More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1137 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1137  Extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
393 aa  805    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0165472  normal  0.816566 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2020  extracellular ligand-binding receptor  34.09 
 
 
384 aa  187  3e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.168799 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2306  Extracellular ligand-binding receptor  29.62 
 
 
419 aa  186  9e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.110917  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0932  Extracellular ligand-binding receptor  32.46 
 
 
376 aa  182  7e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000568006  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2019  extracellular ligand-binding receptor  32.94 
 
 
374 aa  176  6e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2240  extracellular ligand-binding receptor  31.51 
 
 
394 aa  169  6e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1392  Extracellular ligand-binding receptor  32.77 
 
 
382 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.54413  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0398  ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  32.08 
 
 
391 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000849541  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3057  Extracellular ligand-binding receptor  34 
 
 
398 aa  167  4e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1934  Extracellular ligand-binding receptor  32.23 
 
 
397 aa  159  7e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000937878  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1720  extracellular ligand-binding receptor  28.95 
 
 
396 aa  158  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.565956  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2283  Extracellular ligand-binding receptor  31.23 
 
 
395 aa  157  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000119381 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2428  Extracellular ligand-binding receptor  30.94 
 
 
381 aa  157  4e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.632762  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2556  branched chain amino acid ABC transporter (substrate-binding protein)  29.92 
 
 
392 aa  155  8e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00169682  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0523  Extracellular ligand-binding receptor  29.48 
 
 
390 aa  155  8e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0215267  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2022  Extracellular ligand-binding receptor  30.72 
 
 
373 aa  155  1e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.882154  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3401  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  30.42 
 
 
396 aa  153  4e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232513  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4261  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  29.6 
 
 
404 aa  153  5e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4416  extracellular ligand-binding receptor  29.66 
 
 
402 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.859568  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4416  Extracellular ligand-binding receptor  29.28 
 
 
404 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4395  Extracellular ligand-binding receptor  29.28 
 
 
404 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01985  amino acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  30.63 
 
 
386 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222636  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2502  extracellular ligand-binding receptor  29.88 
 
 
399 aa  149  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.101059  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0331  Extracellular ligand-binding receptor  31.02 
 
 
377 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179963  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3906  Extracellular ligand-binding receptor  30.03 
 
 
386 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3793  Extracellular ligand-binding receptor  30.03 
 
 
386 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.15379 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2323  extracellular ligand-binding receptor  28.25 
 
 
383 aa  147  4.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2271  extracellular ligand-binding receptor  31.18 
 
 
378 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.731283  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0717  Extracellular ligand-binding receptor  27.53 
 
 
413 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.726528  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1610  extracellular ligand-binding receptor  30.93 
 
 
370 aa  143  4e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000136446  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1582  branched-chain amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  30.35 
 
 
388 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000809144  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1671  extracellular ligand-binding receptor  31.84 
 
 
379 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1392  extracellular ligand-binding receptor  28.13 
 
 
386 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2113  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  27.23 
 
 
399 aa  137  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1388  Extracellular ligand-binding receptor  29.64 
 
 
390 aa  138  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0615347  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0701  Extracellular ligand-binding receptor  27.86 
 
 
377 aa  137  4e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0183935  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0718  Extracellular ligand-binding receptor  28.7 
 
 
412 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1468  extracellular ligand-binding receptor  28.29 
 
 
369 aa  136  6.0000000000000005e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000538626  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2114  Extracellular ligand-binding receptor  28.65 
 
 
405 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.447818  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3105  Extracellular ligand-binding receptor  28.18 
 
 
389 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3294  hypothetical protein  29.71 
 
 
383 aa  135  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.953272  normal  0.0380984 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0522  Extracellular ligand-binding receptor  29.25 
 
 
387 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0460  Extracellular ligand-binding receptor  26.51 
 
 
375 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0472  Extracellular ligand-binding receptor  31.04 
 
 
373 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.538302  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1891  branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic protein  28.04 
 
 
395 aa  134  3e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3105  extracellular ligand-binding receptor  29.64 
 
 
389 aa  134  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.64702 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0095  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.01 
 
 
399 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.237273 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2306  extracellular ligand-binding receptor  26.29 
 
 
376 aa  132  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1676  extracellular ligand-binding receptor  30.33 
 
 
370 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000661006  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0067  Extracellular ligand-binding receptor  26.91 
 
 
376 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188079 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0480  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component  29.65 
 
 
391 aa  131  2.0000000000000002e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.199357  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0090  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.27 
 
 
395 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0960253  normal  0.350813 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1651  Extracellular ligand-binding receptor  28.41 
 
 
392 aa  130  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.689603  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1429  Extracellular ligand-binding receptor  27.91 
 
 
386 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0505624  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0465  extracellular ligand-binding receptor  27.49 
 
 
416 aa  129  6e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0898027  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0538  extracellular ligand-binding receptor  28.48 
 
 
368 aa  129  8.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0513259  normal  0.872247 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2502  Extracellular ligand-binding receptor  28.32 
 
 
400 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0042  extracellular ligand-binding receptor  28.44 
 
 
368 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.538449  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1166  Extracellular ligand-binding receptor  27.58 
 
 
387 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.428965 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1734  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  28.61 
 
 
380 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.534498  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1131  extracellular ligand-binding receptor  28.85 
 
 
389 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1490  Extracellular ligand-binding receptor  28.57 
 
 
397 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5603  Extracellular ligand-binding receptor  27.53 
 
 
393 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.442467  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0219  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.56 
 
 
376 aa  127  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00187981  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0012  putative branched-chain amino acid ABC transporter, perisplasmic amino acid-binding protein  27.83 
 
 
368 aa  127  4.0000000000000003e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.318461  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0562  extracellular ligand-binding receptor  28.57 
 
 
385 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.419655  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1257  extracellular ligand-binding receptor  26.41 
 
 
386 aa  127  5e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000744493  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3937  extracellular ligand-binding receptor  27.92 
 
 
397 aa  126  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.108497  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3583  extracellular ligand-binding receptor  27.92 
 
 
397 aa  126  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.160701  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0014  branched-chain amino acid ABC transporter, perisplasmic amino acid-binding protein, putative  27.52 
 
 
368 aa  126  8.000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3208  Extracellular ligand-binding receptor  28.49 
 
 
376 aa  125  9e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1211  Extracellular ligand-binding receptor  24.85 
 
 
390 aa  125  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.391251  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0714  Extracellular ligand-binding receptor  27.11 
 
 
395 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2130  extracellular ligand-binding receptor  28.37 
 
 
380 aa  125  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.482674  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0805  Extracellular ligand-binding receptor  30.98 
 
 
384 aa  125  1e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.822655  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2935  extracellular ligand-binding receptor  27.15 
 
 
386 aa  125  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.412779  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3328  extracellular ligand-binding receptor  29.79 
 
 
366 aa  125  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2254  extracellular ligand-binding receptor  30.47 
 
 
376 aa  124  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5102  extracellular ligand-binding receptor  28.57 
 
 
397 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.294794 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2535  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.69 
 
 
397 aa  124  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3728  extracellular ligand-binding receptor  29.3 
 
 
392 aa  124  3e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.172455  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1861  Extracellular ligand-binding receptor  29.85 
 
 
379 aa  124  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.571716  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0610  Extracellular ligand-binding receptor  28.57 
 
 
378 aa  124  3e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5317  extracellular ligand-binding receptor  27.69 
 
 
397 aa  124  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.862776  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0862  extracellular ligand-binding receptor  28.05 
 
 
375 aa  124  4e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19650  high affinity branched chain amino acid ABC transporter, amino acid binding protein  29.47 
 
 
373 aa  122  7e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.337564  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4108  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.53 
 
 
374 aa  123  7e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0910585  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1741  Extracellular ligand-binding receptor  26.43 
 
 
375 aa  123  7e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.734186  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1730  extracellular ligand-binding receptor  28.68 
 
 
393 aa  123  7e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.145058  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3822  Extracellular ligand-binding receptor  25.19 
 
 
394 aa  122  8e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000102798  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3845  extracellular ligand-binding receptor  26.12 
 
 
374 aa  122  9e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.390057  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0635  Extracellular ligand-binding receptor  28.94 
 
 
378 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000043194  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4698  extracellular ligand-binding receptor  26.14 
 
 
366 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.026016  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2709  Extracellular ligand-binding receptor  29.8 
 
 
401 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1469  extracellular ligand-binding receptor  25.6 
 
 
396 aa  120  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2319  Extracellular ligand-binding receptor  29.8 
 
 
401 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.405352  hitchhiker  0.00559033 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3416  extracellular ligand-binding receptor  27.89 
 
 
383 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5152  extracellular ligand-binding receptor  27.37 
 
 
383 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.482519  normal  0.580615 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1823  extracellular ligand-binding receptor  28.83 
 
 
380 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2496  branched-chain amino-acid ABC transport system periplasmic binding protein  27.3 
 
 
399 aa  120  4.9999999999999996e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.106087  hitchhiker  0.00162568 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>