More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2428 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_2428  Extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
381 aa  752    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.632762  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0460  Extracellular ligand-binding receptor  51.31 
 
 
375 aa  384  1e-105  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3057  Extracellular ligand-binding receptor  45.45 
 
 
398 aa  277  2e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2306  Extracellular ligand-binding receptor  40.21 
 
 
419 aa  269  5e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.110917  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2240  extracellular ligand-binding receptor  39.85 
 
 
394 aa  269  8e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4261  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  41 
 
 
404 aa  256  6e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4416  Extracellular ligand-binding receptor  39.82 
 
 
404 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4395  Extracellular ligand-binding receptor  39.82 
 
 
404 aa  250  4e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4416  extracellular ligand-binding receptor  39.3 
 
 
402 aa  249  5e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.859568  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0533  Extracellular ligand-binding receptor  35.25 
 
 
393 aa  244  1.9999999999999999e-63  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000200352 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1392  extracellular ligand-binding receptor  38.28 
 
 
386 aa  244  1.9999999999999999e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2502  extracellular ligand-binding receptor  40.28 
 
 
399 aa  243  3e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.101059  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2019  extracellular ligand-binding receptor  38.15 
 
 
374 aa  243  3.9999999999999997e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3536  extracellular ligand-binding receptor  38.5 
 
 
388 aa  232  9e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000357876  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2020  extracellular ligand-binding receptor  37.5 
 
 
384 aa  230  4e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.168799 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0932  Extracellular ligand-binding receptor  38.12 
 
 
376 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000568006  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0523  Extracellular ligand-binding receptor  37.84 
 
 
390 aa  218  1e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0215267  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0398  ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  37.28 
 
 
391 aa  216  7e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000849541  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1891  branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic protein  37.43 
 
 
395 aa  214  9.999999999999999e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0610  Extracellular ligand-binding receptor  39.66 
 
 
378 aa  211  2e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1610  extracellular ligand-binding receptor  37.08 
 
 
370 aa  208  1e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000136446  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1388  Extracellular ligand-binding receptor  37.94 
 
 
390 aa  203  5e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0615347  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2556  branched chain amino acid ABC transporter (substrate-binding protein)  33.5 
 
 
392 aa  200  3e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00169682  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1166  Extracellular ligand-binding receptor  35.1 
 
 
387 aa  194  2e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.428965 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1676  extracellular ligand-binding receptor  35.56 
 
 
370 aa  194  3e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000661006  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3401  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  34.38 
 
 
396 aa  193  5e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232513  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1468  extracellular ligand-binding receptor  34.76 
 
 
369 aa  192  6e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000538626  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2113  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  33.42 
 
 
399 aa  192  6e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2114  Extracellular ligand-binding receptor  34.88 
 
 
405 aa  188  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.447818  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0805  Extracellular ligand-binding receptor  37.22 
 
 
384 aa  187  2e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.822655  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4926  Extracellular ligand-binding receptor  34.41 
 
 
396 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000560657  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1582  branched-chain amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  33.67 
 
 
388 aa  182  1e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000809144  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2283  Extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 
395 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000119381 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0635  Extracellular ligand-binding receptor  36.92 
 
 
378 aa  180  4e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000043194  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1065  Extracellular ligand-binding receptor  36.21 
 
 
381 aa  180  4e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000196823  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0522  Extracellular ligand-binding receptor  35.62 
 
 
387 aa  180  4.999999999999999e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2935  extracellular ligand-binding receptor  33.7 
 
 
386 aa  179  7e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.412779  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0562  extracellular ligand-binding receptor  34.36 
 
 
385 aa  179  7e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.419655  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0611  Extracellular ligand-binding receptor  36 
 
 
371 aa  178  1e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1934  Extracellular ligand-binding receptor  34 
 
 
397 aa  179  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000937878  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1720  extracellular ligand-binding receptor  31.79 
 
 
396 aa  178  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.565956  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1469  extracellular ligand-binding receptor  35.07 
 
 
370 aa  177  3e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000103418  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0265  extracellular ligand-binding receptor  32.76 
 
 
376 aa  174  2.9999999999999996e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000854786  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3105  extracellular ligand-binding receptor  31.73 
 
 
389 aa  174  2.9999999999999996e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.64702 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2323  extracellular ligand-binding receptor  29.69 
 
 
383 aa  170  5e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0862  extracellular ligand-binding receptor  33.04 
 
 
375 aa  169  6e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1429  Extracellular ligand-binding receptor  31.52 
 
 
386 aa  168  2e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0505624  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1248  extracellular ligand-binding receptor  35.29 
 
 
375 aa  166  4e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3845  extracellular ligand-binding receptor  31.4 
 
 
374 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.390057  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0588  extracellular ligand-binding receptor  34.72 
 
 
399 aa  162  7e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.833048  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3654  extracellular ligand-binding receptor  33.42 
 
 
399 aa  162  7e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.131877  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1392  Extracellular ligand-binding receptor  29.95 
 
 
382 aa  162  1e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.54413  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4108  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.37 
 
 
374 aa  161  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0910585  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19650  high affinity branched chain amino acid ABC transporter, amino acid binding protein  32.02 
 
 
373 aa  160  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.337564  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1038  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.36 
 
 
371 aa  159  7e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0869251  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4303  branched-chain amino acid transport protein BraC  31.23 
 
 
373 aa  159  8e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50520  branched-chain amino acid transport protein BraC  31.23 
 
 
373 aa  159  8e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592692 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1110  branched-chain amino-acid ABC transporter, periplasmic binding protein  32.47 
 
 
370 aa  158  2e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1111  branched-chain amino-acid ABC transporter, periplasmic binding protein  36.05 
 
 
371 aa  157  2e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0260  extracellular ligand-binding receptor  35.73 
 
 
380 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.962079 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0331  Extracellular ligand-binding receptor  32.31 
 
 
377 aa  157  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179963  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1387  extracellular ligand-binding receptor  31.94 
 
 
373 aa  157  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.279691 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2829  extracellular ligand-binding receptor  35.73 
 
 
391 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.617546  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0192  extracellular ligand-binding receptor  34.86 
 
 
380 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0278  extracellular ligand-binding receptor  35.73 
 
 
391 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.730585  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0399  branched-chain amino-acid ABC transport system periplasmic binding protein  32.49 
 
 
372 aa  156  5.0000000000000005e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0475  Extracellular ligand-binding receptor  33.24 
 
 
372 aa  156  6e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000158967  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0480  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component  31.19 
 
 
391 aa  156  6e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.199357  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0205  extracellular ligand-binding receptor  34.57 
 
 
380 aa  156  7e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2271  extracellular ligand-binding receptor  32.39 
 
 
378 aa  155  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.731283  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0186  extracellular ligand-binding receptor  34.57 
 
 
380 aa  155  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000207737 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1163  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.36 
 
 
371 aa  155  1e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.860982  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1490  Extracellular ligand-binding receptor  33.43 
 
 
397 aa  155  1e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3335  extracellular ligand-binding receptor  30.72 
 
 
370 aa  155  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1137  Extracellular ligand-binding receptor  31.67 
 
 
393 aa  154  2e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0165472  normal  0.816566 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0769  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.85 
 
 
371 aa  154  2e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0554402  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5783  extracellular ligand-binding receptor  34.58 
 
 
384 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6628  extracellular ligand-binding receptor  34.58 
 
 
384 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.733405 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6148  extracellular ligand-binding receptor  34.58 
 
 
384 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.392362 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7692  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  34.58 
 
 
384 aa  153  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.854568 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4276  extracellular ligand-binding receptor  33.14 
 
 
371 aa  153  5e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0067  Extracellular ligand-binding receptor  31.79 
 
 
376 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188079 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1158  extracellular ligand-binding receptor  32.84 
 
 
371 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0616664  normal  0.0422789 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1639  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34 
 
 
380 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.516456  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2901  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  34 
 
 
376 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.971399  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2962  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34 
 
 
380 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49524  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3407  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34 
 
 
380 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.251793  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5831  extracellular ligand-binding receptor  34.01 
 
 
384 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.468117  normal  0.310951 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6079  extracellular ligand-binding receptor  34.29 
 
 
384 aa  151  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.829496  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3861  extracellular ligand-binding receptor  32.32 
 
 
369 aa  150  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.18815 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6057  extracellular ligand-binding receptor  34.01 
 
 
384 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1175  extracellular ligand-binding receptor  32.55 
 
 
371 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.343144  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3158  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  33.43 
 
 
380 aa  150  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1131  extracellular ligand-binding receptor  31.01 
 
 
389 aa  150  4e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0051  outative extracellular ligand binding protein  33.71 
 
 
380 aa  150  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3831  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  33.71 
 
 
380 aa  150  4e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0393  Extracellular ligand-binding receptor  33.52 
 
 
381 aa  150  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3912  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  33.71 
 
 
380 aa  150  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3381  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  34.58 
 
 
380 aa  149  6e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0112  extracellular ligand-binding receptor  34.96 
 
 
381 aa  149  7e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>