More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4031 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4031  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 381 aa  761    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2083 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2746  Extracellular ligand-binding receptor  37.04 
 
 		 385 aa  232  9e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3111  Extracellular ligand-binding receptor  37.04 
 
 		 385 aa  232  1e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3153  extracellular ligand-binding receptor  37.3 
 
 		 398 aa  231  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.154593  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2864  Leu/Ile/Val-binding signal peptide protein  37.04 
 
 		 385 aa  223  6e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.110112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3001  extracellular ligand-binding receptor  37.78 
 
 		 392 aa  222  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03096  putative Leu/Ile/Val-binding lipoprotein transmembrane  33.78 
 
 		 386 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0735365  normal  0.368181 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0768  extracellular ligand-binding receptor  35.26 
 
 		 380 aa  200  3e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.567193 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1131  extracellular ligand-binding receptor  36.29 
 
 		 385 aa  196  4.0000000000000005e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0335  Extracellular ligand-binding receptor  34.39 
 
 		 374 aa  196  6e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4184  extracellular ligand-binding receptor  33.42 
 
 		 377 aa  184  3e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.891545 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0443  Extracellular ligand-binding receptor  34.7 
 
 		 382 aa  181  1e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.363055  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0452  extracellular ligand-binding receptor  35.22 
 
 		 382 aa  181  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.128382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3540  extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 		 377 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.229705  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4876  extracellular ligand-binding receptor  33.62 
 
 		 378 aa  176  4e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.983185  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0920  extracellular ligand-binding receptor  32.19 
 
 		 382 aa  177  4e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5877  putative branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic component  32.08 
 
 		 379 aa  172  6.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5396  extracellular ligand-binding receptor  30.89 
 
 		 378 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4140  extracellular ligand-binding receptor  28.57 
 
 		 370 aa  162  9e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.544868 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4060  extracellular ligand-binding receptor  28.46 
 
 		 384 aa  160  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.255859 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0487  extracellular ligand-binding receptor  29.97 
 
 		 367 aa  160  4e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0681  extracellular ligand-binding receptor  31.07 
 
 		 382 aa  157  3e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.35117  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3030  Extracellular ligand-binding receptor  30.36 
 
 		 374 aa  157  4e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.394704  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0789  extracellular ligand-binding receptor  29.02 
 
 		 383 aa  156  5.0000000000000005e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.394286  normal  0.786087 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3606  extracellular ligand-binding receptor  30.43 
 
 		 395 aa  156  6e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.316629 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3748  extracellular ligand-binding receptor  29.51 
 
 		 370 aa  155  8e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3029  Extracellular ligand-binding receptor  29.78 
 
 		 370 aa  155  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.518701  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4342  extracellular ligand-binding receptor  31.03 
 
 		 373 aa  155  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688129 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3749  extracellular ligand-binding receptor  30.08 
 
 		 374 aa  154  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.314564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3815  extracellular ligand-binding receptor  29.7 
 
 		 368 aa  154  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2392  extracellular ligand-binding receptor  31.46 
 
 		 380 aa  154  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.152327  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4704  Extracellular ligand-binding receptor  31.41 
 
 		 371 aa  153  5e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1693  extracellular ligand-binding receptor  30.11 
 
 		 377 aa  152  7e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.502178  normal  0.251064 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4409  extracellular ligand-binding receptor  30.89 
 
 		 383 aa  152  8e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0188  Extracellular ligand-binding receptor  29.53 
 
 		 386 aa  152  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2010  Extracellular ligand-binding receptor  29.84 
 
 		 377 aa  152  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.467518  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3128  Extracellular ligand-binding receptor  33.9 
 
 		 387 aa  151  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151168  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2080  Extracellular ligand-binding receptor  31.78 
 
 		 383 aa  151  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1615  extracellular ligand-binding receptor  30.46 
 
 		 411 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.308041 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1879  putative amino acids-binding transmembrane protein  30.59 
 
 		 383 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.399388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1595  extracellular ligand-binding receptor  30.19 
 
 		 411 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.523513  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4703  Extracellular ligand-binding receptor  32.09 
 
 		 368 aa  145  8.000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0065  Extracellular ligand-binding receptor  30.73 
 
 		 385 aa  143  4e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0921  extracellular ligand-binding receptor  30.68 
 
 		 382 aa  142  7e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.589524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0299  extracellular ligand-binding receptor  31.48 
 
 		 378 aa  142  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1040  Extracellular ligand-binding receptor  28.84 
 
 		 382 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.098407 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0045  extracellular ligand-binding receptor  30.45 
 
 		 385 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.406138  normal  0.264074 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2059  Extracellular ligand-binding receptor  29.23 
 
 		 375 aa  140  3e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0558608  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2765  extracellular ligand-binding receptor  30.6 
 
 		 408 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.094864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5732  extracellular ligand-binding receptor  28.53 
 
 		 403 aa  137  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588725 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4371  extracellular ligand-binding receptor  30.47 
 
 		 391 aa  137  4e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0549  extracellular ligand-binding receptor  31.13 
 
 		 384 aa  136  5e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0807314 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0436  Extracellular ligand-binding receptor  29.92 
 
 		 379 aa  133  6e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1221  Extracellular ligand-binding receptor  30.47 
 
 		 472 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0653937 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2369  extracellular ligand-binding receptor  30.36 
 
 		 423 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.391884  normal  0.390615 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0550  extracellular ligand-binding receptor  30.83 
 
 		 383 aa  130  4.0000000000000003e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0334765 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0707  extracellular ligand-binding receptor  30.92 
 
 		 382 aa  129  7.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1307  Extracellular ligand-binding receptor  28.65 
 
 		 425 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.168587  normal  0.0355411 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4388  extracellular ligand-binding receptor  30.7 
 
 		 372 aa  129  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.861875 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5604  putative extracellular ligand-binding receptor  27.12 
 
 		 386 aa  127  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.236032 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3061  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  28.42 
 
 		 388 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.664691  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0974  Extracellular ligand-binding receptor  27.89 
 
 		 408 aa  126  8.000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3178  extracellular ligand-binding receptor  30.87 
 
 		 386 aa  125  9e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.677267  normal  0.56284 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0712  putative lipoprotein  29.12 
 
 		 480 aa  125  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1020  twin-arginine translocation pathway signal  25.99 
 
 		 383 aa  123  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0364  putative substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  30.68 
 
 		 390 aa  120  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.194587 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3340  Extracellular ligand-binding receptor  29.1 
 
 		 394 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.157564  normal  0.523018 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0825  extracellular ligand-binding receptor  25.8 
 
 		 380 aa  119  9.999999999999999e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1431  putative substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  27.48 
 
 		 380 aa  119  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.21554 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2993  Extracellular ligand-binding receptor  29.38 
 
 		 363 aa  117  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2660  extracellular ligand-binding receptor  29.01 
 
 		 379 aa  117  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.51037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0508  extracellular ligand-binding receptor  30.15 
 
 		 403 aa  116  6e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000199641  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0963  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  28.7 
 
 		 517 aa  109  7.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1014  putative substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  28.33 
 
 		 370 aa  108  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0676014 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2079  Extracellular ligand-binding receptor  27.33 
 
 		 386 aa  108  1e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0953  extracellular ligand-binding receptor  30.81 
 
 		 426 aa  108  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1779  hypothetical protein  27 
 
 		 438 aa  106  6e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21341  hypothetical protein  29.06 
 
 		 342 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.551591 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3009  extracellular ligand-binding receptor  28.24 
 
 		 415 aa  101  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000545529  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1635  putative branched-chain amino acid ABC transporter  29.35 
 
 		 497 aa  101  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.314294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0531  extracellular ligand-binding receptor  24.62 
 
 		 386 aa  100  3e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000267349  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1617  extracellular ligand-binding receptor  27.32 
 
 		 384 aa  100  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.460677 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2845  extracellular ligand-binding receptor  25.27 
 
 		 388 aa  100  5e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2334  Extracellular ligand-binding receptor  25.27 
 
 		 388 aa  100  5e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.10397  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1661  hypothetical protein  31.17 
 
 		 430 aa  97.4  4e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.429909  normal  0.749387 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1690  extracellular ligand-binding receptor  26.32 
 
 		 382 aa  96.7  5e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.783096  normal  0.235233 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1828  hypothetical protein  27.86 
 
 		 539 aa  95.5  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00860183  normal  0.522901 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1004  Extracellular ligand-binding receptor  24.86 
 
 		 416 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1033  extracellular ligand-binding receptor  24.86 
 
 		 416 aa  93.6  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.344987  hitchhiker  0.000487812 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22980  amino acid-binding protein  29.27 
 
 		 434 aa  93.6  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0512293  normal  0.104714 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3484  putative Leu/Ile/Val-binding signal peptide protein  28.04 
 
 		 362 aa  93.2  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.705117  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3157  Extracellular ligand-binding receptor  28.04 
 
 		 362 aa  93.2  7e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.539823 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2750  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.93 
 
 		 425 aa  92.4  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0109739  normal  0.254921 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3597  extracellular ligand-binding receptor  24.22 
 
 		 398 aa  90.9  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1725  putative leucine/isoleucine/valine-binding protein precursor  28.4 
 
 		 393 aa  90.1  5e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0961  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  27.62 
 
 		 496 aa  89.7  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0108  Extracellular ligand-binding receptor  25.47 
 
 		 388 aa  89.4  1e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0479  extracellular ligand-binding receptor  25.21 
 
 		 390 aa  88.6  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3285  putative Leu/Ile/Val-binding signal peptide protein  27.79 
 
 		 365 aa  87.8  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.475932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1126  extracellular ligand-binding receptor  25.91 
 
 		 372 aa  86.7  6e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.293075 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>