More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0714 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_0714  Extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
395 aa  783    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0717  Extracellular ligand-binding receptor  63.79 
 
 
413 aa  466  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.726528  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0465  extracellular ligand-binding receptor  60.45 
 
 
416 aa  460  9.999999999999999e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0898027  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0718  Extracellular ligand-binding receptor  62.43 
 
 
412 aa  443  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0735  extracellular ligand-binding receptor  54.48 
 
 
385 aa  403  1e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1211  Extracellular ligand-binding receptor  48.25 
 
 
390 aa  371  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.391251  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2496  branched-chain amino-acid ABC transport system periplasmic binding protein  52.24 
 
 
399 aa  365  1e-100  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.106087  hitchhiker  0.00162568 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0331  Extracellular ligand-binding receptor  30.28 
 
 
377 aa  161  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179963  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5603  Extracellular ligand-binding receptor  30.97 
 
 
393 aa  157  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.442467  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2271  extracellular ligand-binding receptor  29.87 
 
 
378 aa  153  4e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.731283  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_003296  RS01985  amino acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  30.95 
 
 
386 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222636  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0067  Extracellular ligand-binding receptor  28.03 
 
 
376 aa  147  3e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188079 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3793  Extracellular ligand-binding receptor  31.06 
 
 
386 aa  144  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.15379 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3906  Extracellular ligand-binding receptor  31.06 
 
 
386 aa  144  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3401  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  27.21 
 
 
396 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232513  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1651  Extracellular ligand-binding receptor  31.19 
 
 
392 aa  133  5e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.689603  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1610  extracellular ligand-binding receptor  29.79 
 
 
370 aa  130  3e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000136446  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2020  extracellular ligand-binding receptor  27.27 
 
 
384 aa  130  5.0000000000000004e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.168799 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1137  Extracellular ligand-binding receptor  28.01 
 
 
393 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0165472  normal  0.816566 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2306  Extracellular ligand-binding receptor  25.72 
 
 
419 aa  128  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.110917  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2019  extracellular ligand-binding receptor  28.12 
 
 
374 aa  125  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1676  extracellular ligand-binding receptor  29.45 
 
 
370 aa  124  4e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000661006  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2283  Extracellular ligand-binding receptor  26.69 
 
 
395 aa  123  5e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000119381 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4261  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  26.61 
 
 
404 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1720  extracellular ligand-binding receptor  24.57 
 
 
396 aa  119  7e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.565956  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4395  Extracellular ligand-binding receptor  26.61 
 
 
404 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1934  Extracellular ligand-binding receptor  26.1 
 
 
397 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000937878  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4416  Extracellular ligand-binding receptor  26.32 
 
 
404 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0635  Extracellular ligand-binding receptor  26.87 
 
 
378 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000043194  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0522  Extracellular ligand-binding receptor  23.84 
 
 
387 aa  114  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0932  Extracellular ligand-binding receptor  25.8 
 
 
376 aa  113  5e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000568006  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1392  Extracellular ligand-binding receptor  25.17 
 
 
382 aa  110  3e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.54413  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2428  Extracellular ligand-binding receptor  26.32 
 
 
381 aa  109  9.000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.632762  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2323  extracellular ligand-binding receptor  27.14 
 
 
383 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4416  extracellular ligand-binding receptor  24.65 
 
 
402 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.859568  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3294  hypothetical protein  27 
 
 
383 aa  109  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.953272  normal  0.0380984 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1468  extracellular ligand-binding receptor  25.17 
 
 
369 aa  108  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000538626  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2502  extracellular ligand-binding receptor  24.09 
 
 
399 aa  108  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.101059  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0460  Extracellular ligand-binding receptor  24.09 
 
 
375 aa  107  3e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0090  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.47 
 
 
395 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0960253  normal  0.350813 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2114  Extracellular ligand-binding receptor  24.22 
 
 
405 aa  107  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.447818  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0769  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  23.84 
 
 
371 aa  106  6e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0554402  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1065  Extracellular ligand-binding receptor  26.53 
 
 
381 aa  106  7e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000196823  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1131  extracellular ligand-binding receptor  24.46 
 
 
389 aa  106  9e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0533  Extracellular ligand-binding receptor  24.93 
 
 
393 aa  105  1e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000200352 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1038  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.51 
 
 
371 aa  105  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0869251  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2113  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  23.12 
 
 
399 aa  105  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3057  Extracellular ligand-binding receptor  25.08 
 
 
398 aa  104  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1110  branched-chain amino-acid ABC transporter, periplasmic binding protein  25.25 
 
 
370 aa  103  4e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1166  Extracellular ligand-binding receptor  23.5 
 
 
387 aa  103  5e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.428965 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0219  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.42 
 
 
376 aa  102  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00187981  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5317  extracellular ligand-binding receptor  24.76 
 
 
397 aa  102  9e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.862776  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2535  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.76 
 
 
397 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0095  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  22.95 
 
 
399 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.237273 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0611  Extracellular ligand-binding receptor  25.4 
 
 
371 aa  102  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1163  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  23.98 
 
 
371 aa  100  4e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.860982  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1429  Extracellular ligand-binding receptor  23.55 
 
 
386 aa  100  4e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0505624  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1891  branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic protein  24.57 
 
 
395 aa  100  6e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1866  extracellular ligand-binding receptor  25.25 
 
 
373 aa  100  6e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0317  extracellular ligand-binding receptor  22.9 
 
 
382 aa  99.4  9e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00438106  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0562  extracellular ligand-binding receptor  21.98 
 
 
385 aa  99.4  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.419655  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2005  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  24.65 
 
 
385 aa  98.6  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.635473  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0523  Extracellular ligand-binding receptor  24.83 
 
 
390 aa  98.6  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0215267  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1469  extracellular ligand-binding receptor  23.84 
 
 
370 aa  97.8  3e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000103418  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5102  extracellular ligand-binding receptor  24.44 
 
 
397 aa  97.4  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.294794 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3937  extracellular ligand-binding receptor  23.81 
 
 
397 aa  97.1  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.108497  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3583  extracellular ligand-binding receptor  23.81 
 
 
397 aa  97.1  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.160701  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1111  branched-chain amino-acid ABC transporter, periplasmic binding protein  23.15 
 
 
371 aa  96.7  7e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2556  branched chain amino acid ABC transporter (substrate-binding protein)  24.33 
 
 
392 aa  95.1  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00169682  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0862  extracellular ligand-binding receptor  26.19 
 
 
375 aa  94.4  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5152  extracellular ligand-binding receptor  26.3 
 
 
383 aa  94  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.482519  normal  0.580615 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1290  branched chain amino acid ABC transporter permease  24.16 
 
 
392 aa  93.2  7e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.169952  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0610  Extracellular ligand-binding receptor  22.48 
 
 
378 aa  92.4  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1455  extracellular ligand-binding receptor  25.29 
 
 
402 aa  92.8  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179211  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3728  extracellular ligand-binding receptor  28.41 
 
 
392 aa  91.3  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.172455  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2331  Extracellular ligand-binding receptor  24.71 
 
 
377 aa  91.7  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0399  branched-chain amino-acid ABC transport system periplasmic binding protein  23.81 
 
 
372 aa  90.1  5e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1830  Extracellular ligand-binding receptor  25.31 
 
 
381 aa  90.1  6e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000559355  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2240  extracellular ligand-binding receptor  23.33 
 
 
394 aa  88.2  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3416  extracellular ligand-binding receptor  25.8 
 
 
383 aa  89  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0701  Extracellular ligand-binding receptor  22.76 
 
 
377 aa  88.6  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0183935  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5249  extracellular ligand-binding receptor  25.53 
 
 
383 aa  87.8  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.513235 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0355  extracellular ligand-binding receptor  23.95 
 
 
394 aa  87.8  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3105  extracellular ligand-binding receptor  21.64 
 
 
389 aa  87.4  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.64702 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2306  extracellular ligand-binding receptor  21.5 
 
 
376 aa  87.4  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1730  extracellular ligand-binding receptor  23.53 
 
 
393 aa  87  5e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.145058  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5831  extracellular ligand-binding receptor  25.41 
 
 
384 aa  87  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.468117  normal  0.310951 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6057  extracellular ligand-binding receptor  25.41 
 
 
384 aa  87  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5889  extracellular ligand-binding receptor  25.34 
 
 
382 aa  86.7  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1970  extracellular ligand-binding receptor  24.19 
 
 
372 aa  86.7  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2140  extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 
382 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.250679  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1671  extracellular ligand-binding receptor  23.25 
 
 
379 aa  85.9  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0805  Extracellular ligand-binding receptor  25.08 
 
 
384 aa  85.9  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.822655  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4100  extracellular ligand-binding receptor  24.07 
 
 
387 aa  85.9  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.199713  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4101  extracellular ligand-binding receptor  25.47 
 
 
387 aa  85.1  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4935  Extracellular ligand-binding receptor  24.13 
 
 
389 aa  85.5  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0398  ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  25.2 
 
 
391 aa  85.1  0.000000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000849541  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2750  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.22 
 
 
425 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0109739  normal  0.254921 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1404  Extracellular ligand-binding receptor  26.15 
 
 
383 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0937  Extracellular ligand-binding receptor  21.32 
 
 
380 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000952162  normal  0.230854 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>