More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0550 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0550  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 383 aa  772    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0334765 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0549  extracellular ligand-binding receptor  81.2 
 
 		 384 aa  622  1e-177  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0807314 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5732  extracellular ligand-binding receptor  62.53 
 
 		 403 aa  498  1e-140  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588725 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0065  Extracellular ligand-binding receptor  65.18 
 
 		 385 aa  464  9.999999999999999e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0045  extracellular ligand-binding receptor  65.18 
 
 		 385 aa  465  9.999999999999999e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.406138  normal  0.264074 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3153  extracellular ligand-binding receptor  33.94 
 
 		 398 aa  220  3.9999999999999997e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.154593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3111  Extracellular ligand-binding receptor  33.51 
 
 		 385 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2746  Extracellular ligand-binding receptor  33.51 
 
 		 385 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5396  extracellular ligand-binding receptor  34.22 
 
 		 378 aa  209  9e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3606  extracellular ligand-binding receptor  33.24 
 
 		 395 aa  202  9.999999999999999e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.316629 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5877  putative branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic component  32.31 
 
 		 379 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2864  Leu/Ile/Val-binding signal peptide protein  33.93 
 
 		 385 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.110112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3540  extracellular ligand-binding receptor  31.93 
 
 		 377 aa  195  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.229705  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0920  extracellular ligand-binding receptor  31.78 
 
 		 382 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4184  extracellular ligand-binding receptor  32.76 
 
 		 377 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.891545 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4060  extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 		 384 aa  189  8e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.255859 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0188  Extracellular ligand-binding receptor  33.15 
 
 		 386 aa  189  9e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03096  putative Leu/Ile/Val-binding lipoprotein transmembrane  33.06 
 
 		 386 aa  187  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0735365  normal  0.368181 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3001  extracellular ligand-binding receptor  30.92 
 
 		 392 aa  187  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0768  extracellular ligand-binding receptor  34.01 
 
 		 380 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.567193 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0335  Extracellular ligand-binding receptor  32.66 
 
 		 374 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4140  extracellular ligand-binding receptor  29.07 
 
 		 370 aa  175  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.544868 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3749  extracellular ligand-binding receptor  29.75 
 
 		 374 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.314564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3030  Extracellular ligand-binding receptor  29.75 
 
 		 374 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.394704  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1595  extracellular ligand-binding receptor  33.7 
 
 		 411 aa  169  9e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.523513  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4342  extracellular ligand-binding receptor  30.06 
 
 		 373 aa  167  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688129 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2059  Extracellular ligand-binding receptor  31.81 
 
 		 375 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0558608  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3029  Extracellular ligand-binding receptor  29.26 
 
 		 370 aa  166  5e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.518701  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3748  extracellular ligand-binding receptor  28.98 
 
 		 370 aa  166  5.9999999999999996e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0921  extracellular ligand-binding receptor  29.7 
 
 		 382 aa  164  3e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.589524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1615  extracellular ligand-binding receptor  32.41 
 
 		 411 aa  164  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.308041 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4876  extracellular ligand-binding receptor  30.66 
 
 		 378 aa  164  3e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.983185  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3815  extracellular ligand-binding receptor  28.49 
 
 		 368 aa  162  6e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4704  Extracellular ligand-binding receptor  30.23 
 
 		 371 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4703  Extracellular ligand-binding receptor  29.94 
 
 		 368 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0452  extracellular ligand-binding receptor  31.53 
 
 		 382 aa  156  7e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.128382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0443  Extracellular ligand-binding receptor  31.25 
 
 		 382 aa  154  2e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.363055  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3178  extracellular ligand-binding receptor  32.34 
 
 		 386 aa  154  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.677267  normal  0.56284 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2334  Extracellular ligand-binding receptor  30.39 
 
 		 388 aa  147  3e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.10397  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2845  extracellular ligand-binding receptor  30.39 
 
 		 388 aa  147  3e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0487  extracellular ligand-binding receptor  27.33 
 
 		 367 aa  146  6e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1131  extracellular ligand-binding receptor  29.81 
 
 		 385 aa  145  8.000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2010  Extracellular ligand-binding receptor  28.81 
 
 		 377 aa  143  4e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.467518  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1693  extracellular ligand-binding receptor  28.81 
 
 		 377 aa  143  4e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.502178  normal  0.251064 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1221  Extracellular ligand-binding receptor  31.29 
 
 		 472 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0653937 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5604  putative extracellular ligand-binding receptor  29.51 
 
 		 386 aa  139  6e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.236032 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1879  putative amino acids-binding transmembrane protein  29.97 
 
 		 383 aa  139  7.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.399388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2369  extracellular ligand-binding receptor  30.45 
 
 		 423 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.391884  normal  0.390615 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1020  twin-arginine translocation pathway signal  28.61 
 
 		 383 aa  139  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0712  putative lipoprotein  30.59 
 
 		 480 aa  138  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21341  hypothetical protein  29.84 
 
 		 342 aa  137  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.551591 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2765  extracellular ligand-binding receptor  31.37 
 
 		 408 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.094864  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3061  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  30.06 
 
 		 388 aa  134  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.664691  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0436  Extracellular ligand-binding receptor  29.53 
 
 		 379 aa  134  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3340  Extracellular ligand-binding receptor  29.36 
 
 		 394 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.157564  normal  0.523018 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0789  extracellular ligand-binding receptor  26.42 
 
 		 383 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.394286  normal  0.786087 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2993  Extracellular ligand-binding receptor  28.9 
 
 		 363 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2080  Extracellular ligand-binding receptor  29.2 
 
 		 383 aa  125  9e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1635  putative branched-chain amino acid ABC transporter  30.25 
 
 		 497 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.314294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0825  extracellular ligand-binding receptor  21.83 
 
 		 380 aa  122  9e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4031  extracellular ligand-binding receptor  30.06 
 
 		 381 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2083 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3128  Extracellular ligand-binding receptor  29.65 
 
 		 387 aa  120  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151168  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0974  Extracellular ligand-binding receptor  26.18 
 
 		 408 aa  120  3e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1040  Extracellular ligand-binding receptor  26.79 
 
 		 382 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.098407 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1725  putative leucine/isoleucine/valine-binding protein precursor  29.32 
 
 		 393 aa  119  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0531  extracellular ligand-binding receptor  26.51 
 
 		 386 aa  117  1.9999999999999998e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000267349  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0963  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  30.79 
 
 		 517 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0108  Extracellular ligand-binding receptor  25.95 
 
 		 388 aa  116  6e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1307  Extracellular ligand-binding receptor  26.39 
 
 		 425 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.168587  normal  0.0355411 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0681  extracellular ligand-binding receptor  24.87 
 
 		 382 aa  115  8.999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.35117  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2079  Extracellular ligand-binding receptor  24.14 
 
 		 386 aa  113  6e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0953  extracellular ligand-binding receptor  28.65 
 
 		 426 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0210  Extracellular ligand-binding receptor  27.32 
 
 		 592 aa  110  6e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.019468 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2392  extracellular ligand-binding receptor  27.58 
 
 		 380 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.152327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3504  extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 		 392 aa  108  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0407454  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0508  extracellular ligand-binding receptor  26.22 
 
 		 403 aa  108  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000199641  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0961  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  27.57 
 
 		 496 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0962  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  29.41 
 
 		 512 aa  107  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1126  extracellular ligand-binding receptor  30 
 
 		 372 aa  102  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.293075 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4409  extracellular ligand-binding receptor  24.87 
 
 		 383 aa  100  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4101  extracellular ligand-binding receptor  26.83 
 
 		 387 aa  99.4  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4388  extracellular ligand-binding receptor  25.21 
 
 		 372 aa  97.1  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.861875 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4935  Extracellular ligand-binding receptor  26.17 
 
 		 389 aa  97.1  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4371  extracellular ligand-binding receptor  24.51 
 
 		 391 aa  96.3  8e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3869  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  28.3 
 
 		 519 aa  96.3  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.222307 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4100  extracellular ligand-binding receptor  26.06 
 
 		 387 aa  95.5  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.199713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1690  extracellular ligand-binding receptor  26.09 
 
 		 382 aa  94.4  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.783096  normal  0.235233 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1661  hypothetical protein  30.14 
 
 		 430 aa  92.8  8e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.429909  normal  0.749387 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0707  extracellular ligand-binding receptor  27.64 
 
 		 382 aa  92.4  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0299  extracellular ligand-binding receptor  26.79 
 
 		 378 aa  91.3  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1828  hypothetical protein  26.25 
 
 		 539 aa  89.7  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00860183  normal  0.522901 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3009  extracellular ligand-binding receptor  26.51 
 
 		 415 aa  88.2  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000545529  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1617  extracellular ligand-binding receptor  25.56 
 
 		 384 aa  86.3  9e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.460677 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4590  Extracellular ligand-binding receptor  25.28 
 
 		 441 aa  84.7  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1004  Extracellular ligand-binding receptor  22.58 
 
 		 416 aa  83.6  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1033  extracellular ligand-binding receptor  22.58 
 
 		 416 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.344987  hitchhiker  0.000487812 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1428  Extracellular ligand-binding receptor  24.15 
 
 		 401 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0358  extracellular ligand-binding receptor  24.4 
 
 		 386 aa  81.6  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00342329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2733  Extracellular ligand-binding receptor  32.09 
 
 		 407 aa  80.5  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2660  extracellular ligand-binding receptor  25.27 
 
 		 379 aa  80.1  0.00000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.51037  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>