More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3057 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_3057  Extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
398 aa  797    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2240  extracellular ligand-binding receptor  54.48 
 
 
394 aa  421  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2556  branched chain amino acid ABC transporter (substrate-binding protein)  51.69 
 
 
392 aa  389  1e-107  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00169682  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2502  extracellular ligand-binding receptor  51.84 
 
 
399 aa  388  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.101059  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1388  Extracellular ligand-binding receptor  51.37 
 
 
390 aa  359  4e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0615347  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0523  Extracellular ligand-binding receptor  50.98 
 
 
390 aa  357  2.9999999999999997e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0215267  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1392  extracellular ligand-binding receptor  46.37 
 
 
386 aa  347  2e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4261  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  47.62 
 
 
404 aa  340  2e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4416  Extracellular ligand-binding receptor  47.62 
 
 
404 aa  341  2e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4395  Extracellular ligand-binding receptor  47.9 
 
 
404 aa  340  4e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0932  Extracellular ligand-binding receptor  49.15 
 
 
376 aa  328  9e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000568006  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2019  extracellular ligand-binding receptor  46.76 
 
 
374 aa  328  1.0000000000000001e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2306  Extracellular ligand-binding receptor  45.53 
 
 
419 aa  325  1e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.110917  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4416  extracellular ligand-binding receptor  45.2 
 
 
402 aa  325  1e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.859568  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2020  extracellular ligand-binding receptor  46.29 
 
 
384 aa  323  3e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.168799 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0635  Extracellular ligand-binding receptor  44.78 
 
 
378 aa  285  8e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000043194  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0862  extracellular ligand-binding receptor  41.64 
 
 
375 aa  285  9e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2428  Extracellular ligand-binding receptor  43.81 
 
 
381 aa  282  7.000000000000001e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.632762  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0265  extracellular ligand-binding receptor  43.33 
 
 
376 aa  274  2.0000000000000002e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000854786  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0805  Extracellular ligand-binding receptor  46.54 
 
 
384 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.822655  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0398  ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  40.37 
 
 
391 aa  269  5.9999999999999995e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000849541  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1610  extracellular ligand-binding receptor  41.64 
 
 
370 aa  268  1e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000136446  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2935  extracellular ligand-binding receptor  43.44 
 
 
386 aa  267  2e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.412779  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1582  branched-chain amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  41.33 
 
 
388 aa  267  2e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000809144  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1429  Extracellular ligand-binding receptor  38.86 
 
 
386 aa  265  1e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0505624  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1065  Extracellular ligand-binding receptor  42.11 
 
 
381 aa  259  4e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000196823  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1676  extracellular ligand-binding receptor  41.08 
 
 
370 aa  258  1e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000661006  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0610  Extracellular ligand-binding receptor  41.29 
 
 
378 aa  257  3e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3105  extracellular ligand-binding receptor  40.81 
 
 
389 aa  257  3e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.64702 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0611  Extracellular ligand-binding receptor  42.34 
 
 
371 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1468  extracellular ligand-binding receptor  40.11 
 
 
369 aa  251  1e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000538626  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2114  Extracellular ligand-binding receptor  40.6 
 
 
405 aa  247  3e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.447818  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0460  Extracellular ligand-binding receptor  38.96 
 
 
375 aa  244  9.999999999999999e-64  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1469  extracellular ligand-binding receptor  40.4 
 
 
370 aa  242  7e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000103418  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1166  Extracellular ligand-binding receptor  37.07 
 
 
387 aa  242  9e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.428965 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3401  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  41.01 
 
 
396 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232513  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3294  hypothetical protein  39.17 
 
 
383 aa  239  4e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.953272  normal  0.0380984 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3728  extracellular ligand-binding receptor  39.26 
 
 
392 aa  235  9e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.172455  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0522  Extracellular ligand-binding receptor  36.93 
 
 
387 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0475  Extracellular ligand-binding receptor  37.36 
 
 
372 aa  229  8e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000158967  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0480  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component  37.85 
 
 
391 aa  229  8e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.199357  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1162  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  36.52 
 
 
369 aa  228  1e-58  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.438916  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0770  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  36.52 
 
 
369 aa  228  1e-58  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.132066  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1037  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  36.52 
 
 
369 aa  228  1e-58  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.148346  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1891  branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic protein  38.83 
 
 
395 aa  228  2e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1038  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34.83 
 
 
371 aa  227  2e-58  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0869251  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2283  Extracellular ligand-binding receptor  36.94 
 
 
395 aa  224  2e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000119381 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0769  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34.27 
 
 
371 aa  224  3e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0554402  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0562  extracellular ligand-binding receptor  36.39 
 
 
385 aa  223  3e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.419655  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1934  Extracellular ligand-binding receptor  38.38 
 
 
397 aa  223  3e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000937878  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1163  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34.55 
 
 
371 aa  223  6e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.860982  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1490  Extracellular ligand-binding receptor  34.93 
 
 
372 aa  220  3.9999999999999997e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000299787  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0399  branched-chain amino-acid ABC transport system periplasmic binding protein  36.03 
 
 
372 aa  218  1e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1110  branched-chain amino-acid ABC transporter, periplasmic binding protein  32.58 
 
 
370 aa  213  3.9999999999999995e-54  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2306  extracellular ligand-binding receptor  30 
 
 
376 aa  210  3e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1720  extracellular ligand-binding receptor  35.16 
 
 
396 aa  208  1e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.565956  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2113  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  33.08 
 
 
399 aa  204  2e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2305  extracellular ligand-binding receptor  34.64 
 
 
380 aa  204  3e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1392  Extracellular ligand-binding receptor  34.6 
 
 
382 aa  202  8e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.54413  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1111  branched-chain amino-acid ABC transporter, periplasmic binding protein  32.02 
 
 
371 aa  193  4e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3536  extracellular ligand-binding receptor  33.51 
 
 
388 aa  191  1e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000357876  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0331  Extracellular ligand-binding receptor  37.68 
 
 
377 aa  189  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179963  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2271  extracellular ligand-binding receptor  37.85 
 
 
378 aa  186  4e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.731283  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2323  extracellular ligand-binding receptor  28.82 
 
 
383 aa  181  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0533  Extracellular ligand-binding receptor  33.24 
 
 
393 aa  180  4e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000200352 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3654  extracellular ligand-binding receptor  35.79 
 
 
399 aa  180  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.131877  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0317  extracellular ligand-binding receptor  32.72 
 
 
382 aa  179  8e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00438106  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1131  extracellular ligand-binding receptor  34.45 
 
 
389 aa  173  5e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4331  extracellular ligand-binding receptor  34.83 
 
 
373 aa  172  9e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2022  Extracellular ligand-binding receptor  33.53 
 
 
373 aa  172  1e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.882154  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1730  extracellular ligand-binding receptor  35.77 
 
 
393 aa  172  1e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.145058  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2867  extracellular ligand-binding receptor  34.93 
 
 
401 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.867317  normal  0.705839 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2729  extracellular ligand-binding receptor  35.31 
 
 
400 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1137  Extracellular ligand-binding receptor  34.01 
 
 
393 aa  166  9e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0165472  normal  0.816566 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2319  Extracellular ligand-binding receptor  35.21 
 
 
401 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.405352  hitchhiker  0.00559033 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2962  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34.64 
 
 
380 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49524  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1639  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34.64 
 
 
380 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.516456  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3407  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34.64 
 
 
380 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.251793  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2901  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  34.64 
 
 
376 aa  163  6e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.971399  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5831  extracellular ligand-binding receptor  34.73 
 
 
384 aa  162  9e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.468117  normal  0.310951 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3253  extracellular ligand-binding receptor  34.14 
 
 
373 aa  162  9e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.363046 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6057  extracellular ligand-binding receptor  34.73 
 
 
384 aa  162  9e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2606  Extracellular ligand-binding receptor  34.14 
 
 
373 aa  162  9e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0170435  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0588  extracellular ligand-binding receptor  34.09 
 
 
399 aa  162  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.833048  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6079  extracellular ligand-binding receptor  34.82 
 
 
384 aa  162  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.829496  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0051  outative extracellular ligand binding protein  34.64 
 
 
380 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0112  extracellular ligand-binding receptor  34.37 
 
 
381 aa  162  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3912  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34.64 
 
 
380 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2709  Extracellular ligand-binding receptor  34.93 
 
 
401 aa  162  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3831  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34.64 
 
 
380 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2254  extracellular ligand-binding receptor  35.71 
 
 
376 aa  161  1e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4758  extracellular ligand-binding receptor  35.5 
 
 
382 aa  161  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.467075  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4303  branched-chain amino acid transport protein BraC  33.63 
 
 
373 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3158  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  34.36 
 
 
380 aa  160  4e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0067  Extracellular ligand-binding receptor  34.19 
 
 
376 aa  160  5e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188079 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5603  Extracellular ligand-binding receptor  29.71 
 
 
393 aa  160  5e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.442467  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0393  Extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 
381 aa  159  6e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6628  extracellular ligand-binding receptor  34.92 
 
 
384 aa  159  8e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.733405 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0095  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  32.82 
 
 
399 aa  159  8e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.237273 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0260  extracellular ligand-binding receptor  33.89 
 
 
380 aa  159  8e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.962079 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>