More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4876 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4876  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 378 aa  765    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.983185  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0768  extracellular ligand-binding receptor  73.07 
 
 		 380 aa  542  1e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.567193 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0443  Extracellular ligand-binding receptor  69.5 
 
 		 382 aa  495  1e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.363055  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0452  extracellular ligand-binding receptor  69.23 
 
 		 382 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.128382  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0335  Extracellular ligand-binding receptor  66.93 
 
 		 374 aa  489  1e-137  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1131  extracellular ligand-binding receptor  60.21 
 
 		 385 aa  444  1e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2746  Extracellular ligand-binding receptor  47.86 
 
 		 385 aa  352  5e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3111  Extracellular ligand-binding receptor  47.59 
 
 		 385 aa  351  1e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2864  Leu/Ile/Val-binding signal peptide protein  49.86 
 
 		 385 aa  333  4e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.110112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3153  extracellular ligand-binding receptor  46.44 
 
 		 398 aa  322  8e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.154593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3540  extracellular ligand-binding receptor  45.33 
 
 		 377 aa  312  6.999999999999999e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.229705  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3001  extracellular ligand-binding receptor  44.6 
 
 		 392 aa  301  2e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03096  putative Leu/Ile/Val-binding lipoprotein transmembrane  41.88 
 
 		 386 aa  296  3e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0735365  normal  0.368181 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0920  extracellular ligand-binding receptor  43.38 
 
 		 382 aa  275  9e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4184  extracellular ligand-binding receptor  40.46 
 
 		 377 aa  257  2e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.891545 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0921  extracellular ligand-binding receptor  40.11 
 
 		 382 aa  256  5e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.589524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3606  extracellular ligand-binding receptor  41.29 
 
 		 395 aa  250  3e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.316629 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0789  extracellular ligand-binding receptor  36.65 
 
 		 383 aa  245  6.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.394286  normal  0.786087 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0712  putative lipoprotein  41.08 
 
 		 480 aa  241  1e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2369  extracellular ligand-binding receptor  40.79 
 
 		 423 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.391884  normal  0.390615 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1221  Extracellular ligand-binding receptor  41.69 
 
 		 472 aa  239  4e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0653937 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5877  putative branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic component  36.77 
 
 		 379 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3178  extracellular ligand-binding receptor  38.29 
 
 		 386 aa  233  5e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.677267  normal  0.56284 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2059  Extracellular ligand-binding receptor  37.89 
 
 		 375 aa  231  1e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0558608  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5396  extracellular ligand-binding receptor  37.93 
 
 		 378 aa  227  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0188  Extracellular ligand-binding receptor  36.62 
 
 		 386 aa  221  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4060  extracellular ligand-binding receptor  34.48 
 
 		 384 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.255859 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5604  putative extracellular ligand-binding receptor  38 
 
 		 386 aa  219  8.999999999999998e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.236032 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0681  extracellular ligand-binding receptor  35.43 
 
 		 382 aa  215  9.999999999999999e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.35117  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0974  Extracellular ligand-binding receptor  36.26 
 
 		 408 aa  210  3e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0487  extracellular ligand-binding receptor  34.37 
 
 		 367 aa  210  4e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0953  extracellular ligand-binding receptor  38.46 
 
 		 426 aa  208  1e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3815  extracellular ligand-binding receptor  33.6 
 
 		 368 aa  202  6e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1595  extracellular ligand-binding receptor  39.16 
 
 		 411 aa  202  6e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.523513  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1615  extracellular ligand-binding receptor  38.86 
 
 		 411 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.308041 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4704  Extracellular ligand-binding receptor  35.51 
 
 		 371 aa  200  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4140  extracellular ligand-binding receptor  33.51 
 
 		 370 aa  199  6e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.544868 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4342  extracellular ligand-binding receptor  35.41 
 
 		 373 aa  199  7e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688129 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5732  extracellular ligand-binding receptor  33.05 
 
 		 403 aa  198  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588725 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3030  Extracellular ligand-binding receptor  33.88 
 
 		 374 aa  197  3e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.394704  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1725  putative leucine/isoleucine/valine-binding protein precursor  37.54 
 
 		 393 aa  197  3e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3749  extracellular ligand-binding receptor  33.61 
 
 		 374 aa  195  1e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.314564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21341  hypothetical protein  36.24 
 
 		 342 aa  193  5e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.551591 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3748  extracellular ligand-binding receptor  33.71 
 
 		 370 aa  192  7e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3029  Extracellular ligand-binding receptor  33.71 
 
 		 370 aa  192  1e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.518701  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0707  extracellular ligand-binding receptor  34.65 
 
 		 382 aa  192  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1307  Extracellular ligand-binding receptor  37.91 
 
 		 425 aa  191  2e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.168587  normal  0.0355411 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2010  Extracellular ligand-binding receptor  33.52 
 
 		 377 aa  186  5e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.467518  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1693  extracellular ligand-binding receptor  33.52 
 
 		 377 aa  186  6e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.502178  normal  0.251064 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0108  Extracellular ligand-binding receptor  33.13 
 
 		 388 aa  186  6e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2079  Extracellular ligand-binding receptor  33.43 
 
 		 386 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0961  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  35.62 
 
 		 496 aa  179  8e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4031  extracellular ligand-binding receptor  33.62 
 
 		 381 aa  179  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2083 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4703  Extracellular ligand-binding receptor  31.14 
 
 		 368 aa  177  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0045  extracellular ligand-binding receptor  32.56 
 
 		 385 aa  176  8e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.406138  normal  0.264074 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0065  Extracellular ligand-binding receptor  32.38 
 
 		 385 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0550  extracellular ligand-binding receptor  30.66 
 
 		 383 aa  175  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0334765 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1004  Extracellular ligand-binding receptor  34.35 
 
 		 416 aa  173  5e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1033  extracellular ligand-binding receptor  34.35 
 
 		 416 aa  172  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.344987  hitchhiker  0.000487812 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2765  extracellular ligand-binding receptor  32 
 
 		 408 aa  172  9e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.094864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2080  Extracellular ligand-binding receptor  33.42 
 
 		 383 aa  172  9e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0963  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  34.15 
 
 		 517 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0825  extracellular ligand-binding receptor  28.81 
 
 		 380 aa  168  2e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1879  putative amino acids-binding transmembrane protein  33.24 
 
 		 383 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.399388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0549  extracellular ligand-binding receptor  29.77 
 
 		 384 aa  166  8e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0807314 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3128  Extracellular ligand-binding receptor  32.39 
 
 		 387 aa  165  9e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151168  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0436  Extracellular ligand-binding receptor  31.76 
 
 		 379 aa  165  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1635  putative branched-chain amino acid ABC transporter  35.36 
 
 		 497 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.314294  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3061  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  32.78 
 
 		 388 aa  162  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.664691  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0299  extracellular ligand-binding receptor  31.53 
 
 		 378 aa  159  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2993  Extracellular ligand-binding receptor  33.62 
 
 		 363 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2334  Extracellular ligand-binding receptor  31.56 
 
 		 388 aa  157  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.10397  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2845  extracellular ligand-binding receptor  31.56 
 
 		 388 aa  157  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3340  Extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 		 394 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.157564  normal  0.523018 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1020  twin-arginine translocation pathway signal  30.86 
 
 		 383 aa  156  6e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0962  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  33.15 
 
 		 512 aa  155  8e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0210  Extracellular ligand-binding receptor  37.39 
 
 		 592 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.019468 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2392  extracellular ligand-binding receptor  31.18 
 
 		 380 aa  152  7e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.152327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4371  extracellular ligand-binding receptor  29.44 
 
 		 391 aa  152  7e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4409  extracellular ligand-binding receptor  31.22 
 
 		 383 aa  152  7e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1040  Extracellular ligand-binding receptor  29.97 
 
 		 382 aa  152  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.098407 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0364  putative substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  30.71 
 
 		 390 aa  145  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.194587 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4388  extracellular ligand-binding receptor  29.27 
 
 		 372 aa  144  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.861875 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1828  hypothetical protein  32.3 
 
 		 539 aa  140  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00860183  normal  0.522901 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3869  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  31.25 
 
 		 519 aa  139  7e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.222307 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0358  extracellular ligand-binding receptor  29.32 
 
 		 386 aa  136  8e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00342329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4100  extracellular ligand-binding receptor  29.5 
 
 		 387 aa  131  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.199713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1661  hypothetical protein  35.51 
 
 		 430 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.429909  normal  0.749387 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4101  extracellular ligand-binding receptor  28.65 
 
 		 387 aa  130  4.0000000000000003e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3504  extracellular ligand-binding receptor  28.38 
 
 		 392 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0407454  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1014  putative substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  27.68 
 
 		 370 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0676014 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0446  Extracellular ligand-binding receptor  30.41 
 
 		 388 aa  119  6e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0508  extracellular ligand-binding receptor  26.71 
 
 		 403 aa  119  7.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000199641  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4935  Extracellular ligand-binding receptor  26.43 
 
 		 389 aa  118  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1617  extracellular ligand-binding receptor  26.63 
 
 		 384 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.460677 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2750  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.05 
 
 		 425 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0109739  normal  0.254921 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1690  extracellular ligand-binding receptor  25.2 
 
 		 382 aa  113  4.0000000000000004e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.783096  normal  0.235233 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2660  extracellular ligand-binding receptor  29.89 
 
 		 379 aa  113  5e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.51037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0531  extracellular ligand-binding receptor  26.23 
 
 		 386 aa  112  8.000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000267349  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1431  putative substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  27.35 
 
 		 380 aa  110  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.21554 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>