More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2709 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2441  putative amino acid-binding periplasmic ABC transporter protein  94.05 
 
 		 336 aa  636    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2729  extracellular ligand-binding receptor  87.78 
 
 		 400 aa  680    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2319  Extracellular ligand-binding receptor  99.75 
 
 		 401 aa  793    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.405352  hitchhiker  0.00559033 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2867  extracellular ligand-binding receptor  89.53 
 
 		 401 aa  697    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.867317  normal  0.705839 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2709  Extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 401 aa  795    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0588  extracellular ligand-binding receptor  77.56 
 
 		 399 aa  618  1e-176  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.833048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0821  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  77.31 
 
 		 399 aa  615  1e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3145  Extracellular ligand-binding receptor  74.06 
 
 		 399 aa  597  1e-169  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00633656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1730  extracellular ligand-binding receptor  72.57 
 
 		 393 aa  577  1.0000000000000001e-163  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.145058  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0393  Extracellular ligand-binding receptor  71.82 
 
 		 381 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4327  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  71.57 
 
 		 402 aa  568  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0112  extracellular ligand-binding receptor  71.57 
 
 		 381 aa  570  1e-161  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3381  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  75.14 
 
 		 380 aa  541  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3654  extracellular ligand-binding receptor  68.16 
 
 		 399 aa  542  1e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.131877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0186  extracellular ligand-binding receptor  75.14 
 
 		 380 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000207737 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3158  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  74.29 
 
 		 380 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0192  extracellular ligand-binding receptor  74.58 
 
 		 380 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3407  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  74.01 
 
 		 380 aa  535  1e-151  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.251793  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1639  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  74.01 
 
 		 380 aa  535  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.516456  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3912  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  74.29 
 
 		 380 aa  537  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2901  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  74.01 
 
 		 376 aa  535  1e-151  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.971399  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0051  outative extracellular ligand binding protein  74.29 
 
 		 380 aa  537  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2962  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  74.01 
 
 		 380 aa  535  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49524  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3831  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  74.29 
 
 		 380 aa  537  1e-151  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0205  extracellular ligand-binding receptor  74.58 
 
 		 380 aa  537  1e-151  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2829  extracellular ligand-binding receptor  74.86 
 
 		 391 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.617546  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0260  extracellular ligand-binding receptor  74.86 
 
 		 380 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.962079 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0278  extracellular ligand-binding receptor  74.86 
 
 		 391 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.730585  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0660  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  72.03 
 
 		 380 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.792803  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1102  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  72.03 
 
 		 380 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391264  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2389  outative extracellular ligand binding protein  72.03 
 
 		 372 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1178  outative extracellular ligand binding protein  72.03 
 
 		 380 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1598  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  71.75 
 
 		 378 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0805  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  72.03 
 
 		 380 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.351699  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1769  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  72.03 
 
 		 380 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6148  extracellular ligand-binding receptor  71.75 
 
 		 384 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.392362 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6628  extracellular ligand-binding receptor  70.62 
 
 		 384 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.733405 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7692  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  70.62 
 
 		 384 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.854568 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5783  extracellular ligand-binding receptor  71.75 
 
 		 384 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5831  extracellular ligand-binding receptor  69.77 
 
 		 384 aa  502  1e-141  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.468117  normal  0.310951 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6057  extracellular ligand-binding receptor  69.77 
 
 		 384 aa  502  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6079  extracellular ligand-binding receptor  70.34 
 
 		 384 aa  503  1e-141  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.829496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2945  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  68.93 
 
 		 377 aa  500  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.994918 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5105  extracellular ligand-binding receptor  67.23 
 
 		 381 aa  498  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.140418  decreased coverage  0.00222912 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6110  extracellular ligand-binding receptor  66.12 
 
 		 369 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4030  extracellular ligand-binding receptor  67.61 
 
 		 386 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.229342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3492  extracellular ligand-binding receptor  67.33 
 
 		 386 aa  482  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.839805 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4758  extracellular ligand-binding receptor  65.95 
 
 		 382 aa  478  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.467075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4469  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  67.13 
 
 		 404 aa  478  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4231  Extracellular ligand-binding receptor  64.59 
 
 		 384 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6407  Extracellular ligand-binding receptor  66.95 
 
 		 380 aa  462  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3401  extracellular ligand-binding receptor  61.15 
 
 		 381 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.526257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0270  extracellular ligand-binding receptor  57.25 
 
 		 460 aa  425  1e-118  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.186259  normal  0.56965 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2592  extracellular ligand-binding receptor  56.52 
 
 		 398 aa  414  1e-114  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0214076 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2471  Extracellular ligand-binding receptor  58 
 
 		 371 aa  413  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2733  Extracellular ligand-binding receptor  53.96 
 
 		 401 aa  405  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464024  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2101  Extracellular ligand-binding receptor  55.05 
 
 		 380 aa  400  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2166  extracellular ligand-binding receptor  56.02 
 
 		 376 aa  395  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.0643115 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2411  extracellular ligand-binding receptor  54.34 
 
 		 376 aa  387  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.32979  normal  0.572085 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4919  extracellular ligand-binding receptor  53.69 
 
 		 376 aa  385  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4914  extracellular ligand-binding receptor  51.92 
 
 		 375 aa  384  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.113346  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1940  putative secreted substrate binding protein  54.39 
 
 		 375 aa  383  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.15659  normal  0.0532415 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0371  extracellular ligand-binding receptor  53.28 
 
 		 383 aa  384  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3159  extracellular ligand-binding receptor  55.52 
 
 		 376 aa  378  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3346  extracellular ligand-binding receptor  54.89 
 
 		 380 aa  377  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3860  extracellular ligand-binding receptor  52.86 
 
 		 381 aa  378  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2119  extracellular ligand-binding receptor  52.41 
 
 		 376 aa  372  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00221988  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1592  leucine-specific binding precursor transmembrane protein  51.66 
 
 		 380 aa  365  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1728  Extracellular ligand-binding receptor  53.58 
 
 		 375 aa  368  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3084  extracellular ligand-binding receptor  50 
 
 		 386 aa  363  2e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0552294  normal  0.474312 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1925  extracellular ligand-binding receptor  51.69 
 
 		 377 aa  363  2e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0315464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2197  extracellular ligand-binding receptor  50.99 
 
 		 376 aa  359  4e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.974618 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3300  putative amino-acid transport signal peptide protein  50.67 
 
 		 377 aa  358  9.999999999999999e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3170  Extracellular ligand-binding receptor  51.12 
 
 		 381 aa  355  5.999999999999999e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3886  Extracellular ligand-binding receptor  52.29 
 
 		 382 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3495  Extracellular ligand-binding receptor  51.4 
 
 		 381 aa  354  2e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0050  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  52.29 
 
 		 382 aa  353  2e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.143388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3488  extracellular ligand-binding receptor  52 
 
 		 383 aa  351  1e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.761675 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3017  extracellular ligand-binding receptor  52 
 
 		 382 aa  348  8e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3339  extracellular ligand-binding receptor  51.43 
 
 		 383 aa  347  2e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0137407  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0165  outative extracellular ligand binding protein  52.82 
 
 		 379 aa  347  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1023  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  50.29 
 
 		 373 aa  347  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.116287 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4031  putative periplasmic substrate-binding protein  52.82 
 
 		 379 aa  347  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3957  putative periplasmic substrate-binding protein  52.82 
 
 		 379 aa  347  2e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.877185  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5665  extracellular ligand-binding receptor  50.74 
 
 		 380 aa  346  4e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3300  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  52.52 
 
 		 379 aa  346  4e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2966  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  52.52 
 
 		 375 aa  345  6e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3027  putative periplasmic substrate-binding protein  52.52 
 
 		 379 aa  345  6e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3344  putative periplasmic substrate-binding protein  52.52 
 
 		 379 aa  345  6e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1575  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  52.52 
 
 		 379 aa  345  6e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5695  Extracellular ligand-binding receptor  50.29 
 
 		 373 aa  344  2e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.348726 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3295  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  51.63 
 
 		 379 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0114756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4359  extracellular ligand-binding receptor  51.14 
 
 		 373 aa  342  1e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4008  extracellular ligand-binding receptor  51.14 
 
 		 373 aa  342  1e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.746913  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0115  extracellular ligand-binding receptor  51.34 
 
 		 379 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4261  extracellular ligand-binding receptor  50.72 
 
 		 373 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0113  extracellular ligand-binding receptor  50.74 
 
 		 379 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5995  extracellular ligand-binding receptor  51.27 
 
 		 373 aa  338  8e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.814001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0104  extracellular ligand-binding receptor  50.45 
 
 		 379 aa  338  9e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2121  outative extracellular ligand binding protein  49.42 
 
 		 405 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0914412  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>