa  211  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.199084  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3525  Extracellular ligand-binding receptor  36.46 
 
 
382 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00627098 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4097  extracellular ligand-binding receptor  35.23 
 
 
379 aa  210  3e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3909  Extracellular ligand-binding receptor  34.83 
 
 
386 aa  210  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2401  extracellular ligand-binding receptor  35.73 
 
 
385 aa  206  7e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.682902 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3910  Extracellular ligand-binding receptor  35.41 
 
 
388 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0868538  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0023  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  35.66 
 
 
388 aa  204  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1230  Extracellular ligand-binding receptor  34.63 
 
 
382 aa  202  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.520921  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1328  Extracellular ligand-binding receptor  34.08 
 
 
397 aa  201  1.9999999999999998e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.125298  normal  0.0640101 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0024  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  34 
 
 
386 aa  201  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471864  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3043  extracellular ligand-binding receptor  33.17 
 
 
386 aa  199  7e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.865554  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5327  Extracellular ligand-binding receptor  33.88 
 
 
385 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0968635  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0483  Extracellular ligand-binding receptor  33.52 
 
 
411 aa  196  7e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0914571 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4234  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  32.69 
 
 
410 aa  196  7e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.408833 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0089  extracellular ligand-binding receptor  34.6 
 
 
385 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3271  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  34.71 
 
 
385 aa  194  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.262349 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0524  extracellular ligand-binding receptor  33.06 
 
 
382 aa  192  7e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0197  extracellular ligand-binding receptor  34.26 
 
 
397 aa  192  7e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0080  extracellular ligand-binding receptor  32.82 
 
 
385 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.217295  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0090  extracellular ligand-binding receptor  33.79 
 
 
385 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.230544 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0106  extracellular ligand-binding receptor  33.16 
 
 
385 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.113472  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2966  extracellular ligand-binding receptor  33.16 
 
 
385 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.106673  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0089  extracellular ligand-binding receptor  33.16 
 
 
385 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.332723  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3324  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  33.88 
 
 
385 aa  187  3e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2940  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34.44 
 
 
385 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1603  putative amino acid uptake ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34.44 
 
 
385 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1822  extracellular ligand-binding receptor  32.38 
 
 
381 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.56038  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0194  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34.44 
 
 
473 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.63329  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3986  putative amino acid uptake ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34.44 
 
 
473 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4060  putative amino acid uptake ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34.44 
 
 
473 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.377113  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3371  putative amino acid uptake ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34.44 
 
 
473 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2999  putative amino acid uptake ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34.44 
 
 
473 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2700  extracellular ligand-binding receptor  32.24 
 
 
390 aa  182  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.322471  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3951  extracellular ligand-binding receptor  33.89 
 
 
385 aa  180  4e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.757866  normal  0.707301 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2820  extracellular ligand-binding receptor  31.88 
 
 
389 aa  179  5.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2428  amino acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  30.25 
 
 
389 aa  178  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2232  amino acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  30.79 
 
 
389 aa  178  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2494  Extracellular ligand-binding receptor  31.3 
 
 
379 aa  176  5e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.564109  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4630  extracellular ligand-binding receptor  33.16 
 
 
383 aa  176  7e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.511173  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2692  putative amino acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  30.52 
 
 
389 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.407877  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0158  Extracellular ligand-binding receptor  31.32 
 
 
387 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0165  Extracellular ligand-binding receptor  31.04 
 
 
387 aa  172  7.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0779  extracellular ligand-binding receptor  32.35 
 
 
383 aa  172  9e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0441144  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0900  extracellular ligand-binding receptor  32.78 
 
 
379 aa  167  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  9.53304e-16  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6271  putative amino-acid ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.45 
 
 
381 aa  166  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0968  ABC branched chain amino acid family transporter, periplasmic ligand binding protein  31.86 
 
 
389 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3892  extracellular ligand-binding receptor  30.71 
 
 
381 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3666  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.86 
 
 
389 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.279436  normal  0.958773 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0515  Extracellular ligand-binding receptor  30.14 
 
 
377 aa  162  8.000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.815299  normal  0.447794 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0502  Extracellular ligand-binding receptor  29.59 
 
 
377 aa  159  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.836386 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0692  extracellular ligand-binding receptor  29.33 
 
 
379 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3241  extracellular ligand-binding receptor  31.04 
 
 
381 aa  157  3e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000702514  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1504  Extracellular ligand-binding receptor  29.29 
 
 
387 aa  157  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235771  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1003  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.67 
 
 
382 aa  157  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.437001  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2237  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.75 
 
 
395 aa  156  6e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.937762  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1889  extracellular ligand-binding receptor  28.53 
 
 
385 aa  153  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.808445  normal  0.559234 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3575  extracellular ligand-binding receptor  30.95 
 
 
385 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.807298  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0904  extracellular ligand-binding receptor  31.69 
 
 
377 aa  147  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00289706  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1501  Extracellular ligand-binding receptor  29.44 
 
 
381 aa  147  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.225006  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7089  putative branched-chain amino acid transport protein  31.44 
 
 
381 aa  147  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.499249  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0299  extracellular ligand-binding receptor  28.9 
 
 
403 aa  146  6e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102439  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>