More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1211 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1211  Extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
390 aa  781    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.391251  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0735  extracellular ligand-binding receptor  61.67 
 
 
385 aa  447  1.0000000000000001e-124  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0465  extracellular ligand-binding receptor  57.58 
 
 
416 aa  436  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0898027  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0717  Extracellular ligand-binding receptor  54.47 
 
 
413 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.726528  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0718  Extracellular ligand-binding receptor  55.37 
 
 
412 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2496  branched-chain amino-acid ABC transport system periplasmic binding protein  48.67 
 
 
399 aa  359  5e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.106087  hitchhiker  0.00162568 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0714  Extracellular ligand-binding receptor  48.25 
 
 
395 aa  358  6e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0331  Extracellular ligand-binding receptor  40.51 
 
 
377 aa  194  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179963  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2271  extracellular ligand-binding receptor  38.93 
 
 
378 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.731283  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0067  Extracellular ligand-binding receptor  37.18 
 
 
376 aa  188  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188079 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5603  Extracellular ligand-binding receptor  35.26 
 
 
393 aa  179  4.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.442467  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3793  Extracellular ligand-binding receptor  38.1 
 
 
386 aa  179  7e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.15379 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3906  Extracellular ligand-binding receptor  38.1 
 
 
386 aa  179  7e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01985  amino acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  37.22 
 
 
386 aa  177  4e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222636  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1651  Extracellular ligand-binding receptor  36.49 
 
 
392 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.689603  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2019  extracellular ligand-binding receptor  27.49 
 
 
374 aa  138  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3401  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  27.92 
 
 
396 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232513  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2114  Extracellular ligand-binding receptor  27.15 
 
 
405 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.447818  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1720  extracellular ligand-binding receptor  30.56 
 
 
396 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.565956  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2020  extracellular ligand-binding receptor  29.97 
 
 
384 aa  126  6e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.168799 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2283  Extracellular ligand-binding receptor  28.38 
 
 
395 aa  126  6e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000119381 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1137  Extracellular ligand-binding receptor  24.85 
 
 
393 aa  124  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0165472  normal  0.816566 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1610  extracellular ligand-binding receptor  28.39 
 
 
370 aa  124  3e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000136446  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0219  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.42 
 
 
376 aa  124  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00187981  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1676  extracellular ligand-binding receptor  28.26 
 
 
370 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000661006  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0522  Extracellular ligand-binding receptor  26.33 
 
 
387 aa  120  6e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1065  Extracellular ligand-binding receptor  29.17 
 
 
381 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000196823  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1934  Extracellular ligand-binding receptor  27.36 
 
 
397 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000937878  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4261  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  26.57 
 
 
404 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2502  extracellular ligand-binding receptor  26.54 
 
 
399 aa  116  6e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.101059  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4395  Extracellular ligand-binding receptor  26.3 
 
 
404 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0932  Extracellular ligand-binding receptor  27.42 
 
 
376 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000568006  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2306  Extracellular ligand-binding receptor  25.67 
 
 
419 aa  115  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.110917  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4416  Extracellular ligand-binding receptor  26.01 
 
 
404 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1166  Extracellular ligand-binding receptor  26.8 
 
 
387 aa  114  3e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.428965 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3057  Extracellular ligand-binding receptor  29.06 
 
 
398 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1468  extracellular ligand-binding receptor  26.38 
 
 
369 aa  113  7.000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000538626  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1891  branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic protein  25.14 
 
 
395 aa  110  3e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2022  Extracellular ligand-binding receptor  26.8 
 
 
373 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.882154  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0562  extracellular ligand-binding receptor  25.27 
 
 
385 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.419655  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2113  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  25.8 
 
 
399 aa  109  7.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2240  extracellular ligand-binding receptor  28.03 
 
 
394 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0350  extracellular ligand-binding receptor  26.85 
 
 
376 aa  108  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000281139  normal  0.291499 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2323  extracellular ligand-binding receptor  24.39 
 
 
383 aa  107  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2556  branched chain amino acid ABC transporter (substrate-binding protein)  27.97 
 
 
392 aa  105  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00169682  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3294  hypothetical protein  28.12 
 
 
383 aa  105  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.953272  normal  0.0380984 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2428  Extracellular ligand-binding receptor  26.76 
 
 
381 aa  105  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.632762  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4416  extracellular ligand-binding receptor  24.24 
 
 
402 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.859568  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0042  extracellular ligand-binding receptor  26.03 
 
 
368 aa  104  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.538449  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1970  extracellular ligand-binding receptor  25.61 
 
 
372 aa  103  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1290  branched chain amino acid ABC transporter permease  27.76 
 
 
392 aa  103  5e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.169952  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0012  putative branched-chain amino acid ABC transporter, perisplasmic amino acid-binding protein  25.52 
 
 
368 aa  103  5e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.318461  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0393  Extracellular ligand-binding receptor  26.42 
 
 
381 aa  103  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1392  Extracellular ligand-binding receptor  25.39 
 
 
382 aa  102  9e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.54413  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0538  extracellular ligand-binding receptor  27.06 
 
 
368 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0513259  normal  0.872247 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0635  Extracellular ligand-binding receptor  28.26 
 
 
378 aa  102  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000043194  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4327  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.42 
 
 
402 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0460  Extracellular ligand-binding receptor  27.57 
 
 
375 aa  102  2e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2535  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.59 
 
 
397 aa  102  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3937  extracellular ligand-binding receptor  25.59 
 
 
397 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.108497  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1469  extracellular ligand-binding receptor  27.25 
 
 
370 aa  102  2e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000103418  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5317  extracellular ligand-binding receptor  25.59 
 
 
397 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.862776  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4231  Extracellular ligand-binding receptor  29.97 
 
 
384 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3583  extracellular ligand-binding receptor  25.59 
 
 
397 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.160701  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0805  Extracellular ligand-binding receptor  28.36 
 
 
384 aa  101  3e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.822655  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0398  ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  28.57 
 
 
391 aa  100  4e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000849541  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4108  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.61 
 
 
374 aa  99.4  9e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0910585  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1131  extracellular ligand-binding receptor  26.55 
 
 
389 aa  99.4  9e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0523  Extracellular ligand-binding receptor  26.22 
 
 
390 aa  99.4  9e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0215267  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0480  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component  25.42 
 
 
391 aa  99.8  9e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.199357  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1734  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  28.15 
 
 
380 aa  99.4  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.534498  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0014  branched-chain amino acid ABC transporter, perisplasmic amino acid-binding protein, putative  25.26 
 
 
368 aa  99  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1387  extracellular ligand-binding receptor  26.93 
 
 
373 aa  99  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.279691 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0404  extracellular ligand-binding receptor  27.83 
 
 
409 aa  99.4  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0168747  normal  0.259327 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2038  Extracellular ligand-binding receptor  25.08 
 
 
379 aa  99.4  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000518039 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1671  extracellular ligand-binding receptor  26.61 
 
 
379 aa  99.4  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5102  extracellular ligand-binding receptor  26.6 
 
 
397 aa  99.4  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.294794 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0112  extracellular ligand-binding receptor  25.88 
 
 
381 aa  99.4  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3845  extracellular ligand-binding receptor  24.86 
 
 
374 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.390057  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5152  extracellular ligand-binding receptor  27.39 
 
 
383 aa  97.8  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.482519  normal  0.580615 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0090  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.18 
 
 
395 aa  97.4  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0960253  normal  0.350813 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0095  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.08 
 
 
399 aa  97.4  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.237273 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2130  extracellular ligand-binding receptor  27.48 
 
 
380 aa  97.1  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.482674  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6002  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component  26.54 
 
 
389 aa  97.1  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.0284097 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3645  extracellular ligand-binding receptor  25.71 
 
 
401 aa  97.1  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.218866  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0937  Extracellular ligand-binding receptor  24.76 
 
 
380 aa  96.7  6e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000952162  normal  0.230854 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1095  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.71 
 
 
406 aa  96.3  9e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1193  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  25.43 
 
 
406 aa  95.5  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31768  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6628  extracellular ligand-binding receptor  29.79 
 
 
384 aa  95.9  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.733405 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0769  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.19 
 
 
371 aa  95.1  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0554402  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0906  extracellular ligand-binding receptor  24.79 
 
 
439 aa  95.1  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1478  Extracellular ligand-binding receptor  26.5 
 
 
376 aa  94.4  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2189  Extracellular ligand-binding receptor  24.32 
 
 
379 aa  94.7  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1861  Extracellular ligand-binding receptor  24.57 
 
 
379 aa  94.4  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.571716  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2131  extracellular ligand-binding receptor  26.13 
 
 
379 aa  94.7  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0617424  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0610  Extracellular ligand-binding receptor  25.23 
 
 
378 aa  94.7  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1582  branched-chain amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.24 
 
 
388 aa  94  4e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000809144  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6079  extracellular ligand-binding receptor  29.79 
 
 
384 aa  94  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.829496  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2306  extracellular ligand-binding receptor  24.32 
 
 
376 aa  94.4  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1842  extracellular ligand-binding receptor  27.91 
 
 
394 aa  93.2  7e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.843132  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>