More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0833 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0833  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 383 aa  786    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000252201  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1734  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  49.46 
 
 		 380 aa  373  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.534498  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4069  extracellular ligand-binding receptor  46.43 
 
 		 393 aa  373  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.236469 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2130  extracellular ligand-binding receptor  45.03 
 
 		 380 aa  356  3.9999999999999996e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.482674  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1860  Extracellular ligand-binding receptor  48.04 
 
 		 382 aa  355  8.999999999999999e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.153544  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2189  Extracellular ligand-binding receptor  46.68 
 
 		 379 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1823  extracellular ligand-binding receptor  48.73 
 
 		 380 aa  352  5e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2038  Extracellular ligand-binding receptor  46.42 
 
 		 379 aa  352  8e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000518039 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2131  extracellular ligand-binding receptor  45.81 
 
 		 379 aa  349  5e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0617424  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1671  extracellular ligand-binding receptor  45.29 
 
 		 379 aa  348  8e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0995  Extracellular ligand-binding receptor  47.18 
 
 		 379 aa  348  1e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.725983  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1681  extracellular ligand-binding receptor  45.31 
 
 		 385 aa  343  2.9999999999999997e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.681493  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1735  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  47.07 
 
 		 378 aa  339  4e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3823  Extracellular ligand-binding receptor  45.25 
 
 		 394 aa  333  2e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00025514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4549  Extracellular ligand-binding receptor  47.65 
 
 		 393 aa  333  3e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0680  extracellular ligand-binding receptor  48.88 
 
 		 399 aa  332  5e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1861  Extracellular ligand-binding receptor  45.74 
 
 		 379 aa  332  6e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.571716  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0668  extracellular ligand-binding receptor  45.23 
 
 		 392 aa  332  9e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.431771  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2190  Extracellular ligand-binding receptor  44.74 
 
 		 379 aa  330  3e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4797  extracellular ligand-binding receptor  47.21 
 
 		 381 aa  327  3e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.863571  normal  0.40666 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2037  Extracellular ligand-binding receptor  45.2 
 
 		 379 aa  322  5e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000596452 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0376  extracellular ligand-binding receptor  42.45 
 
 		 381 aa  306  3e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000374663  hitchhiker  0.000123514 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0893  extracellular ligand-binding receptor  43.14 
 
 		 396 aa  307  3e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1520  extracellular ligand-binding receptor  42.78 
 
 		 381 aa  296  5e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.657552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3822  Extracellular ligand-binding receptor  38.81 
 
 		 394 aa  293  5e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000102798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3105  Extracellular ligand-binding receptor  39.78 
 
 		 389 aa  289  5.0000000000000004e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1404  Extracellular ligand-binding receptor  38.34 
 
 		 383 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0378  extracellular ligand-binding receptor  40.26 
 
 		 396 aa  276  6e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.432032 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1050  extracellular ligand-binding receptor  38.38 
 
 		 381 aa  271  1e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.464924 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1478  Extracellular ligand-binding receptor  36.59 
 
 		 405 aa  258  2e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2411  extracellular ligand-binding receptor  38.46 
 
 		 381 aa  224  2e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3199  Extracellular ligand-binding receptor  36.67 
 
 		 382 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3525  Extracellular ligand-binding receptor  36.94 
 
 		 382 aa  212  7e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00627098 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3329  amino-acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  36.11 
 
 		 382 aa  212  1e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.279448  normal  0.702706 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3364  extracellular ligand-binding receptor  35.33 
 
 		 383 aa  209  7e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2401  extracellular ligand-binding receptor  35.81 
 
 		 385 aa  208  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.682902 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1230  Extracellular ligand-binding receptor  36.91 
 
 		 382 aa  205  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.520921  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3513  extracellular ligand-binding receptor  35.28 
 
 		 382 aa  201  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0776121 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2943  Extracellular ligand-binding receptor  35.18 
 
 		 382 aa  201  9.999999999999999e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.35469  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4096  extracellular ligand-binding receptor  35.36 
 
 		 379 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2316  Extracellular ligand-binding receptor  35 
 
 		 397 aa  198  1.0000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0023  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  32.99 
 
 		 388 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3043  extracellular ligand-binding receptor  32.23 
 
 		 386 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.865554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0572  extracellular ligand-binding receptor  34.99 
 
 		 383 aa  197  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.199084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3910  Extracellular ligand-binding receptor  33.5 
 
 		 388 aa  197  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0868538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0524  extracellular ligand-binding receptor  32.53 
 
 		 382 aa  195  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3951  extracellular ligand-binding receptor  35.92 
 
 		 385 aa  195  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.757866  normal  0.707301 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0024  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  33.25 
 
 		 386 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1328  Extracellular ligand-binding receptor  34.18 
 
 		 397 aa  194  2e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.125298  normal  0.0640101 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4097  extracellular ligand-binding receptor  33.6 
 
 		 379 aa  192  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1517  Extracellular ligand-binding receptor  33.61 
 
 		 382 aa  191  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.702531  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2232  amino acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  30.71 
 
 		 389 aa  189  8e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3909  Extracellular ligand-binding receptor  32.9 
 
 		 386 aa  189  8e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0106  extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 		 385 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.113472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2966  extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 		 385 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.106673  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0089  extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 		 385 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.332723  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0080  extracellular ligand-binding receptor  32.81 
 
 		 385 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.217295  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3271  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  33.07 
 
 		 385 aa  187  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.262349 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2820  extracellular ligand-binding receptor  31.77 
 
 		 389 aa  186  7e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2692  putative amino acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  30.16 
 
 		 389 aa  186  8e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.407877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5327  Extracellular ligand-binding receptor  33.42 
 
 		 385 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0968635  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4234  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.86 
 
 		 410 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.408833 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2700  extracellular ligand-binding receptor  32.18 
 
 		 390 aa  184  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.322471  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0090  extracellular ligand-binding receptor  32.19 
 
 		 385 aa  184  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.230544 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0483  Extracellular ligand-binding receptor  31.43 
 
 		 411 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0914571 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3324  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.38 
 
 		 385 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0089  extracellular ligand-binding receptor  33.24 
 
 		 385 aa  182  6e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2428  amino acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  28.8 
 
 		 389 aa  182  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1822  extracellular ligand-binding receptor  33.7 
 
 		 381 aa  182  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.56038  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2940  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.89 
 
 		 385 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1603  putative amino acid uptake ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.89 
 
 		 385 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3371  putative amino acid uptake ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.89 
 
 		 473 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0194  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.89 
 
 		 473 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.63329  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2999  putative amino acid uptake ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.89 
 
 		 473 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4060  putative amino acid uptake ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.89 
 
 		 473 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.377113  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3986  putative amino acid uptake ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.89 
 
 		 473 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0197  extracellular ligand-binding receptor  32.13 
 
 		 397 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2494  Extracellular ligand-binding receptor  31.69 
 
 		 379 aa  169  6e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.564109  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3666  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.27 
 
 		 389 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.279436  normal  0.958773 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0968  ABC branched chain amino acid family transporter, periplasmic ligand binding protein  30.73 
 
 		 389 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0158  Extracellular ligand-binding receptor  29.83 
 
 		 387 aa  160  4e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0165  Extracellular ligand-binding receptor  29.83 
 
 		 387 aa  160  5e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1889  extracellular ligand-binding receptor  27.51 
 
 		 385 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.808445  normal  0.559234 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3257  putative branched-chain amino acid transport system substrate-binding protein  29.16 
 
 		 384 aa  152  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3892  extracellular ligand-binding receptor  30.48 
 
 		 381 aa  150  4e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2237  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.11 
 
 		 395 aa  150  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.937762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0904  extracellular ligand-binding receptor  33.15 
 
 		 377 aa  150  5e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00289706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0779  extracellular ligand-binding receptor  27.3 
 
 		 383 aa  150  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0441144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4630  extracellular ligand-binding receptor  26.91 
 
 		 383 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.511173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1003  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.71 
 
 		 382 aa  149  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.437001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0350  extracellular ligand-binding receptor  28.08 
 
 		 376 aa  149  8e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000281139  normal  0.291499 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1991  Extracellular ligand-binding receptor  28.28 
 
 		 385 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179885  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6271  putative amino-acid ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.82 
 
 		 381 aa  145  8.000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0299  extracellular ligand-binding receptor  28.17 
 
 		 403 aa  145  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0692  extracellular ligand-binding receptor  28.39 
 
 		 379 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7089  putative branched-chain amino acid transport protein  28.28 
 
 		 381 aa  143  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.499249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3575  extracellular ligand-binding receptor  27.97 
 
 		 385 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.807298  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0355  extracellular ligand-binding receptor  28.5 
 
 		 394 aa  139  6e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1549  extracellular ligand-binding receptor  27.15 
 
 		 392 aa  139  7.999999999999999e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.000137786  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1838  extracellular ligand-binding receptor  29.5 
 
 		 399 aa  139  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000495341  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>