More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5831 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008544  Bcen2424_6148  extracellular ligand-binding receptor  95.05 
 
 		 384 aa  719    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.392362 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7692  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  97.14 
 
 		 384 aa  728    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.854568 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5831  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 384 aa  773    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.468117  normal  0.310951 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6079  extracellular ligand-binding receptor  93.75 
 
 		 384 aa  723    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.829496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1598  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  86.35 
 
 		 378 aa  637    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5783  extracellular ligand-binding receptor  95.05 
 
 		 384 aa  719    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6628  extracellular ligand-binding receptor  97.4 
 
 		 384 aa  731    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.733405 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6057  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 384 aa  773    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0205  extracellular ligand-binding receptor  86.4 
 
 		 380 aa  630  1e-180  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0186  extracellular ligand-binding receptor  86.69 
 
 		 380 aa  631  1e-180  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000207737 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1639  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  86.12 
 
 		 380 aa  627  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.516456  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2962  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  86.12 
 
 		 380 aa  627  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49524  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3912  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  86.4 
 
 		 380 aa  629  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1769  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  84.96 
 
 		 380 aa  630  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0660  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  84.96 
 
 		 380 aa  630  1e-179  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.792803  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0051  outative extracellular ligand binding protein  86.4 
 
 		 380 aa  629  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1102  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  84.96 
 
 		 380 aa  630  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391264  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2389  outative extracellular ligand binding protein  84.96 
 
 		 372 aa  630  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3831  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  86.4 
 
 		 380 aa  629  1e-179  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3381  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  86.12 
 
 		 380 aa  628  1e-179  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3158  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  86.4 
 
 		 380 aa  628  1e-179  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1178  outative extracellular ligand binding protein  84.96 
 
 		 380 aa  630  1e-179  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0805  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  84.96 
 
 		 380 aa  630  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.351699  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0192  extracellular ligand-binding receptor  86.4 
 
 		 380 aa  630  1e-179  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3407  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  86.12 
 
 		 380 aa  627  1e-179  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.251793  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2901  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  86.12 
 
 		 376 aa  626  1e-178  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.971399  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2829  extracellular ligand-binding receptor  85.84 
 
 		 391 aa  626  1e-178  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.617546  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0260  extracellular ligand-binding receptor  85.84 
 
 		 380 aa  627  1e-178  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.962079 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0278  extracellular ligand-binding receptor  85.84 
 
 		 391 aa  626  1e-178  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.730585  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4327  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  80.52 
 
 		 402 aa  623  1e-177  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0393  Extracellular ligand-binding receptor  81.15 
 
 		 381 aa  623  1e-177  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0112  extracellular ligand-binding receptor  80.1 
 
 		 381 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4030  extracellular ligand-binding receptor  79.26 
 
 		 386 aa  587  1e-166  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.229342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3492  extracellular ligand-binding receptor  78.98 
 
 		 386 aa  585  1e-166  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.839805 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6110  extracellular ligand-binding receptor  73.58 
 
 		 369 aa  554  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2945  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  76.9 
 
 		 377 aa  548  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.994918 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5105  extracellular ligand-binding receptor  74.51 
 
 		 381 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.140418  decreased coverage  0.00222912 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2319  Extracellular ligand-binding receptor  70.06 
 
 		 401 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.405352  hitchhiker  0.00559033 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0588  extracellular ligand-binding receptor  70.45 
 
 		 399 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.833048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2729  extracellular ligand-binding receptor  69.32 
 
 		 400 aa  504  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2709  Extracellular ligand-binding receptor  69.77 
 
 		 401 aa  503  1e-141  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2867  extracellular ligand-binding receptor  68.64 
 
 		 401 aa  498  1e-140  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.867317  normal  0.705839 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4231  Extracellular ligand-binding receptor  69.12 
 
 		 384 aa  500  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1730  extracellular ligand-binding receptor  67.7 
 
 		 393 aa  493  9.999999999999999e-139  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.145058  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0821  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  68.75 
 
 		 399 aa  489  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2441  putative amino acid-binding periplasmic ABC transporter protein  70.24 
 
 		 336 aa  485  1e-136  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3145  Extracellular ligand-binding receptor  65.62 
 
 		 399 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00633656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3654  extracellular ligand-binding receptor  61.86 
 
 		 399 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.131877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3401  extracellular ligand-binding receptor  59.1 
 
 		 381 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.526257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4758  extracellular ligand-binding receptor  59.47 
 
 		 382 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.467075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4469  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  61.7 
 
 		 404 aa  435  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0270  extracellular ligand-binding receptor  60.23 
 
 		 460 aa  422  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.186259  normal  0.56965 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6407  Extracellular ligand-binding receptor  60.52 
 
 		 380 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2592  extracellular ligand-binding receptor  55.75 
 
 		 398 aa  380  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0214076 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2471  Extracellular ligand-binding receptor  51.09 
 
 		 371 aa  372  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4919  extracellular ligand-binding receptor  52.84 
 
 		 376 aa  371  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4914  extracellular ligand-binding receptor  50.67 
 
 		 375 aa  371  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.113346  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2411  extracellular ligand-binding receptor  50.66 
 
 		 376 aa  369  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.32979  normal  0.572085 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2166  extracellular ligand-binding receptor  50.13 
 
 		 376 aa  367  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.0643115 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2101  Extracellular ligand-binding receptor  52.93 
 
 		 380 aa  366  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1940  putative secreted substrate binding protein  51.69 
 
 		 375 aa  367  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.15659  normal  0.0532415 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2733  Extracellular ligand-binding receptor  52.54 
 
 		 401 aa  362  4e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464024  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3159  extracellular ligand-binding receptor  51.84 
 
 		 376 aa  357  2.9999999999999997e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1728  Extracellular ligand-binding receptor  50.72 
 
 		 375 aa  352  5.9999999999999994e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3860  extracellular ligand-binding receptor  50.57 
 
 		 381 aa  350  3e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0371  extracellular ligand-binding receptor  49.71 
 
 		 383 aa  348  7e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2119  extracellular ligand-binding receptor  50.14 
 
 		 376 aa  348  7e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00221988  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3886  Extracellular ligand-binding receptor  48.54 
 
 		 382 aa  348  1e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1925  extracellular ligand-binding receptor  49 
 
 		 377 aa  347  2e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0315464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0050  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  48.28 
 
 		 382 aa  345  7e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.143388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3346  extracellular ligand-binding receptor  51.21 
 
 		 380 aa  344  1e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1592  leucine-specific binding precursor transmembrane protein  48.92 
 
 		 380 aa  344  2e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3017  extracellular ligand-binding receptor  50.27 
 
 		 382 aa  343  2e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3300  putative amino-acid transport signal peptide protein  47.62 
 
 		 377 aa  339  4e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3295  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  49.06 
 
 		 379 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0114756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3339  extracellular ligand-binding receptor  47.2 
 
 		 383 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0137407  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2197  extracellular ligand-binding receptor  47.03 
 
 		 376 aa  337  1.9999999999999998e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.974618 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0165  outative extracellular ligand binding protein  49.33 
 
 		 379 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4031  putative periplasmic substrate-binding protein  49.33 
 
 		 379 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3957  putative periplasmic substrate-binding protein  49.33 
 
 		 379 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.877185  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3084  extracellular ligand-binding receptor  47.77 
 
 		 386 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0552294  normal  0.474312 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3344  putative periplasmic substrate-binding protein  49.06 
 
 		 379 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3027  putative periplasmic substrate-binding protein  49.06 
 
 		 379 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3300  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  48.79 
 
 		 379 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3495  Extracellular ligand-binding receptor  48.01 
 
 		 381 aa  335  7.999999999999999e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1575  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  49.06 
 
 		 379 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0129  extracellular ligand-binding receptor  49.31 
 
 		 379 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.212558  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2966  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  49.06 
 
 		 375 aa  335  1e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2941  extracellular ligand-binding receptor  49.31 
 
 		 379 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.70065  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0114  extracellular ligand-binding receptor  49.31 
 
 		 379 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0104  extracellular ligand-binding receptor  47.71 
 
 		 379 aa  333  3e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0113  extracellular ligand-binding receptor  47.71 
 
 		 379 aa  333  4e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3170  Extracellular ligand-binding receptor  47.91 
 
 		 381 aa  332  9e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3488  extracellular ligand-binding receptor  48 
 
 		 383 aa  331  2e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.761675 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0115  extracellular ligand-binding receptor  47.71 
 
 		 379 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4261  extracellular ligand-binding receptor  47.53 
 
 		 373 aa  323  3e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5665  extracellular ligand-binding receptor  47.83 
 
 		 380 aa  323  4e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1593  putative transporter, periplasmic substrate-binding protein  46.01 
 
 		 405 aa  322  7e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0185942  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0907  putative transporter, periplasmic substrate-binding protein  46.01 
 
 		 405 aa  322  7e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.26662  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2121  outative extracellular ligand binding protein  46.01 
 
 		 405 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0914412  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>