More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1131 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1131  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
389 aa  777    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1720  extracellular ligand-binding receptor  65.06 
 
 
396 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.565956  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3401  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  60.22 
 
 
396 aa  408  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232513  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2283  Extracellular ligand-binding receptor  56.95 
 
 
395 aa  395  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000119381 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1934  Extracellular ligand-binding receptor  57.54 
 
 
397 aa  395  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000937878  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2113  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  48.87 
 
 
399 aa  362  6e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2019  extracellular ligand-binding receptor  33.91 
 
 
374 aa  220  3e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2020  extracellular ligand-binding receptor  36.57 
 
 
384 aa  218  2e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.168799 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2306  Extracellular ligand-binding receptor  34.48 
 
 
419 aa  211  2e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.110917  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1392  extracellular ligand-binding receptor  33.59 
 
 
386 aa  198  1.0000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3057  Extracellular ligand-binding receptor  33.08 
 
 
398 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4261  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  32.37 
 
 
404 aa  195  9e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4416  Extracellular ligand-binding receptor  31.21 
 
 
404 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0932  Extracellular ligand-binding receptor  36.63 
 
 
376 aa  192  1e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000568006  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4395  Extracellular ligand-binding receptor  31.5 
 
 
404 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4416  extracellular ligand-binding receptor  31.9 
 
 
402 aa  189  5e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.859568  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2556  branched chain amino acid ABC transporter (substrate-binding protein)  31.71 
 
 
392 aa  187  3e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00169682  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2323  extracellular ligand-binding receptor  30.5 
 
 
383 aa  183  4.0000000000000006e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2240  extracellular ligand-binding receptor  32.49 
 
 
394 aa  181  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1582  branched-chain amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  31.41 
 
 
388 aa  177  2e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000809144  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2502  extracellular ligand-binding receptor  32.71 
 
 
399 aa  172  6.999999999999999e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.101059  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0523  Extracellular ligand-binding receptor  32.89 
 
 
390 aa  172  1e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0215267  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0611  Extracellular ligand-binding receptor  33.89 
 
 
371 aa  169  1e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0635  Extracellular ligand-binding receptor  31.72 
 
 
378 aa  166  9e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000043194  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0398  ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  31.13 
 
 
391 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000849541  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1468  extracellular ligand-binding receptor  33.14 
 
 
369 aa  164  3e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000538626  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0862  extracellular ligand-binding receptor  32.95 
 
 
375 aa  164  3e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0460  Extracellular ligand-binding receptor  28.35 
 
 
375 aa  163  4.0000000000000004e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2428  Extracellular ligand-binding receptor  29.82 
 
 
381 aa  160  3e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.632762  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1469  extracellular ligand-binding receptor  32.85 
 
 
370 aa  156  7e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000103418  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3294  hypothetical protein  32.95 
 
 
383 aa  154  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.953272  normal  0.0380984 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1610  extracellular ligand-binding receptor  32.3 
 
 
370 aa  151  2e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000136446  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0265  extracellular ligand-binding receptor  32.22 
 
 
376 aa  150  4e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000854786  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0480  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component  29.23 
 
 
391 aa  149  6e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.199357  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01985  amino acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  32.08 
 
 
386 aa  149  7e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222636  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4487  extracellular ligand-binding receptor  31.09 
 
 
384 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00567759  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3906  Extracellular ligand-binding receptor  32.08 
 
 
386 aa  147  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3793  Extracellular ligand-binding receptor  32.08 
 
 
386 aa  147  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.15379 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1478  Extracellular ligand-binding receptor  29.71 
 
 
376 aa  147  3e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1388  Extracellular ligand-binding receptor  30.31 
 
 
390 aa  147  3e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0615347  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2935  extracellular ligand-binding receptor  31.3 
 
 
386 aa  146  6e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.412779  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3728  extracellular ligand-binding receptor  32.87 
 
 
392 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.172455  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1392  Extracellular ligand-binding receptor  30.46 
 
 
382 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.54413  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1065  Extracellular ligand-binding receptor  30.43 
 
 
381 aa  144  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000196823  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1676  extracellular ligand-binding receptor  30.66 
 
 
370 aa  144  4e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000661006  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2729  extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 
400 aa  143  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2306  extracellular ligand-binding receptor  27.08 
 
 
376 aa  143  7e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2319  Extracellular ligand-binding receptor  32.4 
 
 
401 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.405352  hitchhiker  0.00559033 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1248  extracellular ligand-binding receptor  29.73 
 
 
375 aa  140  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3335  extracellular ligand-binding receptor  29.72 
 
 
370 aa  140  4.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2867  extracellular ligand-binding receptor  32.12 
 
 
401 aa  139  6e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.867317  normal  0.705839 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2197  extracellular ligand-binding receptor  31.44 
 
 
376 aa  139  6e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.974618 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2305  extracellular ligand-binding receptor  26.76 
 
 
380 aa  138  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2392  extracellular ligand-binding receptor  28.57 
 
 
372 aa  138  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0457851 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0588  extracellular ligand-binding receptor  31.16 
 
 
399 aa  138  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.833048  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0331  Extracellular ligand-binding receptor  27.58 
 
 
377 aa  138  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179963  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2114  Extracellular ligand-binding receptor  30.28 
 
 
405 aa  138  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.447818  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4108  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.41 
 
 
374 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0910585  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2709  Extracellular ligand-binding receptor  32.12 
 
 
401 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3536  extracellular ligand-binding receptor  30.38 
 
 
388 aa  136  6.0000000000000005e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000357876  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6166  extracellular ligand-binding receptor  29.38 
 
 
375 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.644445  normal  0.0557295 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3845  extracellular ligand-binding receptor  29.1 
 
 
374 aa  135  8e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.390057  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0522  Extracellular ligand-binding receptor  29.23 
 
 
387 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1469  extracellular ligand-binding receptor  31.27 
 
 
396 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0937  Extracellular ligand-binding receptor  30.22 
 
 
380 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000952162  normal  0.230854 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3052  extracellular ligand-binding receptor  29.28 
 
 
376 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1650  extracellular ligand-binding receptor  29.28 
 
 
393 aa  135  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.154413  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4954  extracellular ligand-binding receptor  29.28 
 
 
376 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0182124 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4276  extracellular ligand-binding receptor  30.65 
 
 
371 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5315  extracellular ligand-binding receptor  29.28 
 
 
599 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.568135 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4327  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.33 
 
 
402 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1141  extracellular ligand-binding receptor  30.65 
 
 
371 aa  133  6e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.209837 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2271  extracellular ligand-binding receptor  26.76 
 
 
378 aa  133  6e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.731283  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1137  Extracellular ligand-binding receptor  29.25 
 
 
393 aa  133  6e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0165472  normal  0.816566 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0393  Extracellular ligand-binding receptor  31.4 
 
 
381 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0610  Extracellular ligand-binding receptor  30.28 
 
 
378 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2441  putative amino acid-binding periplasmic ABC transporter protein  32.37 
 
 
336 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.217727  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3510  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  27.76 
 
 
371 aa  132  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.533317  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1175  extracellular ligand-binding receptor  30.65 
 
 
371 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.343144  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2022  Extracellular ligand-binding receptor  28.7 
 
 
373 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.882154  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0095  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.01 
 
 
399 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.237273 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1651  Extracellular ligand-binding receptor  27.83 
 
 
392 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.689603  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3105  extracellular ligand-binding receptor  30.51 
 
 
389 aa  132  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.64702 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3654  extracellular ligand-binding receptor  30.64 
 
 
399 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.131877  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1257  extracellular ligand-binding receptor  28.42 
 
 
386 aa  130  3e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000744493  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0067  Extracellular ligand-binding receptor  26.27 
 
 
376 aa  130  3e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188079 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1891  branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic protein  28.78 
 
 
395 aa  130  3e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1863  Extracellular ligand-binding receptor  28.29 
 
 
814 aa  131  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.190846  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5603  Extracellular ligand-binding receptor  27.39 
 
 
393 aa  130  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.442467  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1925  extracellular ligand-binding receptor  29.43 
 
 
377 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0315464  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2086  Extracellular ligand-binding receptor  29.1 
 
 
372 aa  130  6e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3668  branched chain amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  28.48 
 
 
371 aa  129  7.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.210463  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0533  Extracellular ligand-binding receptor  26.23 
 
 
393 aa  129  8.000000000000001e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000200352 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0186  extracellular ligand-binding receptor  31.53 
 
 
380 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000207737 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4303  branched-chain amino acid transport protein BraC  29.54 
 
 
373 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2166  extracellular ligand-binding receptor  28.57 
 
 
376 aa  129  9.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.0643115 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2962  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.83 
 
 
380 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49524  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3381  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.4 
 
 
380 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1158  extracellular ligand-binding receptor  29.63 
 
 
371 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0616664  normal  0.0422789 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3323  Extracellular ligand-binding receptor  28.57 
 
 
373 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.41386 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>