More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5603 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5603  Extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
393 aa  787    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.442467  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1651  Extracellular ligand-binding receptor  45.1 
 
 
392 aa  311  1e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.689603  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2271  extracellular ligand-binding receptor  40.82 
 
 
378 aa  226  4e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.731283  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0331  Extracellular ligand-binding receptor  40.77 
 
 
377 aa  224  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179963  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0067  Extracellular ligand-binding receptor  39.32 
 
 
376 aa  216  5e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188079 
 
 
-
 
NC_003296  RS01985  amino acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  36.62 
 
 
386 aa  205  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222636  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3793  Extracellular ligand-binding receptor  35.77 
 
 
386 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.15379 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3906  Extracellular ligand-binding receptor  35.77 
 
 
386 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0717  Extracellular ligand-binding receptor  32.61 
 
 
413 aa  195  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.726528  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0465  extracellular ligand-binding receptor  35.62 
 
 
416 aa  191  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0898027  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0718  Extracellular ligand-binding receptor  33.42 
 
 
412 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1211  Extracellular ligand-binding receptor  35.26 
 
 
390 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.391251  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0735  extracellular ligand-binding receptor  36.93 
 
 
385 aa  169  1e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2496  branched-chain amino-acid ABC transport system periplasmic binding protein  32.05 
 
 
399 aa  168  2e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.106087  hitchhiker  0.00162568 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3401  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  30.43 
 
 
396 aa  164  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232513  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1934  Extracellular ligand-binding receptor  29.97 
 
 
397 aa  163  6e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000937878  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2283  Extracellular ligand-binding receptor  30.84 
 
 
395 aa  161  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000119381 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2502  extracellular ligand-binding receptor  31.68 
 
 
399 aa  155  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.101059  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0714  Extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 
395 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3057  Extracellular ligand-binding receptor  29.48 
 
 
398 aa  151  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0932  Extracellular ligand-binding receptor  30.35 
 
 
376 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000568006  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3728  extracellular ligand-binding receptor  32.27 
 
 
392 aa  147  3e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.172455  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2019  extracellular ligand-binding receptor  27.54 
 
 
374 aa  145  9e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2020  extracellular ligand-binding receptor  27.54 
 
 
384 aa  143  6e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.168799 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1065  Extracellular ligand-binding receptor  30.92 
 
 
381 aa  142  8e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000196823  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2428  Extracellular ligand-binding receptor  29.87 
 
 
381 aa  140  4.999999999999999e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.632762  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0611  Extracellular ligand-binding receptor  29.83 
 
 
371 aa  138  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1392  Extracellular ligand-binding receptor  29.89 
 
 
382 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.54413  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2113  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  27.66 
 
 
399 aa  136  6.0000000000000005e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0480  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component  27.2 
 
 
391 aa  135  8e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.199357  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0635  Extracellular ligand-binding receptor  27.95 
 
 
378 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000043194  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2935  extracellular ligand-binding receptor  28.24 
 
 
386 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.412779  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2306  Extracellular ligand-binding receptor  25.95 
 
 
419 aa  134  3e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.110917  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1582  branched-chain amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.55 
 
 
388 aa  132  7.999999999999999e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000809144  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1720  extracellular ligand-binding receptor  28.35 
 
 
396 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.565956  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2005  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  29.94 
 
 
385 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.635473  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0398  ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  28.26 
 
 
391 aa  130  3e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000849541  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4416  extracellular ligand-binding receptor  28.82 
 
 
402 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.859568  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2323  extracellular ligand-binding receptor  26.59 
 
 
383 aa  126  6e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1131  extracellular ligand-binding receptor  28.49 
 
 
389 aa  126  7e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0523  Extracellular ligand-binding receptor  26.33 
 
 
390 aa  125  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0215267  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1392  extracellular ligand-binding receptor  30.34 
 
 
386 aa  125  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3294  hypothetical protein  29.6 
 
 
383 aa  125  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.953272  normal  0.0380984 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1137  Extracellular ligand-binding receptor  28.57 
 
 
393 aa  125  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0165472  normal  0.816566 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1388  Extracellular ligand-binding receptor  26.85 
 
 
390 aa  122  8e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0615347  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4395  Extracellular ligand-binding receptor  27.44 
 
 
404 aa  122  9e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4416  Extracellular ligand-binding receptor  27.13 
 
 
404 aa  122  9e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4261  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  26.83 
 
 
404 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1455  extracellular ligand-binding receptor  29.79 
 
 
402 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179211  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2240  extracellular ligand-binding receptor  29.06 
 
 
394 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2022  Extracellular ligand-binding receptor  27.53 
 
 
373 aa  119  7e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.882154  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2114  Extracellular ligand-binding receptor  26.33 
 
 
405 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.447818  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0317  extracellular ligand-binding receptor  29.24 
 
 
382 aa  118  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00438106  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1830  Extracellular ligand-binding receptor  30 
 
 
381 aa  117  3e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000559355  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2556  branched chain amino acid ABC transporter (substrate-binding protein)  26 
 
 
392 aa  116  6.9999999999999995e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00169682  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1166  Extracellular ligand-binding receptor  28.49 
 
 
387 aa  116  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.428965 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3105  extracellular ligand-binding receptor  28.81 
 
 
389 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.64702 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0095  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.42 
 
 
399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.237273 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1735  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  27.68 
 
 
378 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0862  extracellular ligand-binding receptor  27.68 
 
 
375 aa  115  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0853  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  29.19 
 
 
381 aa  114  3e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.18061  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2037  Extracellular ligand-binding receptor  29.65 
 
 
379 aa  114  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000596452 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0265  extracellular ligand-binding receptor  27.14 
 
 
376 aa  114  3e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000854786  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0805  Extracellular ligand-binding receptor  31.25 
 
 
384 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.822655  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6166  extracellular ligand-binding receptor  29.2 
 
 
375 aa  113  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.644445  normal  0.0557295 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0460  Extracellular ligand-binding receptor  26.48 
 
 
375 aa  113  7.000000000000001e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0219  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.67 
 
 
376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00187981  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1439  Extracellular ligand-binding receptor  29.74 
 
 
383 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.249756  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4069  extracellular ligand-binding receptor  27.22 
 
 
393 aa  110  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.236469 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2424  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  28.91 
 
 
383 aa  110  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.806831  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1534  Extracellular ligand-binding receptor  29.45 
 
 
383 aa  110  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.688038  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0562  extracellular ligand-binding receptor  27.17 
 
 
385 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.419655  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2190  Extracellular ligand-binding receptor  29.93 
 
 
379 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1671  extracellular ligand-binding receptor  26.06 
 
 
379 aa  109  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0610  Extracellular ligand-binding receptor  25.36 
 
 
378 aa  108  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1290  branched chain amino acid ABC transporter permease  26.8 
 
 
392 aa  107  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.169952  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3822  Extracellular ligand-binding receptor  22.56 
 
 
394 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000102798  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2130  extracellular ligand-binding receptor  25.38 
 
 
380 aa  108  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.482674  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0995  Extracellular ligand-binding receptor  26.01 
 
 
379 aa  108  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.725983  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1734  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  25.38 
 
 
380 aa  107  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.534498  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2131  extracellular ligand-binding receptor  28.48 
 
 
379 aa  107  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0617424  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0522  Extracellular ligand-binding receptor  25.07 
 
 
387 aa  107  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1891  branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic protein  25.29 
 
 
395 aa  106  7e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1468  extracellular ligand-binding receptor  24.78 
 
 
369 aa  106  9e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000538626  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2729  extracellular ligand-binding receptor  28.32 
 
 
400 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0668  extracellular ligand-binding receptor  25.88 
 
 
392 aa  105  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.431771  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1823  extracellular ligand-binding receptor  25.15 
 
 
380 aa  105  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0350  extracellular ligand-binding receptor  29.26 
 
 
376 aa  104  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000281139  normal  0.291499 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3645  extracellular ligand-binding receptor  26.74 
 
 
401 aa  104  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.218866  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3823  Extracellular ligand-binding receptor  23.56 
 
 
394 aa  103  6e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00025514  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1661  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.47 
 
 
373 aa  102  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00010868  normal  0.0729717 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1520  extracellular ligand-binding receptor  27.19 
 
 
381 aa  102  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.657552  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1045  extracellular ligand-binding receptor  25.85 
 
 
378 aa  102  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2867  extracellular ligand-binding receptor  29.39 
 
 
401 aa  102  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.867317  normal  0.705839 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1469  extracellular ligand-binding receptor  24.85 
 
 
370 aa  102  2e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000103418  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3536  extracellular ligand-binding receptor  25.76 
 
 
388 aa  101  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000357876  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1478  Extracellular ligand-binding receptor  26.61 
 
 
405 aa  101  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2189  Extracellular ligand-binding receptor  25.4 
 
 
379 aa  100  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1610  extracellular ligand-binding receptor  24.69 
 
 
370 aa  100  4e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000136446  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4008  extracellular ligand-binding receptor  27.07 
 
 
373 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.746913  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>