More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0399 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0399  branched-chain amino-acid ABC transport system periplasmic binding protein  100 
 
 
372 aa  754    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1490  Extracellular ligand-binding receptor  58.6 
 
 
372 aa  462  1e-129  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000299787  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0475  Extracellular ligand-binding receptor  61.02 
 
 
372 aa  460  9.999999999999999e-129  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000158967  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1038  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  57.53 
 
 
371 aa  457  1e-127  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0869251  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1110  branched-chain amino-acid ABC transporter, periplasmic binding protein  59.15 
 
 
370 aa  457  1e-127  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1163  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  56.18 
 
 
371 aa  448  1e-125  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.860982  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0769  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  56.45 
 
 
371 aa  448  1e-125  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0554402  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1162  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  56.13 
 
 
369 aa  436  1e-121  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.438916  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0770  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  55.56 
 
 
369 aa  435  1e-121  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.132066  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1037  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  56.13 
 
 
369 aa  436  1e-121  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.148346  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1111  branched-chain amino-acid ABC transporter, periplasmic binding protein  52.96 
 
 
371 aa  417  9.999999999999999e-116  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0610  Extracellular ligand-binding receptor  43.41 
 
 
378 aa  310  4e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0862  extracellular ligand-binding receptor  40.45 
 
 
375 aa  273  5.000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1610  extracellular ligand-binding receptor  38.91 
 
 
370 aa  241  1e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000136446  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1676  extracellular ligand-binding receptor  37.61 
 
 
370 aa  241  2e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000661006  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1468  extracellular ligand-binding receptor  36.63 
 
 
369 aa  231  2e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000538626  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2019  extracellular ligand-binding receptor  34.56 
 
 
374 aa  229  7e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0523  Extracellular ligand-binding receptor  36.91 
 
 
390 aa  222  8e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0215267  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1065  Extracellular ligand-binding receptor  37.01 
 
 
381 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000196823  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3057  Extracellular ligand-binding receptor  36.03 
 
 
398 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0635  Extracellular ligand-binding receptor  34.56 
 
 
378 aa  219  8.999999999999998e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000043194  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1469  extracellular ligand-binding receptor  34.58 
 
 
370 aa  218  1e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000103418  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2935  extracellular ligand-binding receptor  35.13 
 
 
386 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.412779  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2240  extracellular ligand-binding receptor  35.89 
 
 
394 aa  207  3e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0265  extracellular ligand-binding receptor  32.63 
 
 
376 aa  206  4e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000854786  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1388  Extracellular ligand-binding receptor  34.99 
 
 
390 aa  204  1e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0615347  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0611  Extracellular ligand-binding receptor  32.7 
 
 
371 aa  199  6e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4416  extracellular ligand-binding receptor  33.89 
 
 
402 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.859568  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2020  extracellular ligand-binding receptor  34.37 
 
 
384 aa  194  2e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.168799 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2306  Extracellular ligand-binding receptor  31.43 
 
 
419 aa  193  4e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.110917  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2502  extracellular ligand-binding receptor  33.61 
 
 
399 aa  184  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.101059  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4261  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  32.03 
 
 
404 aa  183  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4416  Extracellular ligand-binding receptor  32.59 
 
 
404 aa  182  8.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4395  Extracellular ligand-binding receptor  32.31 
 
 
404 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1392  extracellular ligand-binding receptor  31.84 
 
 
386 aa  181  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0932  Extracellular ligand-binding receptor  32.5 
 
 
376 aa  178  1e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000568006  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3401  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  33.43 
 
 
396 aa  176  8e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232513  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1934  Extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 
397 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000937878  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0398  ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  31.97 
 
 
391 aa  171  1e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000849541  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2283  Extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 
395 aa  171  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000119381 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0460  Extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 
375 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1891  branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic protein  32.49 
 
 
395 aa  164  3e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2305  extracellular ligand-binding receptor  29.81 
 
 
380 aa  160  3e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1429  Extracellular ligand-binding receptor  28.77 
 
 
386 aa  157  2e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0505624  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2428  Extracellular ligand-binding receptor  32.49 
 
 
381 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.632762  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2556  branched chain amino acid ABC transporter (substrate-binding protein)  30.73 
 
 
392 aa  155  1e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00169682  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0480  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component  29.56 
 
 
391 aa  155  1e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.199357  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1720  extracellular ligand-binding receptor  30.79 
 
 
396 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.565956  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1582  branched-chain amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  30.7 
 
 
388 aa  150  3e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000809144  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3294  hypothetical protein  31.44 
 
 
383 aa  150  5e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.953272  normal  0.0380984 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3105  extracellular ligand-binding receptor  28.5 
 
 
389 aa  144  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.64702 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3728  extracellular ligand-binding receptor  33.15 
 
 
392 aa  142  7e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.172455  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2306  extracellular ligand-binding receptor  27.61 
 
 
376 aa  141  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0805  Extracellular ligand-binding receptor  29.92 
 
 
384 aa  138  1e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.822655  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2114  Extracellular ligand-binding receptor  29.02 
 
 
405 aa  139  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.447818  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0533  Extracellular ligand-binding receptor  29.4 
 
 
393 aa  136  7.000000000000001e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000200352 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2022  Extracellular ligand-binding receptor  31.99 
 
 
373 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.882154  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0050  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.08 
 
 
382 aa  134  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.143388  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0522  Extracellular ligand-binding receptor  27.37 
 
 
387 aa  134  3e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1248  extracellular ligand-binding receptor  35.29 
 
 
375 aa  133  5e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3886  Extracellular ligand-binding receptor  29.55 
 
 
382 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2254  extracellular ligand-binding receptor  27.93 
 
 
376 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3017  extracellular ligand-binding receptor  30.51 
 
 
382 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4303  branched-chain amino acid transport protein BraC  31.73 
 
 
373 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3208  Extracellular ligand-binding receptor  27.19 
 
 
376 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50520  branched-chain amino acid transport protein BraC  31.18 
 
 
373 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592692 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0562  extracellular ligand-binding receptor  26.29 
 
 
385 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.419655  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3668  branched chain amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  29.14 
 
 
371 aa  127  3e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.210463  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3974  extracellular ligand-binding receptor  29.14 
 
 
371 aa  126  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0098  Extracellular ligand-binding receptor  32.58 
 
 
370 aa  126  6e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0727  extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 
370 aa  125  8.000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4659  extracellular ligand-binding receptor  31.71 
 
 
378 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00580673 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0228  extracellular ligand-binding receptor  30.29 
 
 
371 aa  125  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.701374 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0244  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic leucine-specific-binding protein  29.14 
 
 
371 aa  125  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4276  extracellular ligand-binding receptor  32.4 
 
 
371 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4923  extracellular ligand-binding receptor  31.71 
 
 
378 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000164326 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1175  extracellular ligand-binding receptor  34.56 
 
 
371 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.343144  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4867  extracellular ligand-binding receptor  33.9 
 
 
378 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0924005  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6079  extracellular ligand-binding receptor  31.49 
 
 
384 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.829496  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1158  extracellular ligand-binding receptor  32.68 
 
 
371 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0616664  normal  0.0422789 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5831  extracellular ligand-binding receptor  31.18 
 
 
384 aa  125  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.468117  normal  0.310951 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4745  extracellular ligand-binding receptor  33.9 
 
 
378 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000119526 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6057  extracellular ligand-binding receptor  31.18 
 
 
384 aa  125  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03309  leucine/isoleucine/valine transporter subunit  31.43 
 
 
367 aa  124  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0255  Extracellular ligand-binding receptor  31.43 
 
 
367 aa  124  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4780  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic Leu/Ile/Val-binding protein LivJ  31.43 
 
 
367 aa  124  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3942  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic Leu/Ile/Val-binding protein LivJ  31.43 
 
 
367 aa  124  3e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03262  hypothetical protein  31.43 
 
 
367 aa  124  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0256  extracellular ligand-binding receptor  31.43 
 
 
367 aa  124  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3743  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic Leu/Ile/Val-binding protein LivJ  31.43 
 
 
367 aa  124  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0317  extracellular ligand-binding receptor  26.02 
 
 
382 aa  124  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00438106  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3659  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic Leu/Ile/Val-binding protein LivJ  31.43 
 
 
367 aa  124  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2471  Extracellular ligand-binding receptor  30.1 
 
 
371 aa  123  5e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3862  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic Leu/Ile/Val-binding protein LivJ  31.07 
 
 
367 aa  123  6e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1141  extracellular ligand-binding receptor  34.19 
 
 
371 aa  123  6e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.209837 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1166  Extracellular ligand-binding receptor  25.33 
 
 
387 aa  123  6e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.428965 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3863  extracellular ligand-binding receptor  30.5 
 
 
366 aa  123  6e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0437256 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2901  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  30.59 
 
 
376 aa  122  8e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.971399  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3158  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  30.88 
 
 
380 aa  122  8e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3407  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.59 
 
 
380 aa  122  8e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.251793  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>