More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2750 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2750  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  100 
 
 
425 aa  880    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0109739  normal  0.254921 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1221  Extracellular ligand-binding receptor  29.73 
 
 
472 aa  171  3e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0653937 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4100  extracellular ligand-binding receptor  27.91 
 
 
387 aa  164  3e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.199713  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0531  extracellular ligand-binding receptor  27.75 
 
 
386 aa  162  1e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000267349  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4101  extracellular ligand-binding receptor  28.46 
 
 
387 aa  160  4e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4935  Extracellular ligand-binding receptor  28.41 
 
 
389 aa  156  6e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0712  putative lipoprotein  28.21 
 
 
480 aa  156  7e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3597  extracellular ligand-binding receptor  29.87 
 
 
398 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2369  extracellular ligand-binding receptor  28.49 
 
 
423 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.391884  normal  0.390615 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4184  extracellular ligand-binding receptor  30.27 
 
 
377 aa  152  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.891545 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0974  Extracellular ligand-binding receptor  27.07 
 
 
408 aa  151  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3504  extracellular ligand-binding receptor  28 
 
 
392 aa  151  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0407454  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0446  Extracellular ligand-binding receptor  28.23 
 
 
388 aa  145  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3009  extracellular ligand-binding receptor  31.22 
 
 
415 aa  144  3e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000545529  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5877  putative branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic component  29.95 
 
 
379 aa  142  8e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0961  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  27.84 
 
 
496 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0963  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  28.45 
 
 
517 aa  140  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1428  Extracellular ligand-binding receptor  29.58 
 
 
401 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3153  extracellular ligand-binding receptor  29.43 
 
 
398 aa  139  7.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.154593  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3540  extracellular ligand-binding receptor  30.48 
 
 
377 aa  138  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.229705  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2189  Extracellular ligand-binding receptor  31.03 
 
 
379 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5154  putative branched-chain amino acid ABC transport system substrate-binding protein  30.08 
 
 
399 aa  136  9e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.210774  normal  0.0422274 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3869  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  28.82 
 
 
519 aa  135  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.222307 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0487  extracellular ligand-binding receptor  27 
 
 
367 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0768  extracellular ligand-binding receptor  31.92 
 
 
380 aa  132  7.999999999999999e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.567193 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1725  putative leucine/isoleucine/valine-binding protein precursor  29.4 
 
 
393 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0953  extracellular ligand-binding receptor  28.41 
 
 
426 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1828  hypothetical protein  27.38 
 
 
539 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00860183  normal  0.522901 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3111  Extracellular ligand-binding receptor  29.62 
 
 
385 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4342  extracellular ligand-binding receptor  29.38 
 
 
373 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.688129 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1738  leucine/isoleucine/valine-binding protein precursor  27.17 
 
 
409 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0827731 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2746  Extracellular ligand-binding receptor  29.62 
 
 
385 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0962  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  27.23 
 
 
512 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0108  Extracellular ligand-binding receptor  27.24 
 
 
388 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0219  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.29 
 
 
376 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00187981  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3815  extracellular ligand-binding receptor  27.67 
 
 
368 aa  130  7.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4650  putative ABC transporter (substrate-binding protein); putative branched-chain amino acid transporter  27.81 
 
 
400 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4246  Extracellular ligand-binding receptor  26.06 
 
 
409 aa  127  5e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1615  extracellular ligand-binding receptor  26.5 
 
 
411 aa  127  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.308041 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1594  Extracellular ligand-binding receptor  28.01 
 
 
394 aa  126  6e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4103  extracellular ligand-binding receptor  26.23 
 
 
401 aa  126  6e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.742112  normal  0.0857946 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0508  extracellular ligand-binding receptor  28.44 
 
 
403 aa  126  9e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000199641  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5396  extracellular ligand-binding receptor  27.79 
 
 
378 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5604  putative extracellular ligand-binding receptor  26.71 
 
 
386 aa  125  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.236032 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0352  extracellular ligand-binding receptor  25.21 
 
 
410 aa  125  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.115416  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4614  extracellular ligand-binding receptor  27.22 
 
 
406 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4140  extracellular ligand-binding receptor  27.02 
 
 
370 aa  125  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.544868 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1131  extracellular ligand-binding receptor  28.44 
 
 
385 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1635  putative branched-chain amino acid ABC transporter  26.44 
 
 
497 aa  124  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.314294  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1595  extracellular ligand-binding receptor  26.21 
 
 
411 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.523513  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2038  Extracellular ligand-binding receptor  29.35 
 
 
379 aa  124  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000518039 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2733  Extracellular ligand-binding receptor  23.96 
 
 
407 aa  124  4e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3561  extracellular ligand-binding receptor  25.5 
 
 
409 aa  124  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3562  putative leucine/isoleucine/valine-binding protein precursor  26.13 
 
 
409 aa  123  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0038  extracellular ligand-binding receptor  26.84 
 
 
406 aa  123  7e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3560  extracellular ligand-binding receptor  25.91 
 
 
411 aa  123  8e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.726041  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2059  Extracellular ligand-binding receptor  27.64 
 
 
375 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0558608  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2864  Leu/Ile/Val-binding signal peptide protein  28.27 
 
 
385 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.110112  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7651  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  26.3 
 
 
415 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.99279  normal  0.165016 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0479  extracellular ligand-binding receptor  26.58 
 
 
390 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3633  Extracellular ligand-binding receptor  28.95 
 
 
402 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0460  Extracellular ligand-binding receptor  26.06 
 
 
375 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0920  extracellular ligand-binding receptor  28.13 
 
 
382 aa  121  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0921  extracellular ligand-binding receptor  27.58 
 
 
382 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.589524  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7082  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic-binding protein  27.15 
 
 
407 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0997  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.26 
 
 
392 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.489385  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2079  Extracellular ligand-binding receptor  26.54 
 
 
386 aa  119  9.999999999999999e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0666  ABC transporter substrate-binding protein  25.13 
 
 
410 aa  119  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.112312 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3339  extracellular ligand-binding receptor  27.39 
 
 
410 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.154352  normal  0.135284 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22980  amino acid-binding protein  26.94 
 
 
434 aa  119  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0512293  normal  0.104714 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3265  twin-arginine translocation pathway signal  27.81 
 
 
407 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.125818  normal  0.653443 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3566  extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 
411 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.172998  normal  0.680161 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0121  extracellular ligand-binding receptor  26.67 
 
 
406 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2427  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  27.15 
 
 
403 aa  117  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2791  Extracellular ligand-binding receptor  25.06 
 
 
436 aa  117  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55279  normal  0.125183 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1740  extracellular ligand-binding receptor  25.62 
 
 
435 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398941  normal  0.157953 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4245  ABC transporter substrate-binding protein  25.97 
 
 
410 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0583  Extracellular ligand-binding receptor  25.75 
 
 
406 aa  117  5e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.981919  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3559  extracellular ligand-binding receptor  25.75 
 
 
418 aa  117  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0888701  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2248  Extracellular ligand-binding receptor  26.26 
 
 
410 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1779  hypothetical protein  26.68 
 
 
438 aa  116  7.999999999999999e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0874  putative amino-acid ABC transport system, periplasmic binding protein  28.18 
 
 
406 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.034766  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3823  Extracellular ligand-binding receptor  27.72 
 
 
394 aa  116  7.999999999999999e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00025514  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1734  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  27.84 
 
 
380 aa  116  8.999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.534498  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1693  extracellular ligand-binding receptor  27.19 
 
 
377 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.502178  normal  0.251064 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2010  Extracellular ligand-binding receptor  28.2 
 
 
377 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.467518  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2019  extracellular ligand-binding receptor  29.56 
 
 
374 aa  115  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1898  extracellular ligand-binding receptor  24.8 
 
 
411 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.193262 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0825  extracellular ligand-binding receptor  23.38 
 
 
380 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0188  Extracellular ligand-binding receptor  28.05 
 
 
386 aa  115  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0335  Extracellular ligand-binding receptor  28.09 
 
 
374 aa  114  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0752  extracellular ligand-binding receptor  26.32 
 
 
405 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.284007  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4590  Extracellular ligand-binding receptor  28.31 
 
 
441 aa  114  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3749  extracellular ligand-binding receptor  25.5 
 
 
374 aa  113  5e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.314564  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1838  extracellular ligand-binding receptor  27.46 
 
 
399 aa  113  5e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000495341  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0355  extracellular ligand-binding receptor  27.69 
 
 
394 aa  113  5e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1861  Extracellular ligand-binding receptor  28.85 
 
 
379 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.571716  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3001  extracellular ligand-binding receptor  27.15 
 
 
392 aa  113  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4244  Extracellular ligand-binding receptor  26.79 
 
 
411 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4060  extracellular ligand-binding receptor  26.33 
 
 
384 aa  112  9e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.255859 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>