More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_4184 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_4184  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 377 aa  763    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.891545 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0920  extracellular ligand-binding receptor  42.52 
 
 		 382 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3540  extracellular ligand-binding receptor  42.54 
 
 		 377 aa  296  3e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.229705  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2059  Extracellular ligand-binding receptor  44.41 
 
 		 375 aa  296  3e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0558608  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3153  extracellular ligand-binding receptor  42.82 
 
 		 398 aa  290  3e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.154593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3111  Extracellular ligand-binding receptor  42.38 
 
 		 385 aa  280  2e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2746  Extracellular ligand-binding receptor  42.38 
 
 		 385 aa  281  2e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3001  extracellular ligand-binding receptor  42.12 
 
 		 392 aa  277  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0921  extracellular ligand-binding receptor  40.98 
 
 		 382 aa  276  4e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.589524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0768  extracellular ligand-binding receptor  44.48 
 
 		 380 aa  271  2e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.567193 
 
 
-
 
NC_003296  RS03096  putative Leu/Ile/Val-binding lipoprotein transmembrane  39.69 
 
 		 386 aa  268  8.999999999999999e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0735365  normal  0.368181 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0335  Extracellular ligand-binding receptor  40.75 
 
 		 374 aa  263  4e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5877  putative branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic component  38.86 
 
 		 379 aa  253  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1131  extracellular ligand-binding receptor  40.57 
 
 		 385 aa  252  8.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3606  extracellular ligand-binding receptor  38.87 
 
 		 395 aa  249  5e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.316629 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2864  Leu/Ile/Val-binding signal peptide protein  40.11 
 
 		 385 aa  248  1e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.110112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5396  extracellular ligand-binding receptor  38.92 
 
 		 378 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4876  extracellular ligand-binding receptor  40.46 
 
 		 378 aa  238  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.983185  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0443  Extracellular ligand-binding receptor  42.16 
 
 		 382 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.363055  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0452  extracellular ligand-binding receptor  42.16 
 
 		 382 aa  232  7.000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.128382  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3061  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  38.75 
 
 		 388 aa  231  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.664691  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5604  putative extracellular ligand-binding receptor  37.64 
 
 		 386 aa  224  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.236032 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3815  extracellular ligand-binding receptor  34.31 
 
 		 368 aa  222  7e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4060  extracellular ligand-binding receptor  36.83 
 
 		 384 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.255859 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4140  extracellular ligand-binding receptor  34.34 
 
 		 370 aa  220  3e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.544868 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2993  Extracellular ligand-binding receptor  38.11 
 
 		 363 aa  219  7.999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3340  Extracellular ligand-binding receptor  37.82 
 
 		 394 aa  218  1e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.157564  normal  0.523018 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3178  extracellular ligand-binding receptor  37.71 
 
 		 386 aa  216  4e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.677267  normal  0.56284 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2010  Extracellular ligand-binding receptor  35.44 
 
 		 377 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.467518  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1693  extracellular ligand-binding receptor  35.44 
 
 		 377 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.502178  normal  0.251064 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0712  putative lipoprotein  39.27 
 
 		 480 aa  212  1e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2369  extracellular ligand-binding receptor  38.74 
 
 		 423 aa  211  2e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.391884  normal  0.390615 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0188  Extracellular ligand-binding receptor  35.88 
 
 		 386 aa  210  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1615  extracellular ligand-binding receptor  37.24 
 
 		 411 aa  209  8e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.308041 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5732  extracellular ligand-binding receptor  32.66 
 
 		 403 aa  208  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588725 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0789  extracellular ligand-binding receptor  33.59 
 
 		 383 aa  208  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.394286  normal  0.786087 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1595  extracellular ligand-binding receptor  37.16 
 
 		 411 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.523513  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3030  Extracellular ligand-binding receptor  35 
 
 		 374 aa  207  3e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.394704  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3748  extracellular ligand-binding receptor  33.06 
 
 		 370 aa  206  4e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1221  Extracellular ligand-binding receptor  38.34 
 
 		 472 aa  206  7e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0653937 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3029  Extracellular ligand-binding receptor  32.78 
 
 		 370 aa  205  9e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.518701  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3749  extracellular ligand-binding receptor  34.72 
 
 		 374 aa  205  1e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.314564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0487  extracellular ligand-binding receptor  32.79 
 
 		 367 aa  205  1e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0707  extracellular ligand-binding receptor  35.82 
 
 		 382 aa  203  4e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0045  extracellular ligand-binding receptor  33.7 
 
 		 385 aa  202  8e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.406138  normal  0.264074 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0108  Extracellular ligand-binding receptor  35.35 
 
 		 388 aa  202  9.999999999999999e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0065  Extracellular ligand-binding receptor  33.7 
 
 		 385 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4342  extracellular ligand-binding receptor  34.81 
 
 		 373 aa  199  7.999999999999999e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688129 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4704  Extracellular ligand-binding receptor  34.66 
 
 		 371 aa  197  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2079  Extracellular ligand-binding receptor  31.53 
 
 		 386 aa  195  9e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4703  Extracellular ligand-binding receptor  34.68 
 
 		 368 aa  194  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0681  extracellular ligand-binding receptor  33.68 
 
 		 382 aa  192  6e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.35117  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0549  extracellular ligand-binding receptor  32.38 
 
 		 384 aa  192  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0807314 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0974  Extracellular ligand-binding receptor  34.59 
 
 		 408 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0550  extracellular ligand-binding receptor  32.76 
 
 		 383 aa  190  2.9999999999999997e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0334765 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0953  extracellular ligand-binding receptor  34.89 
 
 		 426 aa  189  8e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2392  extracellular ligand-binding receptor  36.08 
 
 		 380 aa  186  6e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.152327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4388  extracellular ligand-binding receptor  33.42 
 
 		 372 aa  185  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.861875 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1879  putative amino acids-binding transmembrane protein  31.82 
 
 		 383 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.399388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0210  Extracellular ligand-binding receptor  34.92 
 
 		 592 aa  184  3e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.019468 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0963  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  33.89 
 
 		 517 aa  179  5.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0436  Extracellular ligand-binding receptor  32.57 
 
 		 379 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4031  extracellular ligand-binding receptor  33.62 
 
 		 381 aa  178  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2083 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1725  putative leucine/isoleucine/valine-binding protein precursor  36.59 
 
 		 393 aa  177  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3128  Extracellular ligand-binding receptor  33.9 
 
 		 387 aa  177  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151168  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0961  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  32.6 
 
 		 496 aa  175  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1020  twin-arginine translocation pathway signal  29.19 
 
 		 383 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0825  extracellular ligand-binding receptor  28.31 
 
 		 380 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21341  hypothetical protein  32.01 
 
 		 342 aa  172  5.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.551591 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2080  Extracellular ligand-binding receptor  32.18 
 
 		 383 aa  172  6.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0299  extracellular ligand-binding receptor  32.1 
 
 		 378 aa  169  8e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1040  Extracellular ligand-binding receptor  29.68 
 
 		 382 aa  164  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.098407 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2845  extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 		 388 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2334  Extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 		 388 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.10397  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1828  hypothetical protein  32.47 
 
 		 539 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00860183  normal  0.522901 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4409  extracellular ligand-binding receptor  30.13 
 
 		 383 aa  162  7e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0962  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  34.08 
 
 		 512 aa  161  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0364  putative substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  33.87 
 
 		 390 aa  160  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.194587 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4371  extracellular ligand-binding receptor  29.68 
 
 		 391 aa  159  9e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2765  extracellular ligand-binding receptor  29.49 
 
 		 408 aa  155  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.094864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1126  extracellular ligand-binding receptor  32.02 
 
 		 372 aa  151  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.293075 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2750  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.69 
 
 		 425 aa  150  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0109739  normal  0.254921 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1635  putative branched-chain amino acid ABC transporter  31.51 
 
 		 497 aa  149  6e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.314294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1690  extracellular ligand-binding receptor  29.67 
 
 		 382 aa  147  3e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.783096  normal  0.235233 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3869  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  31.58 
 
 		 519 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.222307 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1033  extracellular ligand-binding receptor  27.53 
 
 		 416 aa  145  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.344987  hitchhiker  0.000487812 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1004  Extracellular ligand-binding receptor  27.53 
 
 		 416 aa  145  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1307  Extracellular ligand-binding receptor  30.11 
 
 		 425 aa  145  1e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.168587  normal  0.0355411 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1431  putative substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  32.29 
 
 		 380 aa  144  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.21554 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0358  extracellular ligand-binding receptor  31.92 
 
 		 386 aa  141  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00342329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1014  putative substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  33.14 
 
 		 370 aa  139  6e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0676014 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1617  extracellular ligand-binding receptor  30.09 
 
 		 384 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.460677 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0508  extracellular ligand-binding receptor  28.61 
 
 		 403 aa  129  9.000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000199641  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2660  extracellular ligand-binding receptor  30.66 
 
 		 379 aa  122  7e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.51037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0874  putative amino-acid ABC transport system, periplasmic binding protein  30.32 
 
 		 406 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.034766  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0446  Extracellular ligand-binding receptor  33.73 
 
 		 388 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4614  extracellular ligand-binding receptor  30.03 
 
 		 406 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1661  hypothetical protein  28.45 
 
 		 430 aa  114  3e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.429909  normal  0.749387 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0796  extracellular ligand-binding receptor  29.29 
 
 		 406 aa  113  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0997  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.19 
 
 		 392 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.489385  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>