More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_1004 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_1033  extracellular ligand-binding receptor  99.28 
 
 		 416 aa  851    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.344987  hitchhiker  0.000487812 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1004  Extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 416 aa  856    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1307  Extracellular ligand-binding receptor  44.91 
 
 		 425 aa  368  1e-100  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.168587  normal  0.0355411 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0210  Extracellular ligand-binding receptor  36.19 
 
 		 592 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.019468 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0974  Extracellular ligand-binding receptor  35.82 
 
 		 408 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0712  putative lipoprotein  35.88 
 
 		 480 aa  225  1e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0953  extracellular ligand-binding receptor  35.05 
 
 		 426 aa  210  3e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1221  Extracellular ligand-binding receptor  34.03 
 
 		 472 aa  207  3e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0653937 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3153  extracellular ligand-binding receptor  34.13 
 
 		 398 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.154593  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0335  Extracellular ligand-binding receptor  35.16 
 
 		 374 aa  200  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1725  putative leucine/isoleucine/valine-binding protein precursor  34.2 
 
 		 393 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1615  extracellular ligand-binding receptor  30.69 
 
 		 411 aa  194  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.308041 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1595  extracellular ligand-binding receptor  31.59 
 
 		 411 aa  194  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.523513  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2369  extracellular ligand-binding receptor  34.31 
 
 		 423 aa  192  1e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.391884  normal  0.390615 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1661  hypothetical protein  36.39 
 
 		 430 aa  189  7e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.429909  normal  0.749387 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3111  Extracellular ligand-binding receptor  31.28 
 
 		 385 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2746  Extracellular ligand-binding receptor  31.28 
 
 		 385 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0961  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  32.53 
 
 		 496 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0768  extracellular ligand-binding receptor  32.72 
 
 		 380 aa  177  2e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.567193 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2079  Extracellular ligand-binding receptor  31.13 
 
 		 386 aa  176  5e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03096  putative Leu/Ile/Val-binding lipoprotein transmembrane  29.85 
 
 		 386 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0735365  normal  0.368181 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3178  extracellular ligand-binding receptor  30.33 
 
 		 386 aa  172  9e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.677267  normal  0.56284 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1131  extracellular ligand-binding receptor  34.06 
 
 		 385 aa  172  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3001  extracellular ligand-binding receptor  30.56 
 
 		 392 aa  170  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3869  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  31.54 
 
 		 519 aa  169  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.222307 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0825  extracellular ligand-binding receptor  30.37 
 
 		 380 aa  167  2e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0963  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  31.47 
 
 		 517 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2864  Leu/Ile/Val-binding signal peptide protein  29.41 
 
 		 385 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.110112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3540  extracellular ligand-binding receptor  31.31 
 
 		 377 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.229705  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2059  Extracellular ligand-binding receptor  30.08 
 
 		 375 aa  164  3e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0558608  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0962  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  31.22 
 
 		 512 aa  160  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5604  putative extracellular ligand-binding receptor  29.82 
 
 		 386 aa  159  7e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.236032 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0452  extracellular ligand-binding receptor  32.38 
 
 		 382 aa  159  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.128382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0443  Extracellular ligand-binding receptor  33.15 
 
 		 382 aa  158  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.363055  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4876  extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 		 378 aa  158  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.983185  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5877  putative branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic component  28.84 
 
 		 379 aa  155  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0920  extracellular ligand-binding receptor  28.49 
 
 		 382 aa  155  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1635  putative branched-chain amino acid ABC transporter  28.38 
 
 		 497 aa  153  5e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.314294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0921  extracellular ligand-binding receptor  28.46 
 
 		 382 aa  152  8.999999999999999e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.589524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4184  extracellular ligand-binding receptor  28.19 
 
 		 377 aa  152  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.891545 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1828  hypothetical protein  29.3 
 
 		 539 aa  149  6e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00860183  normal  0.522901 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0108  Extracellular ligand-binding receptor  30.15 
 
 		 388 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0487  extracellular ligand-binding receptor  27.93 
 
 		 367 aa  147  4.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4140  extracellular ligand-binding receptor  28.49 
 
 		 370 aa  145  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.544868 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3749  extracellular ligand-binding receptor  28.96 
 
 		 374 aa  144  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.314564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5396  extracellular ligand-binding receptor  28.76 
 
 		 378 aa  144  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3815  extracellular ligand-binding receptor  29.03 
 
 		 368 aa  144  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21341  hypothetical protein  28.41 
 
 		 342 aa  143  5e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.551591 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3030  Extracellular ligand-binding receptor  28.69 
 
 		 374 aa  143  7e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.394704  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3748  extracellular ligand-binding receptor  27.37 
 
 		 370 aa  137  4e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3029  Extracellular ligand-binding receptor  27.37 
 
 		 370 aa  137  5e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.518701  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4060  extracellular ligand-binding receptor  28.28 
 
 		 384 aa  135  9e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.255859 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4704  Extracellular ligand-binding receptor  28.42 
 
 		 371 aa  133  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0789  extracellular ligand-binding receptor  25.06 
 
 		 383 aa  127  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.394286  normal  0.786087 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4703  Extracellular ligand-binding receptor  25.61 
 
 		 368 aa  127  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4342  extracellular ligand-binding receptor  26.69 
 
 		 373 aa  126  8.000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688129 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3606  extracellular ligand-binding receptor  27.71 
 
 		 395 aa  125  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.316629 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3061  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  28.01 
 
 		 388 aa  123  5e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.664691  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0188  Extracellular ligand-binding receptor  25.97 
 
 		 386 aa  123  6e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1693  extracellular ligand-binding receptor  28.14 
 
 		 377 aa  119  7e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.502178  normal  0.251064 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2010  Extracellular ligand-binding receptor  28.14 
 
 		 377 aa  119  7.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.467518  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2993  Extracellular ligand-binding receptor  28.23 
 
 		 363 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3340  Extracellular ligand-binding receptor  28.23 
 
 		 394 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.157564  normal  0.523018 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0681  extracellular ligand-binding receptor  24.34 
 
 		 382 aa  117  5e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.35117  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2750  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.94 
 
 		 425 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0109739  normal  0.254921 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5732  extracellular ligand-binding receptor  25.53 
 
 		 403 aa  110  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588725 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0065  Extracellular ligand-binding receptor  26.32 
 
 		 385 aa  108  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0045  extracellular ligand-binding receptor  26.9 
 
 		 385 aa  108  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.406138  normal  0.264074 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4388  extracellular ligand-binding receptor  25.32 
 
 		 372 aa  107  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.861875 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0358  extracellular ligand-binding receptor  26.15 
 
 		 386 aa  107  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00342329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0299  extracellular ligand-binding receptor  24.39 
 
 		 378 aa  106  8e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1740  extracellular ligand-binding receptor  28.22 
 
 		 435 aa  100  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398941  normal  0.157953 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4409  extracellular ligand-binding receptor  24.26 
 
 		 383 aa  99.8  7e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3128  Extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 		 387 aa  96.7  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151168  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2765  extracellular ligand-binding receptor  24.79 
 
 		 408 aa  96.3  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.094864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2392  extracellular ligand-binding receptor  24.86 
 
 		 380 aa  95.1  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.152327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3559  extracellular ligand-binding receptor  27.62 
 
 		 418 aa  94.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0888701  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1040  Extracellular ligand-binding receptor  25.49 
 
 		 382 aa  94  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.098407 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4100  extracellular ligand-binding receptor  28.07 
 
 		 387 aa  93.2  7e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.199713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3339  extracellular ligand-binding receptor  27.14 
 
 		 410 aa  89.7  9e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.154352  normal  0.135284 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0531  extracellular ligand-binding receptor  23.1 
 
 		 386 aa  89.4  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000267349  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4371  extracellular ligand-binding receptor  23.45 
 
 		 391 aa  89.4  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0446  Extracellular ligand-binding receptor  26.32 
 
 		 388 aa  88.2  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2733  Extracellular ligand-binding receptor  21.55 
 
 		 407 aa  88.6  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0666  ABC transporter substrate-binding protein  25.36 
 
 		 410 aa  87.8  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.112312 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1594  Extracellular ligand-binding receptor  23.16 
 
 		 394 aa  87.4  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4935  Extracellular ligand-binding receptor  24.9 
 
 		 389 aa  87  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4244  Extracellular ligand-binding receptor  28.19 
 
 		 411 aa  86.7  8e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0550  extracellular ligand-binding receptor  22.58 
 
 		 383 aa  86.7  8e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0334765 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4101  extracellular ligand-binding receptor  25.31 
 
 		 387 aa  85.9  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4031  extracellular ligand-binding receptor  24.01 
 
 		 381 aa  85.9  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2083 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0549  extracellular ligand-binding receptor  23.46 
 
 		 384 aa  85.5  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0807314 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3504  extracellular ligand-binding receptor  23.9 
 
 		 392 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0407454  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7650  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  25.21 
 
 		 395 aa  84.3  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.394273 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7081  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic-binding protein  30.09 
 
 		 407 aa  83.6  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.220124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3937  extracellular ligand-binding receptor  25.53 
 
 		 397 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.108497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3583  extracellular ligand-binding receptor  25.53 
 
 		 397 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.160701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1898  extracellular ligand-binding receptor  25.07 
 
 		 411 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.193262 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2334  Extracellular ligand-binding receptor  23.01 
 
 		 388 aa  82  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.10397  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1020  twin-arginine translocation pathway signal  23.32 
 
 		 383 aa  82  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>