More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2765 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_2765  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
408 aa  825    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.094864  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3153  extracellular ligand-binding receptor  33.43 
 
 
398 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.154593  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3540  extracellular ligand-binding receptor  33.43 
 
 
377 aa  197  3e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.229705  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2059  Extracellular ligand-binding receptor  33.99 
 
 
375 aa  195  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0558608  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4342  extracellular ligand-binding receptor  35.16 
 
 
373 aa  193  4e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.688129 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4140  extracellular ligand-binding receptor  34.27 
 
 
370 aa  192  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.544868 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2746  Extracellular ligand-binding receptor  31.61 
 
 
385 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3111  Extracellular ligand-binding receptor  31.61 
 
 
385 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3001  extracellular ligand-binding receptor  33.62 
 
 
392 aa  184  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0768  extracellular ligand-binding receptor  33.05 
 
 
380 aa  181  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.567193 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2660  extracellular ligand-binding receptor  31.4 
 
 
379 aa  179  7e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.51037  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0188  Extracellular ligand-binding receptor  34.08 
 
 
386 aa  179  9e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3030  Extracellular ligand-binding receptor  33.06 
 
 
374 aa  176  8e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.394704  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0487  extracellular ligand-binding receptor  31.64 
 
 
367 aa  174  2.9999999999999996e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3749  extracellular ligand-binding receptor  32.78 
 
 
374 aa  173  5e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.314564  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5877  putative branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic component  30.29 
 
 
379 aa  172  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0920  extracellular ligand-binding receptor  31.18 
 
 
382 aa  171  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5732  extracellular ligand-binding receptor  31.13 
 
 
403 aa  171  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.588725 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3748  extracellular ligand-binding receptor  31.15 
 
 
370 aa  169  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178822  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3029  Extracellular ligand-binding receptor  31.15 
 
 
370 aa  168  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.518701  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5396  extracellular ligand-binding receptor  29.43 
 
 
378 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2864  Leu/Ile/Val-binding signal peptide protein  32.31 
 
 
385 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.110112  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3815  extracellular ligand-binding receptor  31.73 
 
 
368 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4876  extracellular ligand-binding receptor  32 
 
 
378 aa  162  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.983185  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1020  twin-arginine translocation pathway signal  31.16 
 
 
383 aa  158  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4184  extracellular ligand-binding receptor  29.49 
 
 
377 aa  155  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.891545 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0045  extracellular ligand-binding receptor  33.15 
 
 
385 aa  155  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.406138  normal  0.264074 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4060  extracellular ligand-binding receptor  30.42 
 
 
384 aa  154  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.255859 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4388  extracellular ligand-binding receptor  27.79 
 
 
372 aa  155  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.861875 
 
 
-
 
NC_003296  RS03096  putative Leu/Ile/Val-binding lipoprotein transmembrane  28.97 
 
 
386 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0735365  normal  0.368181 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2010  Extracellular ligand-binding receptor  30.85 
 
 
377 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.467518  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1693  extracellular ligand-binding receptor  30.85 
 
 
377 aa  153  5e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.502178  normal  0.251064 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0065  Extracellular ligand-binding receptor  32.87 
 
 
385 aa  152  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0549  extracellular ligand-binding receptor  30.08 
 
 
384 aa  151  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0807314 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4703  Extracellular ligand-binding receptor  31.41 
 
 
368 aa  150  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4704  Extracellular ligand-binding receptor  32.39 
 
 
371 aa  149  9e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3061  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  28.94 
 
 
388 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.664691  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3606  extracellular ligand-binding receptor  29.94 
 
 
395 aa  148  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.316629 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3178  extracellular ligand-binding receptor  29.71 
 
 
386 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.677267  normal  0.56284 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0921  extracellular ligand-binding receptor  30.52 
 
 
382 aa  147  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.589524  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1431  putative substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  29.15 
 
 
380 aa  147  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.21554 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0335  Extracellular ligand-binding receptor  28.74 
 
 
374 aa  145  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3340  Extracellular ligand-binding receptor  28.74 
 
 
394 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.157564  normal  0.523018 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1040  Extracellular ligand-binding receptor  31.09 
 
 
382 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.098407 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4371  extracellular ligand-binding receptor  29.66 
 
 
391 aa  140  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2993  Extracellular ligand-binding receptor  28.74 
 
 
363 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4409  extracellular ligand-binding receptor  28.81 
 
 
383 aa  139  8.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2392  extracellular ligand-binding receptor  28.65 
 
 
380 aa  138  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.152327  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0550  extracellular ligand-binding receptor  30.94 
 
 
383 aa  137  3.0000000000000003e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0334765 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2080  Extracellular ligand-binding receptor  30.06 
 
 
383 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0443  Extracellular ligand-binding receptor  30.11 
 
 
382 aa  134  3e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.363055  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0452  extracellular ligand-binding receptor  30.11 
 
 
382 aa  133  6.999999999999999e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.128382  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4031  extracellular ligand-binding receptor  31.9 
 
 
381 aa  133  6.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.2083 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1014  putative substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  28.45 
 
 
370 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0676014 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1221  Extracellular ligand-binding receptor  30.41 
 
 
472 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0653937 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1879  putative amino acids-binding transmembrane protein  28.87 
 
 
383 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.399388  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0364  putative substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  26.77 
 
 
390 aa  130  6e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.194587 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0712  putative lipoprotein  26.94 
 
 
480 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1131  extracellular ligand-binding receptor  28.85 
 
 
385 aa  127  4.0000000000000003e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5604  putative extracellular ligand-binding receptor  27.83 
 
 
386 aa  125  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.236032 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2369  extracellular ligand-binding receptor  29.57 
 
 
423 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.391884  normal  0.390615 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3147  hypothetical protein  27.53 
 
 
382 aa  120  6e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.303514 
 
 
-
 
NC_003296  RS00418  hypothetical protein  27.73 
 
 
380 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.303098  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1595  extracellular ligand-binding receptor  28.24 
 
 
411 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.523513  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1615  extracellular ligand-binding receptor  26.68 
 
 
411 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.308041 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1307  Extracellular ligand-binding receptor  25.82 
 
 
425 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.168587  normal  0.0355411 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0974  Extracellular ligand-binding receptor  26.16 
 
 
408 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3128  Extracellular ligand-binding receptor  27.46 
 
 
387 aa  111  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151168  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1690  extracellular ligand-binding receptor  25.53 
 
 
382 aa  111  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.783096  normal  0.235233 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0108  Extracellular ligand-binding receptor  24.85 
 
 
388 aa  106  6e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2334  Extracellular ligand-binding receptor  26.2 
 
 
388 aa  106  7e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.10397  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21341  hypothetical protein  25.57 
 
 
342 aa  106  8e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.551591 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2845  extracellular ligand-binding receptor  26.2 
 
 
388 aa  106  8e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0825  extracellular ligand-binding receptor  21.12 
 
 
380 aa  105  1e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1725  putative leucine/isoleucine/valine-binding protein precursor  27.98 
 
 
393 aa  105  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0436  Extracellular ligand-binding receptor  27.3 
 
 
379 aa  105  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0789  extracellular ligand-binding receptor  24.73 
 
 
383 aa  103  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.394286  normal  0.786087 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0531  extracellular ligand-binding receptor  29.01 
 
 
386 aa  103  6e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000267349  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0299  extracellular ligand-binding receptor  25.67 
 
 
378 aa  101  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0681  extracellular ligand-binding receptor  24.14 
 
 
382 aa  100  7e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.35117  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1594  Extracellular ligand-binding receptor  23.96 
 
 
394 aa  98.6  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0508  extracellular ligand-binding receptor  26.07 
 
 
403 aa  94.7  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000199641  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0963  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  25.78 
 
 
517 aa  95.1  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0962  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  26.99 
 
 
512 aa  94.7  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1004  Extracellular ligand-binding receptor  24.23 
 
 
416 aa  93.6  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1033  extracellular ligand-binding receptor  24.23 
 
 
416 aa  93.6  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.344987  hitchhiker  0.000487812 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1635  putative branched-chain amino acid ABC transporter  25.66 
 
 
497 aa  93.6  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.314294  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0953  extracellular ligand-binding receptor  29.14 
 
 
426 aa  92.8  9e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1126  extracellular ligand-binding receptor  27.61 
 
 
372 aa  92.8  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.293075 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1617  extracellular ligand-binding receptor  26.36 
 
 
384 aa  90.1  7e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.460677 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0210  Extracellular ligand-binding receptor  26.23 
 
 
592 aa  90.1  7e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.019468 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2750  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.45 
 
 
425 aa  87.8  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0109739  normal  0.254921 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2079  Extracellular ligand-binding receptor  22.19 
 
 
386 aa  86.7  8e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3009  extracellular ligand-binding receptor  25.07 
 
 
415 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000545529  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2733  Extracellular ligand-binding receptor  22.74 
 
 
407 aa  85.5  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0707  extracellular ligand-binding receptor  22.91 
 
 
382 aa  84  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142871  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1739  extracellular ligand-binding receptor  24.48 
 
 
410 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.152869 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3869  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  26.14 
 
 
519 aa  82.4  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.222307 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0961  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  25.14 
 
 
496 aa  81.6  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1452  ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  25.32 
 
 
458 aa  81.6  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.691281  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>