More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1490 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1490  Extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
397 aa  809    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1576  extracellular ligand-binding receptor  32.58 
 
 
427 aa  193  6e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0597639  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3206  Extracellular ligand-binding receptor  33.18 
 
 
440 aa  170  4e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2915  Extracellular ligand-binding receptor  32.01 
 
 
440 aa  170  4e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000111325  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0932  Extracellular ligand-binding receptor  34.29 
 
 
376 aa  168  2e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000568006  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2254  extracellular ligand-binding receptor  31.2 
 
 
376 aa  166  5e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1418  extracellular ligand-binding receptor  28.92 
 
 
404 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2750  Extracellular ligand-binding receptor  32.96 
 
 
375 aa  164  3e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0258  amino acid ABC transporter, periplasmic-binding protein  32.96 
 
 
393 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2502  Extracellular ligand-binding receptor  34.31 
 
 
400 aa  162  1e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1861  periplasmic binding protein of ABC transporter for natural amino acids  30.71 
 
 
421 aa  161  2e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0446  extracellular ligand-binding receptor  31.65 
 
 
451 aa  160  3e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0592  extracellular ligand-binding receptor  30.59 
 
 
447 aa  160  5e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.944632  hitchhiker  0.0000426056 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0472  Extracellular ligand-binding receptor  33.24 
 
 
373 aa  159  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.538302  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2428  Extracellular ligand-binding receptor  32.79 
 
 
381 aa  157  3e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.632762  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1830  Extracellular ligand-binding receptor  30.95 
 
 
375 aa  157  4e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.290342  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2502  extracellular ligand-binding receptor  33.8 
 
 
399 aa  155  8e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.101059  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1392  extracellular ligand-binding receptor  32.17 
 
 
386 aa  155  9e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1583  extracellular ligand-binding receptor  30.59 
 
 
450 aa  155  1e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2019  extracellular ligand-binding receptor  32.94 
 
 
374 aa  154  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1730  extracellular ligand-binding receptor  32.28 
 
 
393 aa  153  5.9999999999999996e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.145058  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2240  extracellular ligand-binding receptor  28.72 
 
 
394 aa  152  8.999999999999999e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2901  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  33.24 
 
 
376 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.971399  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1639  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  33.24 
 
 
380 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.516456  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3208  Extracellular ligand-binding receptor  29.97 
 
 
376 aa  152  1e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3158  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  33.72 
 
 
380 aa  152  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2962  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  33.24 
 
 
380 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49524  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3407  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  33.24 
 
 
380 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.251793  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3057  Extracellular ligand-binding receptor  31.64 
 
 
398 aa  151  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0051  outative extracellular ligand binding protein  33.24 
 
 
380 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1866  extracellular ligand-binding receptor  33.15 
 
 
373 aa  151  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3831  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  33.24 
 
 
380 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3912  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  33.24 
 
 
380 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1762  extracellular ligand-binding receptor  32.23 
 
 
449 aa  150  3e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.304418  hitchhiker  0.000873526 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0868  Extracellular ligand-binding receptor  30.73 
 
 
433 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4416  extracellular ligand-binding receptor  32.83 
 
 
402 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.859568  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0523  Extracellular ligand-binding receptor  31.27 
 
 
390 aa  149  6e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0215267  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0834  extracellular ligand-binding receptor  30.4 
 
 
373 aa  149  6e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0295  extracellular ligand-binding receptor  29.44 
 
 
425 aa  149  6e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00215274  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2709  Extracellular ligand-binding receptor  34.11 
 
 
401 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5831  extracellular ligand-binding receptor  34.11 
 
 
384 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.468117  normal  0.310951 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0260  extracellular ligand-binding receptor  33.04 
 
 
380 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.962079 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2829  extracellular ligand-binding receptor  33.04 
 
 
391 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.617546  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6057  extracellular ligand-binding receptor  34.11 
 
 
384 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0278  extracellular ligand-binding receptor  33.04 
 
 
391 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.730585  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0192  extracellular ligand-binding receptor  32.66 
 
 
380 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6628  extracellular ligand-binding receptor  34.11 
 
 
384 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.733405 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0270  extracellular ligand-binding receptor  34.25 
 
 
460 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.186259  normal  0.56965 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2319  Extracellular ligand-binding receptor  33.82 
 
 
401 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.405352  hitchhiker  0.00559033 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0205  extracellular ligand-binding receptor  32.66 
 
 
380 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0186  extracellular ligand-binding receptor  32.66 
 
 
380 aa  146  5e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000207737 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3381  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  33.14 
 
 
380 aa  146  6e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0588  extracellular ligand-binding receptor  32.36 
 
 
399 aa  146  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.833048  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7692  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  34.4 
 
 
384 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.854568 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0317  extracellular ligand-binding receptor  30.81 
 
 
382 aa  145  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00438106  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6079  extracellular ligand-binding receptor  33.82 
 
 
384 aa  145  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.829496  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3401  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  31.27 
 
 
396 aa  144  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232513  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1102  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34.1 
 
 
380 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391264  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0660  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34.1 
 
 
380 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.792803  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4793  extracellular ligand-binding receptor  31.03 
 
 
441 aa  144  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000997112  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0805  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34.1 
 
 
380 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.351699  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1769  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34.1 
 
 
380 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2867  extracellular ligand-binding receptor  33.24 
 
 
401 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.867317  normal  0.705839 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5783  extracellular ligand-binding receptor  33.62 
 
 
384 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1178  outative extracellular ligand binding protein  34.1 
 
 
380 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0398  ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  29.13 
 
 
391 aa  145  2e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000849541  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6148  extracellular ligand-binding receptor  33.62 
 
 
384 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.392362 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4416  Extracellular ligand-binding receptor  30.79 
 
 
404 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2389  outative extracellular ligand binding protein  34.1 
 
 
372 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4395  Extracellular ligand-binding receptor  30.5 
 
 
404 aa  143  6e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2020  extracellular ligand-binding receptor  29.64 
 
 
384 aa  143  6e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.168799 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4261  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  30.21 
 
 
404 aa  142  7e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0404  extracellular ligand-binding receptor  31.38 
 
 
409 aa  142  8e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0168747  normal  0.259327 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1503  extracellular ligand-binding receptor  29.49 
 
 
482 aa  142  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.128913  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2471  Extracellular ligand-binding receptor  32.46 
 
 
371 aa  142  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1775  extracellular ligand-binding receptor  32.03 
 
 
433 aa  142  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000602209 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1582  branched-chain amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  29.26 
 
 
388 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000809144  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0112  extracellular ligand-binding receptor  31.88 
 
 
381 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1598  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  34.01 
 
 
378 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2729  extracellular ligand-binding receptor  30.89 
 
 
400 aa  141  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2535  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.06 
 
 
397 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0821  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.49 
 
 
399 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0316  extracellular ligand-binding receptor  29.58 
 
 
392 aa  140  4.999999999999999e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2397  extracellular ligand-binding receptor  31.99 
 
 
372 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.285564  normal  0.778884 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1587  extracellular ligand-binding receptor  30.33 
 
 
426 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4327  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.28 
 
 
402 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1141  extracellular ligand-binding receptor  32.93 
 
 
371 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.209837 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1175  extracellular ligand-binding receptor  32.93 
 
 
371 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.343144  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0393  Extracellular ligand-binding receptor  31.28 
 
 
381 aa  139  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2556  branched chain amino acid ABC transporter (substrate-binding protein)  28.84 
 
 
392 aa  139  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00169682  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2607  Extracellular ligand-binding receptor  31.54 
 
 
372 aa  139  1e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3654  extracellular ligand-binding receptor  31.75 
 
 
399 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.131877  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2114  Extracellular ligand-binding receptor  28.72 
 
 
405 aa  137  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.447818  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0603  Extracellular ligand-binding receptor  30.34 
 
 
401 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1248  extracellular ligand-binding receptor  31.07 
 
 
375 aa  137  5e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1805  extracellular ligand-binding receptor  28.73 
 
 
463 aa  136  5e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2283  Extracellular ligand-binding receptor  31.52 
 
 
395 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000119381 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1158  extracellular ligand-binding receptor  32.63 
 
 
371 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0616664  normal  0.0422789 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3937  extracellular ligand-binding receptor  28.27 
 
 
397 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.108497  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3583  extracellular ligand-binding receptor  28.27 
 
 
397 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.160701  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>