More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1661 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1661  hypothetical protein  100 
 
 		 430 aa  863    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.429909  normal  0.749387 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0210  Extracellular ligand-binding receptor  39.54 
 
 		 592 aa  240  4e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.019468 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1307  Extracellular ligand-binding receptor  38.15 
 
 		 425 aa  205  1e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.168587  normal  0.0355411 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1004  Extracellular ligand-binding receptor  29.34 
 
 		 416 aa  187  4e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1033  extracellular ligand-binding receptor  29.1 
 
 		 416 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.344987  hitchhiker  0.000487812 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2079  Extracellular ligand-binding receptor  36.7 
 
 		 386 aa  145  1e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3153  extracellular ligand-binding receptor  34.8 
 
 		 398 aa  143  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.154593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0825  extracellular ligand-binding receptor  32.63 
 
 		 380 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0452  extracellular ligand-binding receptor  38.27 
 
 		 382 aa  141  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.128382  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0335  Extracellular ligand-binding receptor  33.11 
 
 		 374 aa  140  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0443  Extracellular ligand-binding receptor  37.86 
 
 		 382 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.363055  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0768  extracellular ligand-binding receptor  38.02 
 
 		 380 aa  140  4.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.567193 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1615  extracellular ligand-binding receptor  35.82 
 
 		 411 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.308041 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3111  Extracellular ligand-binding receptor  34.17 
 
 		 385 aa  138  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2746  Extracellular ligand-binding receptor  34.17 
 
 		 385 aa  138  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1595  extracellular ligand-binding receptor  35.45 
 
 		 411 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.523513  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0920  extracellular ligand-binding receptor  29.96 
 
 		 382 aa  130  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1131  extracellular ligand-binding receptor  35.32 
 
 		 385 aa  129  7.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1221  Extracellular ligand-binding receptor  41.63 
 
 		 472 aa  126  8.000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0653937 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0921  extracellular ligand-binding receptor  33.77 
 
 		 382 aa  125  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.589524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0953  extracellular ligand-binding receptor  33.88 
 
 		 426 aa  125  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4876  extracellular ligand-binding receptor  35.51 
 
 		 378 aa  125  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.983185  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0974  Extracellular ligand-binding receptor  32.99 
 
 		 408 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0712  putative lipoprotein  38.79 
 
 		 480 aa  119  9e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2369  extracellular ligand-binding receptor  39.04 
 
 		 423 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.391884  normal  0.390615 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3540  extracellular ligand-binding receptor  34.62 
 
 		 377 aa  117  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.229705  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21341  hypothetical protein  29.13 
 
 		 342 aa  117  5e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.551591 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2864  Leu/Ile/Val-binding signal peptide protein  31.46 
 
 		 385 aa  116  7.999999999999999e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.110112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5604  putative extracellular ligand-binding receptor  35.86 
 
 		 386 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.236032 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5877  putative branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic component  31.39 
 
 		 379 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0108  Extracellular ligand-binding receptor  30.13 
 
 		 388 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4184  extracellular ligand-binding receptor  28.45 
 
 		 377 aa  114  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.891545 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3606  extracellular ligand-binding receptor  32.86 
 
 		 395 aa  114  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.316629 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5396  extracellular ligand-binding receptor  33.18 
 
 		 378 aa  113  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4060  extracellular ligand-binding receptor  34.88 
 
 		 384 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.255859 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3001  extracellular ligand-binding receptor  31.72 
 
 		 392 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3178  extracellular ligand-binding receptor  33.73 
 
 		 386 aa  109  9.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.677267  normal  0.56284 
 
 
-
 
NC_003296  RS03096  putative Leu/Ile/Val-binding lipoprotein transmembrane  31.46 
 
 		 386 aa  109  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0735365  normal  0.368181 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5732  extracellular ligand-binding receptor  33.01 
 
 		 403 aa  108  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588725 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0961  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  27.09 
 
 		 496 aa  106  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0963  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  28.13 
 
 		 517 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0487  extracellular ligand-binding receptor  29.29 
 
 		 367 aa  104  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2059  Extracellular ligand-binding receptor  34.08 
 
 		 375 aa  101  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0558608  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0188  Extracellular ligand-binding receptor  30.1 
 
 		 386 aa  102  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1725  putative leucine/isoleucine/valine-binding protein precursor  32.51 
 
 		 393 aa  101  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3815  extracellular ligand-binding receptor  28.52 
 
 		 368 aa  100  4e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0962  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  31.25 
 
 		 512 aa  100  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2334  Extracellular ligand-binding receptor  32.54 
 
 		 388 aa  99.8  9e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.10397  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2845  extracellular ligand-binding receptor  32.54 
 
 		 388 aa  99.8  9e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4704  Extracellular ligand-binding receptor  30.13 
 
 		 371 aa  99.8  9e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1635  putative branched-chain amino acid ABC transporter  30.2 
 
 		 497 aa  98.6  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.314294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0789  extracellular ligand-binding receptor  31.3 
 
 		 383 aa  97.4  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.394286  normal  0.786087 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1693  extracellular ligand-binding receptor  30.42 
 
 		 377 aa  97.1  5e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.502178  normal  0.251064 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0065  Extracellular ligand-binding receptor  34.94 
 
 		 385 aa  96.7  7e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2668  extracellular ligand-binding receptor  30 
 
 		 388 aa  96.7  8e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.965129  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1501  Extracellular ligand-binding receptor  30.17 
 
 		 381 aa  96.3  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.225006  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2010  Extracellular ligand-binding receptor  30 
 
 		 377 aa  95.9  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.467518  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3748  extracellular ligand-binding receptor  28.23 
 
 		 370 aa  95.9  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3029  Extracellular ligand-binding receptor  28.23 
 
 		 370 aa  95.1  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.518701  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4140  extracellular ligand-binding receptor  31.28 
 
 		 370 aa  95.1  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.544868 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3869  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  30.57 
 
 		 519 aa  94.4  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.222307 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3749  extracellular ligand-binding receptor  30.8 
 
 		 374 aa  94.7  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.314564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0045  extracellular ligand-binding receptor  34.34 
 
 		 385 aa  94.4  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.406138  normal  0.264074 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3030  Extracellular ligand-binding receptor  30.38 
 
 		 374 aa  93.2  8e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.394704  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0550  extracellular ligand-binding receptor  30.14 
 
 		 383 aa  93.2  8e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0334765 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0549  extracellular ligand-binding receptor  35.19 
 
 		 384 aa  92.8  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0807314 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4342  extracellular ligand-binding receptor  27.05 
 
 		 373 aa  92  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688129 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2130  extracellular ligand-binding receptor  26.03 
 
 		 380 aa  92  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.482674  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1504  Extracellular ligand-binding receptor  29.78 
 
 		 387 aa  92  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235771  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0681  extracellular ligand-binding receptor  31.71 
 
 		 382 aa  91.3  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.35117  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4031  extracellular ligand-binding receptor  29.57 
 
 		 381 aa  90.9  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2083 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0508  extracellular ligand-binding receptor  27.9 
 
 		 403 aa  89  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000199641  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2038  Extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 		 379 aa  87.8  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000518039 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1828  hypothetical protein  30.37 
 
 		 539 aa  86.7  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00860183  normal  0.522901 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4703  Extracellular ligand-binding receptor  27.62 
 
 		 368 aa  86.7  8e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0436  Extracellular ligand-binding receptor  37.84 
 
 		 379 aa  86.3  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1822  extracellular ligand-binding receptor  26.92 
 
 		 381 aa  85.5  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.56038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2189  Extracellular ligand-binding receptor  23.46 
 
 		 379 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1734  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  24.28 
 
 		 380 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.534498  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0446  Extracellular ligand-binding receptor  29.24 
 
 		 388 aa  84.7  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1681  extracellular ligand-binding receptor  24.9 
 
 		 385 aa  84.7  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.681493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3043  extracellular ligand-binding receptor  26.61 
 
 		 386 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.865554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4097  extracellular ligand-binding receptor  27.76 
 
 		 379 aa  83.2  0.000000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1671  extracellular ligand-binding receptor  25.1 
 
 		 379 aa  83.2  0.000000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2672  extracellular ligand-binding receptor  26.75 
 
 		 384 aa  83.2  0.000000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.211064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0358  extracellular ligand-binding receptor  31.4 
 
 		 386 aa  82.4  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00342329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3909  Extracellular ligand-binding receptor  26.48 
 
 		 386 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3504  extracellular ligand-binding receptor  27.78 
 
 		 392 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0407454  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0024  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.48 
 
 		 386 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3577  extracellular ligand-binding receptor  28.39 
 
 		 412 aa  82.8  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1735  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  25.1 
 
 		 378 aa  82  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1500  Extracellular ligand-binding receptor  29.2 
 
 		 388 aa  82.4  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.145866  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2494  Extracellular ligand-binding receptor  27.59 
 
 		 379 aa  82.4  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.564109  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0355  extracellular ligand-binding receptor  27.73 
 
 		 394 aa  82  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3324  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.13 
 
 		 385 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0089  extracellular ligand-binding receptor  24.9 
 
 		 385 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.332723  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3340  Extracellular ligand-binding receptor  32.57 
 
 		 394 aa  80.1  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.157564  normal  0.523018 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0106  extracellular ligand-binding receptor  24.9 
 
 		 385 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.113472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2966  extracellular ligand-binding receptor  24.9 
 
 		 385 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.106673  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3061  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  30.51 
 
 		 388 aa  80.1  0.00000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.664691  normal  0.158134 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>