More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3748 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_3748  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
370 aa  753    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178822  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3029  Extracellular ligand-binding receptor  99.46 
 
 
370 aa  750    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.518701  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4140  extracellular ligand-binding receptor  72.97 
 
 
370 aa  568  1e-161  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.544868 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0487  extracellular ligand-binding receptor  70.96 
 
 
367 aa  539  9.999999999999999e-153  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3815  extracellular ligand-binding receptor  69.73 
 
 
368 aa  535  1e-151  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4342  extracellular ligand-binding receptor  72.16 
 
 
373 aa  525  1e-148  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.688129 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3030  Extracellular ligand-binding receptor  61.35 
 
 
374 aa  484  1e-136  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.394704  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3749  extracellular ligand-binding receptor  61.35 
 
 
374 aa  485  1e-136  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.314564  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4703  Extracellular ligand-binding receptor  62.64 
 
 
368 aa  460  9.999999999999999e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2010  Extracellular ligand-binding receptor  58.47 
 
 
377 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.467518  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1693  extracellular ligand-binding receptor  58.47 
 
 
377 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.502178  normal  0.251064 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4704  Extracellular ligand-binding receptor  58.57 
 
 
371 aa  419  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5877  putative branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic component  46.26 
 
 
379 aa  325  7e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5396  extracellular ligand-binding receptor  45.6 
 
 
378 aa  323  2e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1879  putative amino acids-binding transmembrane protein  42.19 
 
 
383 aa  269  5e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.399388  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2080  Extracellular ligand-binding receptor  41.46 
 
 
383 aa  261  2e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1040  Extracellular ligand-binding receptor  38.18 
 
 
382 aa  242  7.999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.098407 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3111  Extracellular ligand-binding receptor  32.53 
 
 
385 aa  218  2e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2746  Extracellular ligand-binding receptor  32.53 
 
 
385 aa  218  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2059  Extracellular ligand-binding receptor  36.08 
 
 
375 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0558608  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3153  extracellular ligand-binding receptor  32.77 
 
 
398 aa  212  7.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.154593  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2864  Leu/Ile/Val-binding signal peptide protein  32.36 
 
 
385 aa  212  1e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.110112  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3540  extracellular ligand-binding receptor  34.27 
 
 
377 aa  208  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.229705  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3001  extracellular ligand-binding receptor  34.38 
 
 
392 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4184  extracellular ligand-binding receptor  33.06 
 
 
377 aa  206  4e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.891545 
 
 
-
 
NC_003296  RS03096  putative Leu/Ile/Val-binding lipoprotein transmembrane  32.63 
 
 
386 aa  205  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0735365  normal  0.368181 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3606  extracellular ligand-binding receptor  33.24 
 
 
395 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.316629 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0920  extracellular ligand-binding receptor  32.37 
 
 
382 aa  200  3.9999999999999996e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0768  extracellular ligand-binding receptor  32.97 
 
 
380 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.567193 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0335  Extracellular ligand-binding receptor  33.14 
 
 
374 aa  191  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5732  extracellular ligand-binding receptor  30.97 
 
 
403 aa  186  4e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.588725 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4876  extracellular ligand-binding receptor  33.71 
 
 
378 aa  186  5e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.983185  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1615  extracellular ligand-binding receptor  33.43 
 
 
411 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.308041 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1595  extracellular ligand-binding receptor  33.14 
 
 
411 aa  182  6e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.523513  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0549  extracellular ligand-binding receptor  30.62 
 
 
384 aa  182  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0807314 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0974  Extracellular ligand-binding receptor  35.21 
 
 
408 aa  182  1e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0452  extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 
382 aa  180  4e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.128382  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0443  Extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 
382 aa  180  4.999999999999999e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.363055  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0921  extracellular ligand-binding receptor  33.52 
 
 
382 aa  179  5.999999999999999e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.589524  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2369  extracellular ligand-binding receptor  33.52 
 
 
423 aa  176  5e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.391884  normal  0.390615 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3061  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  32.79 
 
 
388 aa  172  6.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.664691  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1221  Extracellular ligand-binding receptor  32 
 
 
472 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0653937 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2765  extracellular ligand-binding receptor  31.15 
 
 
408 aa  169  9e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.094864  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0188  Extracellular ligand-binding receptor  30.9 
 
 
386 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0550  extracellular ligand-binding receptor  28.98 
 
 
383 aa  167  4e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0334765 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0712  putative lipoprotein  31.87 
 
 
480 aa  166  6.9999999999999995e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0045  extracellular ligand-binding receptor  28.69 
 
 
385 aa  166  6.9999999999999995e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.406138  normal  0.264074 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0789  extracellular ligand-binding receptor  30.85 
 
 
383 aa  166  8e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.394286  normal  0.786087 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4060  extracellular ligand-binding receptor  31.48 
 
 
384 aa  163  5.0000000000000005e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.255859 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0065  Extracellular ligand-binding receptor  28.41 
 
 
385 aa  162  7e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1131  extracellular ligand-binding receptor  30.48 
 
 
385 aa  162  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2392  extracellular ligand-binding receptor  34.28 
 
 
380 aa  162  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.152327  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1020  twin-arginine translocation pathway signal  30.57 
 
 
383 aa  158  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3178  extracellular ligand-binding receptor  29.97 
 
 
386 aa  157  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.677267  normal  0.56284 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3340  Extracellular ligand-binding receptor  30.4 
 
 
394 aa  156  7e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.157564  normal  0.523018 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2845  extracellular ligand-binding receptor  30.84 
 
 
388 aa  154  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2334  Extracellular ligand-binding receptor  30.84 
 
 
388 aa  154  2e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.10397  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1307  Extracellular ligand-binding receptor  28.75 
 
 
425 aa  152  7e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.168587  normal  0.0355411 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0681  extracellular ligand-binding receptor  29.95 
 
 
382 aa  151  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.35117  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4388  extracellular ligand-binding receptor  31.09 
 
 
372 aa  152  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.861875 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2993  Extracellular ligand-binding receptor  30 
 
 
363 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4031  extracellular ligand-binding receptor  29.3 
 
 
381 aa  150  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.2083 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0531  extracellular ligand-binding receptor  28.7 
 
 
386 aa  147  3e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000267349  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1725  putative leucine/isoleucine/valine-binding protein precursor  32.77 
 
 
393 aa  145  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5604  putative extracellular ligand-binding receptor  29.01 
 
 
386 aa  142  8e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.236032 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4371  extracellular ligand-binding receptor  29.53 
 
 
391 aa  142  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0299  extracellular ligand-binding receptor  30.75 
 
 
378 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4409  extracellular ligand-binding receptor  29.27 
 
 
383 aa  140  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1033  extracellular ligand-binding receptor  27.37 
 
 
416 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.344987  hitchhiker  0.000487812 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1004  Extracellular ligand-binding receptor  27.37 
 
 
416 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0953  extracellular ligand-binding receptor  30.66 
 
 
426 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1014  putative substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  32.49 
 
 
370 aa  129  9.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0676014 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0436  Extracellular ligand-binding receptor  26.61 
 
 
379 aa  128  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21341  hypothetical protein  28.62 
 
 
342 aa  125  9e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.551591 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0508  extracellular ligand-binding receptor  28.74 
 
 
403 aa  125  2e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000199641  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00418  hypothetical protein  26.98 
 
 
380 aa  124  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.303098  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0364  putative substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  29.56 
 
 
390 aa  122  8e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.194587 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0108  Extracellular ligand-binding receptor  27.36 
 
 
388 aa  122  9e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0825  extracellular ligand-binding receptor  26.42 
 
 
380 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1431  putative substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  29.92 
 
 
380 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.21554 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1635  putative branched-chain amino acid ABC transporter  28.49 
 
 
497 aa  120  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.314294  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0210  Extracellular ligand-binding receptor  28.61 
 
 
592 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.019468 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0707  extracellular ligand-binding receptor  26.72 
 
 
382 aa  118  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142871  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2079  Extracellular ligand-binding receptor  24.32 
 
 
386 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1690  extracellular ligand-binding receptor  26.93 
 
 
382 aa  112  7.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.783096  normal  0.235233 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22980  amino acid-binding protein  26.33 
 
 
434 aa  108  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0512293  normal  0.104714 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1828  hypothetical protein  27.17 
 
 
539 aa  108  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00860183  normal  0.522901 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2750  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.97 
 
 
425 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0109739  normal  0.254921 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0963  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  25.93 
 
 
517 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3147  hypothetical protein  26.87 
 
 
382 aa  107  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.303514 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0962  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  27.68 
 
 
512 aa  107  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3128  Extracellular ligand-binding receptor  25.71 
 
 
387 aa  107  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151168  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0961  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  27.01 
 
 
496 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0376  extracellular ligand-binding receptor  27.25 
 
 
381 aa  104  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000374663  hitchhiker  0.000123514 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1779  hypothetical protein  24.37 
 
 
438 aa  104  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2660  extracellular ligand-binding receptor  28.81 
 
 
379 aa  105  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.51037  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2791  Extracellular ligand-binding receptor  25.56 
 
 
436 aa  104  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55279  normal  0.125183 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7082  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic-binding protein  27.53 
 
 
407 aa  103  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1617  extracellular ligand-binding receptor  27.42 
 
 
384 aa  102  7e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.460677 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3869  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  27.4 
 
 
519 aa  102  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.222307 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>