More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1307 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1307  Extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 425 aa  871    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.168587  normal  0.0355411 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1033  extracellular ligand-binding receptor  44.91 
 
 		 416 aa  362  9e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.344987  hitchhiker  0.000487812 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1004  Extracellular ligand-binding receptor  44.91 
 
 		 416 aa  361  1e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0210  Extracellular ligand-binding receptor  39.3 
 
 		 592 aa  266  5e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.019468 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0974  Extracellular ligand-binding receptor  38.48 
 
 		 408 aa  239  5e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1221  Extracellular ligand-binding receptor  39.9 
 
 		 472 aa  229  9e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0653937 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3153  extracellular ligand-binding receptor  35.26 
 
 		 398 aa  221  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.154593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2369  extracellular ligand-binding receptor  40.1 
 
 		 423 aa  218  1e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.391884  normal  0.390615 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1661  hypothetical protein  38.15 
 
 		 430 aa  205  1e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.429909  normal  0.749387 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0335  Extracellular ligand-binding receptor  38.39 
 
 		 374 aa  200  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3111  Extracellular ligand-binding receptor  32.25 
 
 		 385 aa  199  6e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2746  Extracellular ligand-binding receptor  32.25 
 
 		 385 aa  199  7e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0712  putative lipoprotein  36.6 
 
 		 480 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1131  extracellular ligand-binding receptor  34.77 
 
 		 385 aa  191  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3001  extracellular ligand-binding receptor  32.01 
 
 		 392 aa  184  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03096  putative Leu/Ile/Val-binding lipoprotein transmembrane  31.92 
 
 		 386 aa  182  7e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0735365  normal  0.368181 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2864  Leu/Ile/Val-binding signal peptide protein  32.47 
 
 		 385 aa  181  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.110112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3178  extracellular ligand-binding receptor  32.03 
 
 		 386 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.677267  normal  0.56284 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1725  putative leucine/isoleucine/valine-binding protein precursor  32.47 
 
 		 393 aa  178  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2079  Extracellular ligand-binding receptor  30.19 
 
 		 386 aa  178  2e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4876  extracellular ligand-binding receptor  37.61 
 
 		 378 aa  176  5e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.983185  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1615  extracellular ligand-binding receptor  33.68 
 
 		 411 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.308041 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3540  extracellular ligand-binding receptor  31.13 
 
 		 377 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.229705  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0953  extracellular ligand-binding receptor  31.13 
 
 		 426 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5604  putative extracellular ligand-binding receptor  35.46 
 
 		 386 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.236032 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0920  extracellular ligand-binding receptor  27.9 
 
 		 382 aa  173  5.999999999999999e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1595  extracellular ligand-binding receptor  33.42 
 
 		 411 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.523513  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0768  extracellular ligand-binding receptor  33.5 
 
 		 380 aa  172  9e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.567193 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0443  Extracellular ligand-binding receptor  34.51 
 
 		 382 aa  171  2e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.363055  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2059  Extracellular ligand-binding receptor  31.49 
 
 		 375 aa  171  3e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0558608  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0452  extracellular ligand-binding receptor  34.26 
 
 		 382 aa  169  6e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.128382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0825  extracellular ligand-binding receptor  30.03 
 
 		 380 aa  168  2e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4140  extracellular ligand-binding receptor  31.03 
 
 		 370 aa  161  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.544868 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1635  putative branched-chain amino acid ABC transporter  30.98 
 
 		 497 aa  159  7e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.314294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4342  extracellular ligand-binding receptor  32.24 
 
 		 373 aa  159  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688129 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0961  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  30.4 
 
 		 496 aa  158  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5877  putative branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic component  27.86 
 
 		 379 aa  157  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4060  extracellular ligand-binding receptor  31.84 
 
 		 384 aa  157  4e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.255859 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5396  extracellular ligand-binding receptor  29.44 
 
 		 378 aa  155  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0963  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  29.22 
 
 		 517 aa  155  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0921  extracellular ligand-binding receptor  30.06 
 
 		 382 aa  153  4e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.589524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3748  extracellular ligand-binding receptor  28.75 
 
 		 370 aa  152  8.999999999999999e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3029  Extracellular ligand-binding receptor  28.75 
 
 		 370 aa  152  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.518701  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3815  extracellular ligand-binding receptor  29.16 
 
 		 368 aa  151  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0487  extracellular ligand-binding receptor  28.93 
 
 		 367 aa  149  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0108  Extracellular ligand-binding receptor  30.15 
 
 		 388 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21341  hypothetical protein  28.37 
 
 		 342 aa  149  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.551591 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2010  Extracellular ligand-binding receptor  29.71 
 
 		 377 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.467518  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1693  extracellular ligand-binding receptor  29.44 
 
 		 377 aa  147  3e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.502178  normal  0.251064 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0962  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  30.21 
 
 		 512 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4184  extracellular ligand-binding receptor  30.11 
 
 		 377 aa  145  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.891545 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0188  Extracellular ligand-binding receptor  29.39 
 
 		 386 aa  145  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1828  hypothetical protein  29.46 
 
 		 539 aa  144  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00860183  normal  0.522901 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3869  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  28.46 
 
 		 519 aa  143  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.222307 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3061  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  29.78 
 
 		 388 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.664691  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3606  extracellular ligand-binding receptor  28.65 
 
 		 395 aa  139  8.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.316629 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4703  Extracellular ligand-binding receptor  27.69 
 
 		 368 aa  137  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3749  extracellular ligand-binding receptor  29.52 
 
 		 374 aa  136  7.000000000000001e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.314564  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4704  Extracellular ligand-binding receptor  26.67 
 
 		 371 aa  135  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3030  Extracellular ligand-binding receptor  29.26 
 
 		 374 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.394704  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2993  Extracellular ligand-binding receptor  29.66 
 
 		 363 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3340  Extracellular ligand-binding receptor  29.38 
 
 		 394 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.157564  normal  0.523018 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0065  Extracellular ligand-binding receptor  29.15 
 
 		 385 aa  133  6e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0045  extracellular ligand-binding receptor  28.86 
 
 		 385 aa  132  7.999999999999999e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.406138  normal  0.264074 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5732  extracellular ligand-binding receptor  27.17 
 
 		 403 aa  129  9.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588725 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0789  extracellular ligand-binding receptor  27.38 
 
 		 383 aa  118  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.394286  normal  0.786087 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0550  extracellular ligand-binding receptor  26.3 
 
 		 383 aa  115  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0334765 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0549  extracellular ligand-binding receptor  25.95 
 
 		 384 aa  114  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0807314 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2765  extracellular ligand-binding receptor  25.82 
 
 		 408 aa  114  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.094864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4031  extracellular ligand-binding receptor  28.41 
 
 		 381 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2083 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2334  Extracellular ligand-binding receptor  27.35 
 
 		 388 aa  109  8.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.10397  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2845  extracellular ligand-binding receptor  27.35 
 
 		 388 aa  109  9.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0681  extracellular ligand-binding receptor  25.87 
 
 		 382 aa  109  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.35117  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1020  twin-arginine translocation pathway signal  26.96 
 
 		 383 aa  107  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3504  extracellular ligand-binding receptor  26.67 
 
 		 392 aa  106  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0407454  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0299  extracellular ligand-binding receptor  26.09 
 
 		 378 aa  105  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0446  Extracellular ligand-binding receptor  31.8 
 
 		 388 aa  105  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1734  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  25.68 
 
 		 380 aa  104  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.534498  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1428  Extracellular ligand-binding receptor  28.21 
 
 		 401 aa  103  8e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4100  extracellular ligand-binding receptor  26.69 
 
 		 387 aa  101  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.199713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2130  extracellular ligand-binding receptor  24.8 
 
 		 380 aa  101  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.482674  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2248  Extracellular ligand-binding receptor  31.08 
 
 		 410 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3128  Extracellular ligand-binding receptor  25.66 
 
 		 387 aa  100  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151168  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2080  Extracellular ligand-binding receptor  27.18 
 
 		 383 aa  100  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1823  extracellular ligand-binding receptor  26.91 
 
 		 380 aa  100  7e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2189  Extracellular ligand-binding receptor  25.34 
 
 		 379 aa  99.8  9e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1740  extracellular ligand-binding receptor  28.57 
 
 		 435 aa  99.8  9e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398941  normal  0.157953 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0436  Extracellular ligand-binding receptor  26.99 
 
 		 379 aa  98.2  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0874  putative amino-acid ABC transport system, periplasmic binding protein  26.7 
 
 		 406 aa  99  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.034766  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4549  Extracellular ligand-binding receptor  24.47 
 
 		 393 aa  98.6  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4101  extracellular ligand-binding receptor  27.31 
 
 		 387 aa  97.8  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1879  putative amino acids-binding transmembrane protein  28.22 
 
 		 383 aa  97.8  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.399388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3009  extracellular ligand-binding receptor  29.76 
 
 		 415 aa  97.4  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000545529  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0680  extracellular ligand-binding receptor  25.85 
 
 		 399 aa  97.8  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0997  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.11 
 
 		 392 aa  97.4  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.489385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4371  extracellular ligand-binding receptor  25.62 
 
 		 391 aa  97.1  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2750  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.67 
 
 		 425 aa  97.1  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0109739  normal  0.254921 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2038  Extracellular ligand-binding receptor  25.58 
 
 		 379 aa  96.3  9e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000518039 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7651  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  25.59 
 
 		 415 aa  95.9  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.99279  normal  0.165016 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2392  extracellular ligand-binding receptor  25.47 
 
 		 380 aa  95.9  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.152327  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>